TRIP13对TNBC细胞增殖和迁移的影响
验证TRIP13在TNBC细胞中的功能作用。
在MDA-MB-231和MDA-MB-453细胞中通过sgRNA敲除TRIP13,利用MTT、Transwell、伤口愈合实验检测细胞活力、增殖和迁移能力。
Bardoxolone displays potent activity against triple negative breast cancer by inhibiting the TRIP13/STAT3 circuit.
包含细胞实验(增殖、迁移、凋亡)、分子机制(ChIP、荧光素酶报告基因、Western blot)、体内异种移植模型及药物筛选,具备多层次功能与机制验证。
MDA-MB-231细胞系 MDA-MB-453细胞系 4T1细胞系 MDA-MB-231异种移植裸鼠模型 4T1同系BALB/c小鼠模型
TRIP13敲除或过表达对TNBC细胞增殖、迁移的影响(如MTT、Transwell、伤口愈合实验) STAT3激活及下游基因(Vimentin, PIM2, Cyclin D2)的表达变化 STAT3与TRIP13启动子结合的特异性(SRE2序列5'-CTGCCCGAAAT-3') CDDO处理浓度(0-4 μM)及对STAT3磷酸化、TRIP13表达、PARP裂解的影响 动物模型中CDDO给药剂量为10 mg/kg,每日给药,连续7天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TRIP13在TNBC细胞中的功能作用。
在MDA-MB-231和MDA-MB-453细胞中通过sgRNA敲除TRIP13,利用MTT、Transwell、伤口愈合实验检测细胞活力、增殖和迁移能力。
探究TRIP13对STAT家族成员的影响。
在TNBC细胞中过表达TRIP13或敲除TRIP13,通过Western blot检测STAT1-5的磷酸化水平及STAT3下游基因表达。
验证STAT3是否直接结合TRIP13启动子并调控其表达。
利用JASPAR预测STAT3结合位点,通过ChIP实验验证STAT3结合TRIP13启动子,构建荧光素酶报告基因载体验证SRE2的功能,并通过过表达/敲低STAT3检测TRIP13表达。
寻找能抑制TRIP13/STAT3回路的化合物。
利用表达TRIP13和STAT3.Luci的HEK293T细胞筛选FDA批准药物和天然产物库,通过荧光素酶活性检测和Western blot验证候选化合物对STAT3激活和TRIP13表达的影响。
验证CDDO在TNBC细胞中对TRIP13/STAT3轴的抑制作用。
用CDDO处理TNBC细胞,检测STAT3磷酸化、TRIP13表达、下游基因和PARP裂解;过表达TRIP13后检测CDDO效应是否被逆转。
评估CDDO对TNBC细胞恶性表型的抑制作用。
CDDO处理后,通过MTT、EdU、Transwell、伤口愈合、克隆形成和Annexin V/PI染色流式检测细胞活力、增殖、迁移、克隆形成和凋亡。
评估CDDO在体内的抗肿瘤效果和安全性。
建立MDA-MB-231和4T1异种移植模型,给予CDDO(10 mg/kg)或载体处理,监测肿瘤生长、体重,并通过Western blot检测肿瘤组织中TRIP13/STAT3信号通路蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | TransGen Biotech | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 质粒构建 | pcDNA3.1载体 | -- | -- |
| pGL6荧光素酶报告载体 | -- | -- | |
| Mut Express MultiS快速突变试剂盒V2 | Vazyme Biotech | C215-01 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 抗TRIP13抗体 | Proteintech | 19602-1-AP | |
| 抗PARP抗体 | Proteintech | 13371-1-AP | |
| 抗波形蛋白抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| 抗Myc标签抗体 | Proteintech | 16286-1-AP | |
| 抗细胞周期蛋白D2抗体 | Proteintech | 10934-1-AP | |
| 抗STAT1抗体 | Proteintech | 10144-2-AP | |
| 抗STAT2抗体 | Proteintech | 16674-1-AP | |
| 抗STAT3抗体 | Proteintech | 10253-2-AP | |
| 抗STAT4抗体 | Proteintech | 13028-1-AP | |
| 抗STAT5抗体 | Proteintech | 13179-1-AP | |
| 抗磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 8826 | |
| 抗磷酸化STAT2抗体 | Cell Signaling Technology | 88410 | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9131 | |
| 抗磷酸化STAT4抗体 | Cell Signaling Technology | 4134 | |
| 抗磷酸化STAT5抗体 | Cell Signaling Technology | 4322 | |
| 抗PIM-2抗体 | Cell Signaling Technology | 4730 | |
| 药物筛选 | 巴多索隆 | MedChemExpress | HY-14909 |
| 醋戊曲酯 | MedChemExpress | HY-N2070 | |
| 布南色林 | MedChemExpress | HY-1357 | |
| 阿糖胞苷 | MedChemExpress | 147-94-4 | |
| 甲氨蝶呤 | MedChemExpress | HY-14519 | |
| 夹竹桃苷 | MedChemExpress | HY-13719 | |
| 罗米地辛 | MedChemExpress | HY-15149 | |
| 细胞活力检测 | MTT | Beyotime | ST1537 |
| RNA提取 | RNAeasy动物RNA提取试剂盒 | Beyotime | R0027 |
| 逆转录PCR | TransScript一步法去除基因组DNA和cDNA合成预混液 | Transgen | AT311-02 |
| Transwell实验 | Transwell小室 | NEST Biotechnology | 724301 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Beyotime | C1062S |
| ChIP实验 | ChIP检测试剂盒 | Beyotime | P2078 |
| 荧光素酶报告实验 | Bright-Glo荧光素酶底物 | Promega | E2620 |
| EdU实验 | Cell-Light EdU Apollo567体外试剂盒 | Ribo Biotechnologies | C10310-1 |
| 体内实验 | 基质胶 | Corning | 354262 |
| Western blot | 图像扫描仪 | Tannon Biotechnologies | -- |
| 荧光素酶报告实验 | 多功能酶标仪 | Molecular Devices | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(MDA-MB-231、MDA-MB-453来源于ATCC,4T1来源于Pricella) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 基因敲除 | sgRNA序列(sgTRIP13#1: CACGTGGACCGTTGGCGACT, sgTRIP13#2: CAATCATCTCTAGCTCTCGG) 阅读提示:Methods: Short hairpin RNAs and single-guided RNAs |
| STAT3敲低 | shRNA序列(5'-GCAACAGATTGCCTGCATTGGT-3' 和 5'-GCACAATCTACGAAGAATCAAT-3') 阅读提示:Methods: Short hairpin RNAs and single-guided RNAs |
| 药物处理 | CDDO浓度(体外0-4 μM),处理时间(24小时) 阅读提示:Results: CDDO suppresses... 和 CDDO inhibits...; Methods: Cell viability assay等 |
| 体内实验 | 细胞接种量(MDA-MB-231: 5×10^6,4T1: 4×10^6),CDDO剂量(10 mg/kg),给药方式(腹腔注射),给药时长(7天) 阅读提示:Methods: Xenografts in mice |