评估moroidin对GBM细胞的细胞毒性
确定非细胞毒性浓度范围,为后续实验提供安全剂量
使用CCK-8法检测不同浓度moroidin(0、2.5、5、10、20、40、80 μmol/L)处理U87和U251细胞24 h和48 h后的细胞活力,并观察细胞形态变化。
Cyclopeptide moroidin inhibits vasculogenic mimicry formed by glioblastoma cells via regulating β-catenin activation and EMT pathways.
包含体外细胞实验(CCK8、划痕、Transwell、管形成、Western blot、qRT-PCR、免疫荧光)及转录组分析(RNA-seq、GO/GSEA),并利用β-catenin激动剂SKL2001进行功能回复验证,但缺乏体内动物模型验证。
人胶质母细胞瘤细胞系U87 人胶质母细胞瘤细胞系U251 人脐静脉内皮细胞系HUVEC
moroidin处理浓度(0、0.5、1、2 μmol/L) 处理时间(24 h或48 h) 检测指标(细胞活力、迁移、管形成、EMT标志物、β-catenin激活) SKL2001(β-catenin激动剂)处理浓度20 μmol/L及时间12 h 统计分析(one-way或two-way ANOVA,Dunnett事后检验,P<0.05)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定非细胞毒性浓度范围,为后续实验提供安全剂量
使用CCK-8法检测不同浓度moroidin(0、2.5、5、10、20、40、80 μmol/L)处理U87和U251细胞24 h和48 h后的细胞活力,并观察细胞形态变化。
验证moroidin能否在亚致死浓度下抑制细胞迁移
采用细胞划痕实验和Transwell实验检测不同浓度moroidin(0、0.5、1、2 μmol/L)处理24 h后U87和U251细胞的迁移能力。
直接测定moroidin对GBM细胞在Matrigel上形成管状结构(VM)的抑制作用
在Matrigel上进行管形成实验,评估不同浓度moroidin(0、0.5、1、2 μmol/L)处理24 h后U87和U251细胞的成管能力,并检测VM标志物α-SMA和MMP-9表达以及MMP2、MMP9、MMP14的mRNA水平。
通过转录组分析探究moroidin作用的潜在分子通路
对moroidin(2 μmol/L)处理24 h的U87细胞进行RNA测序,并进行GO、GSEA和STRING蛋白相互作用分析,发现EMT相关基因下调。
验证moroidin是否通过抑制EMT过程发挥作用
Western blot检测不同浓度moroidin(0、0.5、1、2 μmol/L)处理24 h后U87和U251细胞中EMT相关蛋白(N-cadherin、vimentin、SNAIL、TWIST、E-cadherin)的表达变化。
明确moroidin抑制EMT的上游机制
Western blot检测moroidin处理后U87和U251细胞中ERK、p-ERK、active β-catenin和β-catenin的表达,免疫荧光检测β-catenin的亚细胞定位。
验证β-catenin通路在moroidin抑制VM中的关键作用
使用β-catenin激动剂SKL2001(20 μmol/L预处理12 h)联合moroidin(2 μmol/L,24 h)处理U87细胞,检测管形成能力和相关蛋白(active β-catenin、N-cadherin、vimentin、MMP-9)表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Moroidin | -- | -- |
| 药物溶解 | 二甲基亚砜 | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Biosharp | -- |
| 迁移实验 | Transwell小室(8 μm孔径) | Corning | -- |
| 固定和染色 | 结晶紫 | -- | -- |
| 管形成实验 | Matrigel基质胶(生长因子减少型) | Corning | -- |
| Western blot | Lowry蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ECL化学发光试剂盒 | Biological Industries | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| qPCR cDNA合成SuperMix试剂盒 | Vazyme | -- | |
| SYBR Green预混液 | Vazyme | -- | |
| ABI 7500 Fast实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA-seq | RNAiso Plus | Takara | -- |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| AMPure XP系统 | Beckman Coulter | -- | |
| NovaSeq 6000平台 | Illumina | -- | |
| Western blot | GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 |
| N-cadherin(N-钙黏蛋白)抗体 | Cell Signaling Technology | 13116 | |
| β-catenin(β-连环蛋白)抗体 | Cell Signaling Technology | 8480 | |
| Vimentin(波形蛋白)抗体 | Cell Signaling Technology | 5741 | |
| SNAIL抗体 | Cell Signaling Technology | 3879 | |
| ERK(细胞外信号调节激酶)抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| p-ERK(磷酸化细胞外信号调节激酶)抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| α-SMA(α-平滑肌肌动蛋白)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53142 | |
| E-cadherin(E-钙黏蛋白)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-21791 | |
| TWIST抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc81417 | |
| 抗活化β-catenin抗体 | Millipore | 05-665 | |
| 抗MMP-9抗体 | Proteintech | 27306-1-AP | |
| 细胞培养 | U87细胞系 | ATCC | -- |
| U251细胞系 | Procell Life Science Technology Co., Ltd. | -- | |
| HUVEC细胞系 | ATCC | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100(聚乙二醇辛基苯基醚) | -- | -- |
| DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚) | -- | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Carl Zeiss Meditec | -- | |
| 划痕实验 | 显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| Western blot | 脱脂牛奶 | -- | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物处理和细胞活力检测 | moroidin浓度梯度(0、2.5、5、10、20、40、80 μmol/L),处理时间24 h和48 h,细胞接种密度(3000/孔),CCK-8孵育时间(37℃ 1 h)和检测波长(450 nm) 阅读提示:Materials and methods - Chemicals and reagents; Cell Counting Kit-8 (CCK8) assay; Figure 1 legend |
| 迁移实验 | moroidin浓度(0、0.5、1、2 μmol/L),处理时间24 h,划痕后观察时间点(0和24 h),Transwell上室接种细胞数量,下室培养时间24 h,基质胶包被浓度(150 μL/well) 阅读提示:Materials and methods - Cell scratch assay; Transwell assay; Figure 2 legend |
| VM形成实验 | Matrigel包被体积(150 μL/孔),moroidin浓度(0、0.5、1、2 μmol/L),处理时间24 h,细胞在Matrigel上培养时间8 h,管形成定量指标(meshes、master segments) 阅读提示:Materials and methods - Tube formation assay; Figure 3 legend |
| Western blot | moroidin浓度(0、0.5、1、2 μmol/L),处理时间24 h,抗体稀释比(如1:1000),蛋白上样量,内参GAPDH 阅读提示:Materials and methods - Western blotting; Figure 3C, 3E, 4D-4G, 5A-5D, 6C legends |
| RT-qPCR | RNA提取方法,cDNA合成试剂盒,PCR循环条件,引物序列(Table 1),内参GAPDH,2^-ΔΔCt法 阅读提示:Materials and methods - Real-time reverse transcription PCR; Table 1 |
| 转录组分析 | moroidin浓度(2 μmol/L)、处理时间24 h,测序平台(NovaSeq 6000),差异基因筛选阈值(|log2FC|>1,P<0.05),GSEA参数(MSigDB gene sets),GO分析软件 阅读提示:Materials and methods - RNA-sequence and data analysis; Figure 4A-4B |
| β-catenin激活回复实验 | SKL2001浓度(20 μmol/L)、处理时间(12 h),moroidin浓度(2 μmol/L)、处理时间(24 h),处理顺序(先SKL2001预处理再moroidin),管形成检测时间点 阅读提示:Materials and methods - Tube formation assay; Figure 6 legend |