动物模型建立与BAP31敲低验证
构建脓毒症动物模型并验证内皮细胞特异性BAP31敲低是否成功。
使用6-8周龄C57BL/6J雄性小鼠,通过CLP建立脓毒症模型,对照组行假手术;利用Cre/LoxP系统在内皮细胞中敲低BAP31,并通过Western blot和PCR验证。
BAP31 Promotes Adhesion Between Endothelial Cells and Macrophages Through the NF-κB Signaling Pathway in Sepsis.
包含CLP动物模型、LPS诱导细胞模型、体内外敲低、共培养黏附实验、组织病理、ELISA、流式、Western blot等,并验证了信号通路机制。
C57BL/6J小鼠CLP脓毒症模型 人脐静脉内皮细胞(HUVEC)LPS刺激模型 小鼠下腔静脉原代内皮细胞 巨噬细胞-内皮细胞共培养体系
BAP31敲低方式:体内采用Cre/LoxP系统(TIE2-Cre),体外采用shRNA(shBAP31) LPS处理浓度:1 μg/mL CLP模型观察时间点:24小时 生存分析样本量:每组6只小鼠 Western blot抗体及货号:如BAP31 (4043S; Cell Signaling Technology)等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建脓毒症动物模型并验证内皮细胞特异性BAP31敲低是否成功。
使用6-8周龄C57BL/6J雄性小鼠,通过CLP建立脓毒症模型,对照组行假手术;利用Cre/LoxP系统在内皮细胞中敲低BAP31,并通过Western blot和PCR验证。
建立LPS刺激的内皮细胞脓毒症模型,并验证体外BAP31敲低效率。
使用HUVEC,以1 μg/mL LPS刺激,PBS作为对照;通过慢病毒转染shBAP31或shNC敲低BAP31,并用qRT-PCR和Western blot验证。
检测BAP31敲低对脓毒症小鼠生存率和多器官损伤的影响。
记录各组小鼠14天生存曲线;HE染色评估脑、肺、心、肝、肾的组织损伤;检测血清TnT、TnI、AST、ALT、CR、BUN水平。
检测BAP31对内皮细胞与中性粒细胞/巨噬细胞黏附能力的影响。
将荧光标记的中性粒细胞、Raw264.7或THP-1与内皮细胞(小鼠原代EC或HUVEC)共培养,通过荧光显微镜观察并半定量分析黏附细胞数。
验证BAP31是否调节内皮细胞中ICAM1和VCAM1的表达。
通过免疫荧光和免疫组织化学检测HUVEC和血管组织中ICAM1和VCAM1的表达。
探索BAP31敲低对内皮细胞与巨噬细胞相互作用后巨噬细胞极化的影响。
通过流式细胞术检测巨噬细胞表面标记物CD80、CD86、CD163、CD206;ELISA检测上清中IL-1β、TNF-α、IL-10、TGF-β。
阐明BAP31调控ICAM1和VCAM1表达的下游信号通路。
通过Western blot检测TLR4、MyD88、TRAF6、TAK1、PI3K、AKT、IKKα/β、IκBα、p65及其磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞培养基 | Procell | CM-0122 |
| Ham's F-12K培养基 | -- | -- | |
| 肝素 | -- | -- | |
| 内皮细胞生长补充物 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 中性粒细胞 | Procell | CP-M150 | |
| Raw264.7细胞 | Procell | CL-0190 | |
| THP-1细胞 | Procell | CL-0233 | |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | -- | -- | |
| 中性粒细胞分离试剂盒 | Solarbio | P9402 | |
| 脂多糖 | -- | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| ELISA | ICAM1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab174445 |
| ICAM1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab100688 | |
| VCAM1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab174445 | |
| VCAM1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab100750 | |
| 肌钙蛋白T ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M1801c | |
| 肌钙蛋白I ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M1203c | |
| 天冬氨酸转氨酶ELISA试剂盒 | Abcam | ab263882 | |
| 丙氨酸转氨酶ELISA试剂盒 | Abcam | ab282882 | |
| 肌酐ELISA试剂盒 | Biocompare | aMBS3805641 | |
| 血尿素氮ELISA试剂盒 | Biocompare | MBS2611085 | |
| 白细胞介素-1β ELISA试剂盒 | Beyotime | PI301 | |
| 白细胞介素-1β ELISA试剂盒 | Beyotime | PI305 | |
| 肿瘤坏死因子-α ELISA试剂盒 | Beyotime | PT512 | |
| 肿瘤坏死因子-α ELISA试剂盒 | Beyotime | PT518 | |
| 白细胞介素-10 ELISA试剂盒 | Beyotime | PI528 | |
| 白细胞介素-10 ELISA试剂盒 | Beyotime | PI522 | |
| 转化生长因子-β ELISA试剂盒 | Beyotime | PT878 | |
| 转化生长因子-β ELISA试剂盒 | Beyotime | PT880 | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15,596,026 |
| 通用反转录PCR试剂盒 | Solarbio | RP1100 | |
| SYBR Green PCR预混液 | Solarbio | SR1110 | |
| Western blot | 蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0028 |
| BCA蛋白测定试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| PVDF膜 | Beyotime | FFP28 | |
| ECL Western blot化学发光试剂 | Beyotime | P0018S | |
| BAP31抗体 | Cell Signaling Technology | 4043S | |
| ICAM1抗体 | Abcam | ab171123 | |
| VCAM1抗体 | Abcam | ab134047 | |
| p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 磷酸化p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| TAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 5206 | |
| 磷酸化TAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 9339 | |
| IKKα抗体 | Cell Signaling Technology | 61,294 | |
| IKKβ抗体 | Cell Signaling Technology | 8943 | |
| 磷酸化IKKα/β抗体 | Cell Signaling Technology | 2078 | |
| IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4812 | |
| 磷酸化IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 2859 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4249 | |
| 磷酸化PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4228 | |
| 磷酸化PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 13,857 | |
| TLR4抗体 | Cell Signaling Technology | 14,358 | |
| TLR4抗体 | Cell Signaling Technology | 38,519 | |
| MyD88抗体 | Cell Signaling Technology | 4283 | |
| TRAF6抗体 | Cell Signaling Technology | 67,591 | |
| Histone H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4499 | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 93,473 | |
| 流式细胞术 | CD31抗体 | Abcam | ab7388 |
| F4/80抗体 | Abcam | ab6640 | |
| CD80抗体 | Abcam | ab225674 | |
| CD80抗体 | Abcam | ab222702 | |
| CD86抗体 | Abcam | ab239075 | |
| CD86抗体 | Abcam | ab242142 | |
| CD163抗体 | Abcam | ab182422 | |
| CD206抗体 | Invitrogen | 12–2069-42 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、CLP手术细节、术后观察时间点、BAP31敲低基因型 阅读提示:Methods: Animals; Figure 1A |
| 细胞培养与处理 | HUVEC来源、培养条件(ECM成分)、LPS浓度和处理时间、PMA浓度和处理时间、BAP31敲低方法(shRNA序列和转染时间) 阅读提示:Methods: Cell Culture, Cell Transfection; Figure 2C |
| 共培养实验 | 细胞类型、共培养比例、时间、荧光标记方法、观察和定量方法 阅读提示:Methods: Cell Co-Culture; Figure 2B and 2D |
| 分子检测 | 一抗和二抗的稀释比例、孵育时间和温度、蛋白上样量、qRT-PCR引物序列和扩增条件 阅读提示:Methods: Western Blot Analysis, Quantitative Real Time PCR; Supplementary Table S2 |
| 信号通路分析 | 检测的蛋白及其磷酸化位点、细胞处理条件(LPS浓度和时间)、蛋白提取方法(总蛋白和核蛋白) 阅读提示:Methods: Western Blot Analysis; Figure 5 |