体外细胞活力与细胞死亡检测
评估PA对ATC细胞的生长抑制和细胞死亡诱导作用。
使用CCK-8检测PA对多种ATC细胞系的活力影响,并通过克隆形成、Calcein-AM/PI染色、annexin V-FITC/PI流式检测细胞死亡,同时用Western blot检测PARP切割。
Prosapogenin A induces GSDME-dependent pyroptosis of anaplastic thyroid cancer through vacuolar ATPase activation-mediated lysosomal over-acidification.
包含体外细胞实验(多种ATC细胞系、细胞活力、克隆形成、细胞死亡检测)、机制验证(Western blot、敲低、抑制剂)、体内异种移植瘤模型及免疫组化,层级丰富且包含功能与机制验证。
人甲状腺未分化癌细胞系(8505C、KHM-5M) 人甲状腺未分化癌异种移植瘤模型(BALB/c裸鼠)
PA处理浓度与时间(如5 μM,24小时) GSDME敲低对焦亡表型的影响 V-ATPase亚基(ATP6V1A、ATP6V1B2、ATP6V0C)敲低或抑制剂(BafA1、KM91104)对溶酶体酸化和焦亡的影响 体内实验中PA剂量(10和20 mg/kg)及CQ剂量(60 mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PA对ATC细胞的生长抑制和细胞死亡诱导作用。
使用CCK-8检测PA对多种ATC细胞系的活力影响,并通过克隆形成、Calcein-AM/PI染色、annexin V-FITC/PI流式检测细胞死亡,同时用Western blot检测PARP切割。
确认PA诱导的细胞死亡是否为GSDME依赖性焦亡。
观察细胞形态(肿胀、气球样)、透射电镜、LDH释放检测、Western blot检测GSDME/GSDMD/GSDMC切割,并通过敲低GSDME或GSDMD验证其必要性。
确定PA诱导焦亡是否依赖caspase 8/3通路。
检测caspase 8/3/9的切割,并使用pan-caspase抑制剂Z-VAD、caspase 8抑制剂Z-IETD、caspase 3抑制剂Z-DEVD,以及敲低caspase 8/3观察对焦亡表型和GSDME切割的影响。
探究PA是否诱导溶酶体过度酸化和损伤,并验证其在焦亡中的作用。
使用Lyso-Tracker Red和Lysosensor Green DND-189检测溶酶体酸化和形态,通过免疫荧光检测galectin-3转运、LAMP1与组织蛋白酶共定位,电镜观察溶酶体损伤,并用NH4Cl中和酸度、组织蛋白酶抑制剂验证其功能。
验证V-ATPase亚基上调和过度酸化在PA诱导焦亡中的必要性。
通过Western blot和RT-qPCR检测ATP6V1A、ATP6V1B2、ATP6V0C表达,使用V-ATPase抑制剂(BafA1、KM91104)及siRNA敲低亚基,观察对溶酶体酸化和焦亡的影响。
评估PA在体内的抗肿瘤效果并验证机制。
使用8505C细胞建立BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型,PA单药或联合CQ治疗,测量肿瘤体积和重量,并通过免疫组化检测Ki-67、V-ATPase亚基、cleaved-caspase 8/3表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK8试剂盒 | ApexBio | K1018 |
| 细胞死亡检测 | Annexin V-FITC/PI试剂盒 | MultiSciences | -- |
| calcein-AM/PI双染试剂盒 | Yeasen Biotech | -- | |
| LDH释放检测 | LDH检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A020-1 |
| 溶酶体染色 | Lyso-Tracker Red(溶酶体红色荧光探针) | Beyotime | -- |
| Lysosensor Green DND-189(溶酶体pH敏感探针) | Yeasen Biotech | -- | |
| 免疫荧光 | 抗组织蛋白酶D抗体 | HuaAn Biotechnology | ET1608-49 |
| 抗组织蛋白酶L抗体 | HuaAn Biotechnology | ET1703-44 | |
| 抗LAMP1抗体 | Cell Signaling Technology | 15665S | |
| 抗半乳糖凝集素-3抗体 | Cell Signaling Technology | 87985S | |
| Western blot | 抗ATP6V1A抗体 | Proteintech | 17115-1-AP |
| 抗ATP6V1B2抗体 | Proteintech | 15097-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗caspase 8抗体 | Proteintech | 13423-1-AP | |
| 抗磷酸化RIPK1抗体 | Proteintech | 66854-1-Ig | |
| 抗cleaved-caspase 8抗体 | Cell Signaling Technology | 8592 | |
| 抗DR4抗体 | Cell Signaling Technology | 42533 | |
| 抗DR5抗体 | Cell Signaling Technology | 8074 | |
| 抗RIPK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3493 | |
| 抗MLKL抗体 | Cell Signaling Technology | 14993 | |
| 抗磷酸化MLKL抗体 | Cell Signaling Technology | 91689 | |
| 抗ATP6V0C抗体 | ABclonal | A23757 | |
| 抗活化caspase 3抗体 | HuaAn | ET-1602-47 | |
| 抗caspase 9抗体 | Cell Signaling Technology | 9502 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9532 | |
| 抗GSDME抗体 | Abcam | ab215191 | |
| 抗GSDMD抗体 | Abcam | ab209845 | |
| 抗p62抗体 | Abcam | ab207305 | |
| 抗LC3B抗体 | Abcam | ab192890 | |
| 抗caspase 3抗体 | Abcam | ab32351 | |
| 抗GSDMC抗体 | Abcepta | ap10771c | |
| 山羊抗兔HRP IgG | Beyotime | A0208 | |
| 山羊抗小鼠HRP IgG | Beyotime | A0216 | |
| 增强化学发光试剂盒 | Fdbio Science | -- | |
| RT-qPCR | RNAisoPlus(RNA提取试剂) | Takara | -- |
| PrimeScript反转录预混液 | Takara | -- | |
| Hieff qPCR SYBR Green预混液 | Yeasen Biotech | -- | |
| 药物处理 | Prosapogenin A | Chengdu Must Bio-Technology Co., Ltd | -- |
| 土木香内酯 | Topscience | -- | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Beyotime | S007 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | TargetMOl | T1879 | |
| 氯喹 | TargetMOl | T0194 | |
| 巴弗洛霉素A1 | TargetMOl | T6704 | |
| 坏死磺酰胺 | TargetMOl | T6904 | |
| Z-IETD(caspase 8抑制剂) | TargetMOl | T7019 | |
| PEG300 | TargetMOl | T7022 | |
| LLOMe(LMP诱导剂) | TargetMOl | T7739 | |
| KM91104(V-ATPase抑制剂) | TargetMOl | T9230 | |
| 星形孢菌素 | TargetMOl | T6680 | |
| 胃蛋白酶抑制剂A | TargetMOl | T3695 | |
| 吐温80 | TargetMOl | T13947 | |
| Z-VAD(泛caspase抑制剂) | ApexBio | A1902 | |
| Z-DEVD(caspase 3抑制剂) | ApexBio | A1920 | |
| 氯化铵 | Sigma-Aldrich | 254134 | |
| Z-FY-CHO(组织蛋白酶L抑制剂) | MedChemExpress | 167498-29-5 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 蛋白提取 | Western blot和IP裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 仪器 | Synergy LX多功能酶标仪 | BioTek Instruments | -- |
| 显微镜 | 荧光显微镜(Evos M7000) | Thermo Fisher | -- |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜 | Hitachi | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪(Agilent NovoCyte Advanteon) | Agilent | -- |
| 共聚焦显微镜 | 共聚焦显微镜(Leica TCS SP8) | Leica | -- |
| RT-qPCR | LC-480II(实时荧光定量PCR仪) | Roche | -- |
| Western blot成像 | SH-Cute 523(化学发光成像系统) | Shenhua Biotech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基(RPMI-1640+10% FBS)、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and reagents |
| 细胞活力检测 | 细胞 seeding 密度、PA浓度范围、处理时间、CCK8孵育时间 阅读提示:Materials and methods, Cell viability and colony formation assay and Figure 1A |
| 细胞死亡检测 | Annexin V-FITC/PI双染、Calcein-AM/PI双染、流式分析参数 阅读提示:Materials and methods, Cell live/death assay and Figure 1C-D |
| 焦亡诱导 | PA浓度、处理时间、LDH释放检测、GSDME表达水平 阅读提示:Materials and methods, LDH release assay, and Results 'PA elicits GSDME-dependent pyroptosis in ATC cells' |
| caspase通路抑制 | 抑制剂类型与浓度(Z-VAD, Z-IETD, Z-DEVD)、预处理时间、处理时间 阅读提示:Materials and methods, Cell viability and colony formation assay, and Figure 3B |
| 溶酶体功能检测 | Lyso-Tracker Red和Lysosensor Green DND-189染色浓度、孵育时间、分析方式 阅读提示:Materials and methods, Lysosome staining and analysis and Figure 5B-C |
| V-ATPase抑制 | 抑制剂浓度(BafA1, KM91104)、预处理时间、处理时间 阅读提示:Materials and methods, Reagents, and Figure 4A, 6C |
| 基因敲低 | CRISPR-Cas9敲低序列、MOI、筛选浓度、siRNA序列、转染方法 阅读提示:Materials and methods, CRISPR/Cas9-mediated knockdown and siRNA-mediated knockdown |
| RT-qPCR | 引物序列、内参基因(18S rRNA)、计算方法(2^-ΔΔCt) 阅读提示:Materials and methods, Quantitative real-time PCR |
| Western blot | 抗体信息、稀释比例、裂解液配方、封闭条件、曝光系统 阅读提示:Materials and methods, Western blot |
| 体内实验 | 动物品系、周龄、细胞接种量、给药剂量和方式、治疗时间、肿瘤测量 阅读提示:Materials and methods, In vivo xenograft tumor model and Figure 7 |