DNAJB4表达分析
验证DNAJB4在TNBC组织和细胞系中的表达水平。
通过qRT-PCR和Western blot检测正常乳腺细胞(MCF-10A)、乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、BT-549、MDA-MB-453、MCF-7)、四对TNBC组织及癌旁组织的DNAJB4表达;利用GEPIA数据库分析正常乳腺组织和乳腺癌组织的表达差异。
DNAJB4 promotes triple-negative breast cancer cell apoptosis via activation of the Hippo signaling pathway.
包含体外细胞功能实验(敲低/过表达、凋亡检测)、体内异种移植瘤模型及机制验证(Western blot检测Hippo通路蛋白磷酸化),证据层级独立。
MDA-MB-231细胞 BT-549细胞 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型 临床TNBC组织及配对癌旁组织
DNAJB4敲低效率(shDNAJB4#2) 细胞凋亡检测(Annexin V-FITC/PI双染流式、Caspase3/7活性) Hippo通路蛋白磷酸化水平(p-MST1、p-LATS1、p-YAP) 异种移植瘤模型(细胞数量、注射方式、肿瘤体积测量) MST1抑制剂XMU-MP-1的使用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DNAJB4在TNBC组织和细胞系中的表达水平。
通过qRT-PCR和Western blot检测正常乳腺细胞(MCF-10A)、乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、BT-549、MDA-MB-453、MCF-7)、四对TNBC组织及癌旁组织的DNAJB4表达;利用GEPIA数据库分析正常乳腺组织和乳腺癌组织的表达差异。
评估DNAJB4敲低和过表达对TNBC细胞凋亡的影响。
在MDA-MB-231和BT-549细胞中敲低DNAJB4(shRNA),在MDA-MB-231细胞中过表达DNAJB4(cDNA质粒),通过流式细胞术和Caspase3/7活性检测细胞凋亡,并通过Western blot检测凋亡相关蛋白表达。
验证DNAJB4敲低对TNBC致瘤性的影响。
将MDA-MB-231-shDNAJB4和shCtrl细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,测量肿瘤体积和重量,并通过免疫组化检测Ki67和Cleaved Caspase3表达。
阐明DNAJB4调控TNBC细胞凋亡的分子机制是否涉及Hippo信号通路。
通过Western blot检测DNAJB4敲低、过表达及添加MST1抑制剂XMU-MP-1后Hippo通路蛋白(MST1、LATS1、YAP)及其磷酸化水平的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | -- |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | 8122138 | |
| Leibovitz's L-15培养基 | CELLCOOK | M210915 | |
| 胎牛血清 | LONSA SCIENCE SRL | SJ06513 | |
| 青霉素-链霉素 | Hyclone | SV30010 | |
| MCF-10A专用培养基 | Procell | CM-0525 | |
| 细胞转染 | DNAJB4敲低慢病毒 | OBiO | -- |
| DNAJB4过表达质粒 | OBiO | -- | |
| RNA提取与cDNA合成 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成 | 第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA浓度测定 | NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qRT-PCR | CFX-96系统 | BioRad | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解缓冲液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白测定试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | GE Healthcare | -- |
| 增强化学发光试剂 | Pierce | -- | |
| Tanon 5200成像系统 | Tanon | -- | |
| 抗DNAJB4抗体 | Invitrogen | PA5-49925 | |
| 抗MST1抗体 | Cell Signaling Technology | 14946 | |
| 抗LATS1抗体 | Cell Signaling Technology | 3477 | |
| 抗YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 14074 | |
| 抗磷酸化MST1抗体 | Cell Signaling Technology | 49332 | |
| 抗磷酸化LATS1抗体 | Cell Signaling Technology | 8654 | |
| 抗磷酸化YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 13008 | |
| 抗Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 5023 | |
| 抗Bak抗体 | Cell Signaling Technology | 12105 | |
| 抗Bcl-xS抗体 | Cell Signaling Technology | 2764 | |
| 抗Cleaved Caspase3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Cell Signaling Technology | 15071 | |
| 抗Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 41162 | |
| 抗Bcl-xL抗体 | Cell Signaling Technology | 2764 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma | A1978 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 免疫组化 | 抗Ki67抗体 | Abcam | ab16667 |
| 抗Cleaved Caspase3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 免疫纯金属增强DAB底物试剂盒 | -- | -- | |
| 机制验证 | XMU-MP-1 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基组分(如MDA-MB-231使用L-15,BT-549使用RPMI-1640,MCF-7使用DMEM),血清浓度,培养条件(5% CO2,37°C) 阅读提示:Methods中Cell culture部分 |
| 基因操作 | 慢病毒敲低效率(shDNAJB4#2),质粒过表达效率,嘌呤霉素筛选浓度(4µg/ml)及时间(2周) 阅读提示:Methods中Cell transfection部分及Figure 2和3图注 |
| 凋亡检测 | 细胞处理时间,Annexin V-FITC和PI染色步骤,流式细胞仪检测参数,Caspase3/7活性检测试剂盒操作 阅读提示:Methods中Detection of apoptosis by flow cytometry部分及Figure 2和3图注 |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释比例,蛋白上样量,内参(β-actin),膜封闭条件,显影方法 阅读提示:Methods中Western blot assay部分 |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠),年龄(6周),每组数量(5只),注射细胞数(2×10^6),肿瘤测量公式及时间点(第35天处死) 阅读提示:Methods中Xenografted tumor model部分及Figure 4图注 |