HSC-CM模型的建立与效应验证
验证HSC条件培养基对HCC细胞恶性行为的影响。
收集LX-2细胞培养48小时的条件培养基,处理Hep3B等细胞,检测MIR4435-2HG和TGFB1表达,以及细胞迁移和侵袭能力。
Hepatic stellate cell-released CXCL1 aggravates HCC malignant behaviors through the MIR4435-2HG/miR-506-3p/TGFB1 axis.
包含体外细胞功能实验(迁移、侵袭、EMT标志物)、分子机制验证(双荧光素酶、RIP、RNA pulldown)、体内动物模型(原位移植瘤)及临床样本验证。
Hep3B细胞 LX-2肝星状细胞 BALB/c裸鼠原位移植瘤模型 HCC临床组织样本
Hep3B、Huh7、SNU-449细胞系 HSC条件培养基(培养48小时) MIR4435-2HG沉默或过表达 miR-506-3p agomir或antagomir转染 CXCL1重组蛋白(10 ng/ml)处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证HSC条件培养基对HCC细胞恶性行为的影响。
收集LX-2细胞培养48小时的条件培养基,处理Hep3B等细胞,检测MIR4435-2HG和TGFB1表达,以及细胞迁移和侵袭能力。
验证MIR4435-2HG在HSC-CM诱导的HCC细胞恶性行为中的作用。
使用siRNA沉默Hep3B细胞中MIR4435-2HG,在CM或HSC-CM条件下检测迁移、侵袭和EMT标志物表达。
验证miR-506-3p直接靶向MIR4435-2HG和TGFB1 3'UTR。
使用双荧光素酶报告基因、RIP和RNA pulldown实验验证miR-506-3p与MIR4435-2HG和TGFB1 mRNA的结合。
验证miR-506-3p过表达对HCC细胞恶性行为的影响。
在Hep3B细胞中过表达miR-506-3p,检测细胞迁移、侵袭和TGF-β/Smad信号通路变化。
验证MIR4435-2HG是否通过miR-506-3p调节TGFB1和细胞表型。
共转染si-MIR4435-2HG和antagomir-506-3p,在HSC-CM条件下检测细胞表型和信号通路变化。
验证HSC通过释放CXCL1影响HCC细胞中的MIR4435-2HG表达和恶性行为。
在HSC中敲低CXCL1或添加重组CXCL1,检测HCC细胞中MIR4435-2HG、miR-506-3p表达和细胞表型。
验证CXCL1/CXCR2轴和MIR4435-2HG在体内对肿瘤发生的影响。
将Hep3B细胞(经慢病毒敲低或过表达)与HSC混合注射至裸鼠肝脏,4周后检测肿瘤数量和相关基因表达。
验证HCC组织中关键分子的表达水平及其相关性。
收集12对HCC和癌旁组织,通过IHC、qRT-PCR检测CXCL1、TGF-β1、MIR4435-2HG和miR-506-3p表达,并分析TCGA数据。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| MEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| qRT-PCR | 反转录预混液 | TaKaRa | -- |
| miRNeasy提取试剂盒 | Qiagen | -- | |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | Roche | -- |
| PVDF膜 | Beyotime | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Beyotime | -- | |
| 一抗:抗E-钙粘蛋白 (20874-1-AP) | Proteintech | 20874-1-AP | |
| 一抗:抗波形蛋白 (10366-1-AP) | Proteintech | 10366-1-AP | |
| 一抗:抗TGF-β1 (ab215715) | Abcam | ab215715 | |
| 一抗:抗ZEB1 (66279-1-1G) | Proteintech | 66279-1-1G | |
| 一抗:抗Smad2 (12570-1-AP) | Proteintech | 12570-1-AP | |
| 一抗:抗p-Smad2 (#18338) | CST | #18338 | |
| 一抗:抗Smad3 (66516-1-Ig) | Proteintech | 66516-1-Ig | |
| 一抗:抗p-Smad3 (ab52903) | Abcam | ab52903 | |
| RIP | RIP裂解液 | Millipore | -- |
| RNA pull-down | C-1磁珠 | Life Technologies | -- |
| RNeasy小提试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | Psicheck-2载体 | Promega | -- |
| ELISA | 人CXCL1 ELISA试剂盒 (DY275) | R&D Systems | DY275 |
| 免疫荧光 | DAPI | Sigma-Aldrich | -- |
| RNA FISH | Cy3-TSA试剂 | -- | -- |
| FITC-TSA试剂 | -- | -- | |
| 细胞转染 | siRNA、agomir、antagomir | GenePharma | -- |
| 细胞处理 | 重组CXCL1蛋白 | Abnova | -- |
| 细胞培养 | 基质胶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系与培养条件 | Hep3B、LX-2、Huh7、SNU-449细胞系;培养基类型(DMEM/MEM);FBS浓度(10%);培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods 2.2 |
| HSC条件培养基制备 | 收集时间(48小时);离心和储存条件(-20°C) 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| 细胞转染 | siRNA/agomir/antagomir浓度;转染试剂(Lipofectamine 3000);转染时间(48小时) 阅读提示:Materials and Methods 2.4 |
| 细胞功能实验 | 伤口愈合实验:丝裂霉素C处理(1 mg/ml, 1小时);划痕后培养时间(24小时);Transwell侵袭实验:细胞密度(10^5 cells/well)、培养时间(24小时)、基质胶使用 阅读提示:Materials and Methods 2.6, 2.7 |
| MIR4435-2HG沉默和miR-506-3p过表达/抑制 | si-MIR4435-2HG、agomir-506-3p、antagomir-506-3p转染效率;处理时间 阅读提示:Materials and Methods 2.4; Results 3.4, 3.6 |
| CXCL1处理 | 重组CXCL1浓度(10 ng/ml);处理时间(48小时) 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| 体内动物模型 | BALB/c裸鼠品系;每组数量(6);细胞注射数量(HSC 5×10^5, Hep3B 1.5×10^6);注射体积(20 μl);观察时间(4周) 阅读提示:Materials and Methods 2.16 |
| 统计方法 | 至少三次独立实验;使用GraphPad软件;统计检验(One-way ANOVA, Tukey's multiple comparison test, 或Student's t-test) 阅读提示:Materials and Methods 2.17 |