评估BO1对肝癌细胞增殖的影响
检测BO1是否抑制肝癌细胞增殖且对正常肝细胞无毒性
使用CCK-8和克隆形成实验检测BO1处理Hep 3B、Huh7和L-O2细胞的增殖活性和克隆能力。
Bombinin-BO1 induces hepatocellular carcinoma cell-cycle arrest and apoptosis via the HSP90A-Cdc37-CDK1 axis.
包含体外细胞实验(增殖、周期、凋亡)、分子机制验证(pull down、质谱、免疫共沉淀、过表达、降解抑制)及体内移植瘤模型,且包含功能与机制验证。
Hep 3B人肝癌细胞系 Huh7人肝癌细胞系 L-O2人正常肝细胞系 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
BO1处理Hep 3B和Huh7细胞的浓度依赖性抑制作用及IC50值(15.20 μM和24.93 μM) BO1通过内吞作用进入细胞(EIPA和CPZ抑制实验) BO1与HSP90A的结合及对HSP90A-Cdc37-CDK1复合物的影响(pull down、质谱、免疫共沉淀) BO1诱导CDK1降解经由泛素-蛋白酶体系统(UPS)和自噬-溶酶体途径(ALP),MG-132和NH4Cl抑制实验 体内实验中BO1给药剂量(4.57 mg/kg)和给药方式(腹腔注射,隔天一次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测BO1是否抑制肝癌细胞增殖且对正常肝细胞无毒性
使用CCK-8和克隆形成实验检测BO1处理Hep 3B、Huh7和L-O2细胞的增殖活性和克隆能力。
探究BO1是否进入细胞及其进入方式
使用FITC标记的BO1结合激光共聚焦显微镜和流式细胞术,检测细胞摄取及其时间变化;使用内吞抑制剂(EIPA、CPZ)共同处理,分析荧光强度变化。
寻找并验证BO1的结合靶蛋白
使用生物素标记的BO1(bio-BO1)进行pull down实验,结合LC-MS/MS质谱鉴定特异性相互作用蛋白;通过Western blot验证HSP90A;通过免疫荧光观察BO1与HSP90A的共定位。
探究BO1是否通过干扰HSP90A-Cdc37-CDK1复合物导致CDK1降解
通过免疫共沉淀分析BO1处理后HSP90A、Cdc37和CDK1的相互作用;通过HSP90A过表达实验和降解抑制剂(MG-132、NH4Cl)处理,分析CDK1蛋白水平变化。
检测BO1是否诱导特定的细胞周期阻滞
使用流式细胞术分析BO1处理后细胞周期分布;通过Western blot检测细胞周期相关蛋白(包括Cyclin A2等)的表达。
检测BO1是否诱导肝癌细胞凋亡
使用Hoechst 33258染色观察细胞核形态变化;使用Annexin V-FITC/PI染色结合流式细胞术定量凋亡率;通过Western blot检测凋亡相关蛋白(cleaved caspase-9, cleaved caspase-3, Bcl-2, Bax等)的表达。
验证BO1在体内是否抑制肿瘤生长且无毒性
使用Hep 3B细胞皮下移植瘤模型,腹腔注射BO1(4.57 mg/kg)隔天一次,持续两周;测量肿瘤体积和重量,通过免疫组化检测Ki-67,通过Western blot检测CDK1和周期/凋亡蛋白;通过称重和血清生化检测(ALT、AST、CREA)以及主要器官H&E染色评估毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | Hyclone | H30022.01 |
| 胎牛血清 | Gibco Invitrogen | 10099141C | |
| 抗生素 | Solarbio | P7630 | |
| 药物处理 | Bombinin-BO1 | GL Biochem Ltd | HY-1001296 |
| 细胞定位 | FITC标记的Bombinin-BO1 | GL Biochem Ltd | P220311-MX980083 |
| Pull down | 生物素标记的Bombinin-BO1 | GL Biochem Ltd | P220221-HS936919 |
| 内吞抑制 | 阿米洛利 | Solarbio | IA1570 |
| 蛋白洗脱 | 5×蛋白洗脱缓冲液 | Solarbio | P1040 |
| 染色 | DAPI | Solarbio | C0065 |
| 克隆形成 | 1%结晶紫 | Solarbio | G1062 |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G磁珠 | MCE | HY-K0202-1 |
| Western blot | 增强化学发光试剂 | Thermofisher Scientific | A38556 |
| Hoechst染色 | 4%组织细胞固定液 | Solarbio | P1110 |
| Hoechst 33258 | Solarbio | C0021 | |
| 内吞抑制 | 氯丙嗪 | Solarbio | IC0340 |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Aidlab | RN07 |
| 增殖检测 | CCK-8试剂盒 | MedChemExpress | HY-K0301 |
| Pull down | RNA pull down试剂盒 | BersinBio™ | Bes5102 |
| 细胞周期分析 | DNA含量定量分析(细胞周期)试剂盒 | Solarbio | CA 1510 |
| 凋亡分析 | Annexin V FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Solarbio | CA1020 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Solarbio | KGP702 |
| 聚偏二氟乙烯(PVDF)膜 | Millipore | 03010040001 | |
| 细胞培养 | 人Huh7细胞系 | Wuhan Pricella Biotechnology Co., Ltd | CL-0120 |
| 人Hep 3B细胞系 | Wuhan Pricella Biotechnology Co., Ltd | CL-0102 | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Jiangsu Ji cui yao kang Biotechnology Co., Ltd | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript™ 反转录试剂盒 | Takara | RR047A |
| SYBR Select 预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 562偶联的山羊抗小鼠IgG | Abcam | ab150120 |
| Western blot | GAPDH抗体 | proteintech | 10494-1-AP |
| β-肌动蛋白抗体 | proteintech | 66009-1-Ig | |
| 半胱天冬酶-8前体抗体 | Abcam | ab108333 | |
| 半胱天冬酶-9抗体 | proteintech | 10380-1-AP | |
| 裂解的半胱天冬酶-9抗体 | Abcam | ab2324 | |
| 半胱天冬酶-3抗体 | proteintech | 19677-1-AP | |
| 裂解的半胱天冬酶-3抗体 | Abcam | ab2302 | |
| Bcl-2抗体 | proteintech | 12789-1-AP | |
| Bax抗体 | proteintech | 50599-2-lg | |
| HSP90A抗体 | proteintech | 60318-1-Ig | |
| Cdc37抗体 | proteintech | 10218-1-AP | |
| 细胞周期蛋白A2抗体 | proteintech | 18202-1-AP | |
| CDK1抗体 | proteintech | 19532-1-AP | |
| 免疫组化 | Ki-67抗体 | Abcam | ab15580 |
| Western blot | 山羊抗兔IgG | proteintech | 66912-1-lg |
| 山羊抗小鼠IgG | Abcam | ab150120 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:Hep 3B和Huh7细胞系、DMEM高糖培养基、10% FBS、1%抗生素、37°C、5% CO2 阅读提示:STAR★Methods - Cell culture |
| BO1药物处理 | BO1的纯度、溶剂(DMSO)、储存浓度(4×10^5 μM)、工作浓度(如10 μM, 20 μM, 15.20 μM, 24.93 μM等)、处理时间(48 h) 阅读提示:STAR★Methods - Chemicals and reagents |
| 增殖检测 | 细胞接种密度(4×10^3/孔)、处理时间(48 h)、CCK-8试剂孵育时间(1-2 h)、检测波长(450 nm) 阅读提示:STAR★Methods - Cell counting Kit-8 (CCK-8) |
| 细胞定位 | FITC-BO1浓度、处理时间(1,2,3 h)、激光共聚焦显微镜型号(LSM880)、DAPI染核(300 nM) 阅读提示:STAR★Methods - Cellular localization of BO1 |
| 内吞实验 | 抑制剂浓度(EIPA 15 μM, CPZ 10 μg/mL)、共处理时间(2 h)、细胞密度(2×10^5/孔)、流式细胞仪型号(BD) 阅读提示:STAR★Methods - Endocytosis experiment |
| Pull down | bio-BO1与磁珠孵育条件(4°C, 3 h)、与细胞裂解液孵育条件(4°C, 12 h)、洗脱条件(蛋白洗脱缓冲液和DTT,37°C, 2 h) 阅读提示:STAR★Methods - Biotinylated pull-down mass spectrometry (MS) |
| 免疫沉淀 | 抗体、磁珠种类(蛋白A/G磁珠)、孵育时间(室温30 min)、洗脱和变性条件(95°C, 5 min) 阅读提示:STAR★Methods - Immunoprecipitation (IP) |
| 细胞周期分析 | 细胞密度(5×10^5)、BO1处理浓度(Hep 3B: 12,15,18 μM; Huh7: 20,25,30 μM)、处理时间(48 h)、固定液(70%乙醇,4 h) 阅读提示:STAR★Methods - Cell cycle analysis |
| 凋亡分析 | 细胞密度(2×10^5/孔)、BO1处理浓度和时长(同周期分析)、Annexin V-FITC/PI染色、流式细胞仪 阅读提示:STAR★Methods - Annexin V-FITC/PI staining analysis |
| 体内实验 | 动物品系(BALB/c裸鼠)、周龄和性别(4周龄雄性)、细胞接种数量(2×10^6)、给药剂量(4.57 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药频率(隔天一次)、实验时长(两周)、每组动物数(6只) 阅读提示:STAR★Methods - In vivo xenograft model |