表型分析
明确Bnc1突变对卵泡发育和动情周期的影响
通过超排收集GV卵母细胞,计数不同年龄段(PD1、3、4、12、16周)的卵泡数量,并观察卵巢组织学变化。
BNC1 deficiency-triggered ferroptosis through the NF2-YAP pathway induces primary ovarian insufficiency.
包含动物模型(Bnc1突变和条件敲除小鼠)、细胞实验(ES-2细胞敲低)、组学分析(RNA-seq、Smart-seq、ChIP-seq)以及体内药物干预(VP和Fer-1)等多层级验证。
Bnc1tr/tr小鼠 Bnc1loxP/loxP, Ddx4-Cre小鼠 Bnc1loxP/loxP, Gdf9-Cre小鼠 ES-2细胞系
Bnc1突变类型:5bp缺失(CCGGG)导致移码 模型:Bnc1tr/tr小鼠和卵母细胞特异性敲除小鼠 药物处理:VP(100mg/kg)从出生后7天开始,每3天一次,持续14天 药物处理:Fer-1(1mg/kg)每日腹腔注射,持续3周 检测指标:原始卵泡数、闭锁卵泡数、脂质ROS、铁离子水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确Bnc1突变对卵泡发育和动情周期的影响
通过超排收集GV卵母细胞,计数不同年龄段(PD1、3、4、12、16周)的卵泡数量,并观察卵巢组织学变化。
确定Bnc1突变诱导的卵泡闭锁是否由凋亡或其他细胞死亡途径介导
通过Western blot检测凋亡标志物(P53、Bcl2、Bax、PARP、Caspase3等),Annexin V染色检测早期凋亡,γH2AX检测DNA损伤。
鉴定Bnc1突变影响的关键通路和分子
对卵巢组织进行RNA-seq,对GV卵母细胞进行Smart-seq2,并进行GO、KEGG和GSVA富集分析。
验证Bnc1突变是否诱导卵母细胞铁死亡
通过透射电镜和扫描电镜观察脂质积累和线粒体形态,Nile red染色检测脂质,ROS、MitoSOX、MitoTracker和JC-1检测氧化应激和线粒体功能,脂质ROS检测,GPX4和铁死亡标志物表达分析,以及Fer-1和RSL3处理验证铁死亡。
揭示BNC1调控铁死亡的分子机制
通过ChIP-seq、ChIP-qPCR、荧光素酶报告实验验证BNC1与Nf2启动子结合,检测NF2、YAP、TFRC、ACSL4表达,靶向脂质组学分析脂质组成,并通过Nf2 mRNA显微注射和VP处理验证通路功能。
评估靶向YAP或铁死亡是否能挽救Bnc1突变引起的POI表型
对Bnc1tr/tr小鼠给予VP或Fer-1处理,评估卵巢重量、卵泡计数、动情周期、脂质ROS和组织学变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | McCoy's 5A培养基 | VivaCell | C3020-0500 |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Serana | -- | |
| 基因沉默 | JetPRIME转染试剂 | Polyplus transfection | 101000046 |
| mRNA合成 | mMESSAGE mMACHINE T7 ULTRA转录试剂盒 | Invitrogen | AM1345 |
| RNA提取试剂 | Solarbio | P1011 | |
| BamHI-HF限制酶 | NEB | R3136 | |
| 体外培养 | RSL3 | Topscience | T3646 |
| Ferrostatin-1 | Selleck Chemicals | S7243 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Abcam | ab228549 |
| 抗Caspase3抗体 | Cell Signaling | 9664 | |
| 抗γH2AX抗体 | Sigma-Aldrich | 05-636-I | |
| 抗NF2抗体 | Abcam | ab88957 | |
| 抗活性YAP抗体 | Abcam | ab205270 | |
| 抗TFRC抗体 | Abcam | ab214039 | |
| 抗GPX4抗体 | ABclonal | A13309 | |
| RNA-seq | Ion Total RNA-Seq试剂盒v2.0 | Life Technologies | -- |
| Ion PI测序200试剂盒v2.0 | Life Technologies | -- | |
| ChIP-seq | SimpleChIP Plus酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling | 9005 |
| 微球菌核酸酶 | Cell Signaling | 10011 | |
| EDTA | Cell Signaling | 7011 | |
| Protein G磁珠 | Cell Signaling | 9006 | |
| 免疫荧光 | BODIPY 581/591 C11 | Thermo Fisher | D3861 |
| FerroOrange探针 | Dojindo | F374 | |
| Annexin V-FITC | Vazyme | A211 | |
| JC-1染料 | Yeasen | 40705ES03 | |
| MitoSOX红色线粒体超氧化物指示剂 | Yeasen | 40778ES50 | |
| MitoTracker绿色FM | Yeasen | 40742ES50 | |
| 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033S | |
| 免疫组化 | 尼罗红 | MCE | HY-D0718 |
| 动物处理 | 维替泊芬 | MCE | CL |
| Ferrostatin-1 | Selleck Chemicals | S7243 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| 逆转录试剂盒 | Vazyme | R233 | |
| SYBR Green基因表达检测试剂盒 | Vazyme | R711 | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Biosharp | BL507A |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | MCE | HY-K0021 | |
| 抗NF2抗体 | Abcam | ab88957 | |
| 抗磷酸化YAP (S127)抗体 | Abcam | ab76252 | |
| 抗活性YAP抗体 | Abcam | ab205270 | |
| 抗YAP抗体 | Santacruz | sc-101199 | |
| 抗转铁蛋白受体抗体 | Abcam | ab214039 | |
| 抗GPX4抗体 | ABclonal | A13309 | |
| 抗ACSL4抗体 | ABclonal | A20414 | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling | 3700 | |
| 抗P53抗体 | HuaBio | M1312-2 | |
| 抗PARP抗体 | HuaBio | ET1608-56 | |
| 抗BAX抗体 | HuaBio | ET1603-34 | |
| 抗BCL-2抗体 | HuaBio | ER1802-97 | |
| 抗Caspase3抗体 | Proteintech | 66470-2-Ig | |
| 抗BNC1抗体 | Aviva | ARP33283_P050 | |
| 荧光素酶实验 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000150 |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| 靶向脂质组学 | AB Sciex Triple Quad 6500+系统 | AB Sciex | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | Bnc1突变小鼠的构建方法(5bp缺失)和遗传背景(C57BL/6J) 阅读提示:Methods: Generation of Bnc1-targeted mutant mice |
| 卵泡计数 | 切片厚度(5μm)和计数间隔(至少25μm)以及校正因子(5) 阅读提示:Methods: Histological analysis of ovarian tissues and counting of follicles |
| GV卵母细胞收集 | PMSG注射剂量(10 IU)和收集时间(44-48h) 阅读提示:Methods: GV oocyte collection |
| 体外铁死亡处理 | RSL3浓度(5µM)和时间(3h),Fer-1浓度(2µM)和时间(8h) 阅读提示:Methods: In vitro oocyte culture |
| 体内药物处理 | VP剂量(100mg/kg)、给药间隔(3天一次)和持续时间(14天);Fer-1剂量(1mg/kg)和给药频率(每日) 阅读提示:Methods: Animal treatments |
| 脂质ROS检测 | BODIPY C11探针使用浓度和孵育时间(文中未明确说明) 阅读提示:Methods: Confocal microscopy of mouse oocytes |