MVC感染模型的建立与感染动态分析
验证MVC在WRD细胞中的感染是否影响SIRT1和p53的表达及乙酰化状态。
使用MOI=2的MVC感染WRD细胞,在不同时间点(6-60 hpi)收集样品,通过RT-qPCR和Western blot检测SIRT1、p53、乙酰化p53水平。
The SIRT1-Mediated p53 Deacetylation Pathway Modulates Apoptosis and Promotes Viral Replication in MVC-Infected Cells.
包含体外细胞感染模型、药物干预、基因敲低/过表达、细胞周期与凋亡分析、蛋白质互作及病毒复制检测等多层级功能与机制验证。
WRD细胞(MVC体外感染模型) COS-1细胞(共转染互作验证模型)
MVC感染剂量(MOI=2) SIRT1激动剂resveratrol(20 μM)和抑制剂Ex527(50 μM)的使用浓度 SIRT1敲低细胞系(shRNA1/shRNA2)和过表达细胞系(Flag-SIRT1) 细胞周期分析时间点(24 hpi、48 hpi)与凋亡检测时间点(48 hpi) 病毒复制检测方法(绝对定量PCR、Western blot)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MVC在WRD细胞中的感染是否影响SIRT1和p53的表达及乙酰化状态。
使用MOI=2的MVC感染WRD细胞,在不同时间点(6-60 hpi)收集样品,通过RT-qPCR和Western blot检测SIRT1、p53、乙酰化p53水平。
探究MVC感染是否改变SIRT1的亚细胞分布并促进其与p53的相互作用。
通过免疫荧光染色观察SIRT1与VP2的共定位;在COS-1细胞中共转染HA-SIRT1和Myc-p53,进行共免疫沉淀和共定位实验。
评估SIRT1激动剂(resveratrol)和抑制剂(Ex527)对MVC感染细胞活力和病毒复制的影响。
用20 μM resveratrol或50 μM Ex527处理WRD细胞,然后用不同MOI(0.2-16)的MVC感染。72 hpi时检测细胞活力;在MOI=2下,检测VP2 mRNA和NS1/VP2蛋白水平以及病毒DNA拷贝数。
验证SIRT1表达水平对MVC复制的因果影响。
利用慢病毒介导的shRNA敲低SIRT1(SIRT1-sh1/sh2)或过表达Flag-SIRT1,随后以MOI=2感染MVC,检测VP2 mRNA和NS1/VP2蛋白水平及病毒DNA拷贝。
探究SIRT1活性对MVC感染诱导的细胞周期阻滞和凋亡的影响。
用resveratrol或Ex527处理或用siRNA敲低SIRT1,或过表达SIRT1,感染MVC后通过流式细胞术分析细胞周期(PI染色)和凋亡(Annexin V-APC/PI双染)。
阐明SIRT1调节凋亡的分子机制及其与病毒产生的关系。
在处理或基因操作后,通过Western blot检测p53、乙酰化p53、Bax、Bcl-2、Cleaved caspase 3、p21等凋亡相关蛋白,并通过绝对定量PCR检测细胞内和细胞外病毒DNA。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11965092 |
| 胎牛血清 | TransGen Biotech | FS201-02 | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| 病毒感染 | 磷酸盐缓冲液 | KeyGen Biotech | KGL2206-500 |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000008 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985062 | |
| 药物处理 | 白藜芦醇 | Sigma-Aldrich | R5010 |
| EX527 | Sigma-Aldrich | E7034 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | TransGen Biotech | FC101 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| 逆转录与qPCR | TransScript® 一步法基因组DNA去除和cDNA合成超混合液 | TransGen Biotech | AT311 |
| TransStart® Top Green qPCR超混合液 | TransGen Biotech | AQ131 | |
| Western blot | 蛋白提取试剂盒 | KeyGen Biotech | KGB5303 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | KeyGen Biotech | KGP903 | |
| PVDF膜 | Millipore | 0000229835 | |
| 增强化学发光底物 | SEVEN Biotech | SW181-01 | |
| 抗体 | 抗乙酰化p53 (K382)抗体 | R&D Systems | MAB13552 |
| 抗SIRT1抗体 | Proteintech | 13161-1-AP | |
| 抗p53抗体 | Proteintech | 10442-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 抗剪切型caspase 3抗体 | Proteintech | 25128-1-AP | |
| 抗Bcl-2抗体 | Proteintech | 26593-1-AP | |
| 抗Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| 抗p21抗体 | Proteintech | 10355-1-AP | |
| 抗HA标签抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| 抗Myc标签抗体 | Proteintech | 60003-2-Ig | |
| 抗Flag标签抗体 | Proteintech | 66008-3-Ig | |
| 抗NS1抗体 | Abmart | 18929-1 | |
| 抗VP2抗体 | Abmart | 20351-1 | |
| Western blot二抗 | 山羊抗小鼠二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2305 |
| 山羊抗兔二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2301 | |
| 流式细胞术 | 细胞周期检测试剂盒 | KeyGen Biotech | KGA9101 |
| Annexin V-APC和PI凋亡检测试剂盒 | MultiSciences | AP107-60 | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Solarbio | SW3015 |
| 山羊抗兔Alexa荧光探针594 | Bioss | bs-0295G | |
| 山羊抗小鼠Alexa荧光探针488 | Bioss | bs-0296G | |
| DAPI染色液 | Thermo Fisher Scientific | 62248 | |
| 共免疫沉淀 | NP-40裂解液 | Beyotime | P0013F |
| 小鼠IgG抗体 | Proteintech | B900620 | |
| 兔IgG抗体 | Abmart | B30011S | |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotech | sc-2003 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病毒扩增与感染 | MVC在WRD细胞中的扩增方法及滴度测定;感染剂量MOI=2;病毒感染时间1.5小时;病毒感染后的培养时间 阅读提示:Methods 2.1 Cells and Virus, 2.2 MVC Infection; Figure 1 legend |
| 药物处理 | Resveratrol(20 μM)和Ex527(50 μM)的浓度、处理时间(感染前或感染后)及处理方式 阅读提示:Methods 2.4 Cell Viability; Figure 3 legend |
| SIRT1敲低与过表达 | shRNA靶序列、慢病毒感染复数、嘌呤霉素筛选浓度(2 μg/mL)、siRNA浓度(80 nM)及转染时间 阅读提示:Methods 2.8, 2.9; Figure 4D-G legend; Figure 7 legend |
| 细胞周期分析 | 细胞周期检测时间点(24 hpi和48 hpi)、PI染色方法、流式细胞术分析软件(ModFit) 阅读提示:Methods 2.10; Figure 5A和Figure 7A legend |
| 凋亡分析 | 凋亡检测时间点(48 hpi)、Annexin V-APC和PI染色方案、流式细胞术分析软件(FlowJo) 阅读提示:Methods 2.10; Figure 5B和Figure 7B legend |