患者样本分析
检测TAO患者血清和眼眶组织中IL-27α及IL-27Ra的表达水平。
收集TAO、正常对照及疾病对照的血清,以及TAO和正常对照的眼眶组织,通过ELISA、免疫组化、免疫印迹检测IL-27α/IL-27Ra水平,并分析其与临床指标的相关性。
Interleukin-27 is a multitarget regulator of fibroblast remodeling in thyroid-associated ophthalmopathy.
包含患者样本、原代细胞培养、体外功能实验(炎症、纤维化、脂肪生成)、机制分析(p38、AKT、ROS)和生信分析,但缺乏体内验证。
原代眼眶成纤维细胞(来自TAO患者和正常对照) CD90+眼眶成纤维细胞 CD90−眼眶成纤维细胞 TAO患者血清队列
重组人IL-27浓度(0-200 ng/mL) TGF-β1(10 ng/mL)和IGF-1(100 ng/mL)处理 缺氧条件(低氧培养) siRNA敲低IL-27Ra(序列:5'-UGGAGAAAGAAGAGGAUUU-3') 抑制剂和激活剂(SB203580、MK2206、SC79、NAC、H2O2、Anisomycin)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测TAO患者血清和眼眶组织中IL-27α及IL-27Ra的表达水平。
收集TAO、正常对照及疾病对照的血清,以及TAO和正常对照的眼眶组织,通过ELISA、免疫组化、免疫印迹检测IL-27α/IL-27Ra水平,并分析其与临床指标的相关性。
评估IL-27对IL-1β诱导的促炎细胞因子和NLRP3炎症小体激活的影响。
用IL-1β刺激TAO-OFs,并给予IL-27处理,通过qPCR检测炎症因子表达,通过免疫荧光检测NLRP3表达。
检测IL-27对TGF-β诱导的纤维化及p38 MAPK通路的影响。
用TGF-β1或IGF-1刺激CD90+ TAO-OFs,并给予IL-27处理,通过免疫印迹检测纤维化标志物(COL1A1, α-SMA)和通路蛋白(p38, p65, Smad)的表达,并通过划痕实验评估细胞迁移。
检测IL-27对IGF-1或缺氧诱导的脂肪生成及AKT/ROS通路的影响。
用脂肪分化培养基(含IGF-1或胰岛素)诱导CD90− TAO-OFs,并给予IL-27处理,通过免疫印迹检测脂肪生成标志物(PPARγ, ADRP)和通路蛋白(AKT, HIF-1α),通过油红O染色检测脂滴形成,通过流式细胞术检测ROS水平。
整合分析IL-27在眼眶连接组织中的免疫浸润和基因共表达网络。
利用公共数据库(GSE58331等)的转录组数据,进行差异表达、免疫浸润(ssGSVA)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)和转录因子预测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA | ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-E08464h |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | C11885500BT |
| 胎牛血清 | TransGen | FS201-02 | |
| 细胞处理 | 重组人LR3胰岛素样生长因子-1 | PrimeGene | 105-03 |
| 重组人TGF beta 1蛋白 | Proteintech | HZ-1011 | |
| 重组人IL-1β | novoprotein | GMP-CG93 | |
| 重组人IL-27蛋白 | Proteintech | HZ-1275 | |
| 胰岛素 | TargetMol | T8221 | |
| 脂肪生成诱导 | 泛酸 | Sigma | P5155 |
| 生物素 | Sigma | B4639 | |
| 三碘甲状腺原氨酸 | Sigma | T2877 | |
| 转铁蛋白 | Sigma | T8158 | |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤 | Sigma | I5879 | |
| 地塞米松 | Sigma | D4902 | |
| 卡巴前列环素 | Cayman | 18210 | |
| N-乙酰-L-半胱氨酸 | Solarbio | IA0050 | |
| 过氧化氢 | Aladdin | H433857 | |
| 机制验证 | MK2206 | TargetMol | T62609 |
| SC79 | TargetMol | T2274 | |
| SB203580 | TargetMol | T1764 | |
| 茴香霉素 | TargetMol | T6758 | |
| Takinib | TargetMol | T4264 | |
| Stattic | TargetMol | T6308 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo | 15596018CN |
| cDNA合成 | cDNA合成试剂盒 | TransGen | AT311 |
| qPCR | TransScript® RT SuperMix试剂盒 | TransGen | AU341 |
| 细胞活力 | 细胞计数试剂盒-8 | MedChemExpress | HY-K0301 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒(FITC) | Beyotime | S0033S-1 |
| 免疫荧光 | DAPI | Beyotime | C1006 |
| siRNA转染 | 靶向IL-27Ra的siRNA | Sango Biotech | N/A |
| siRNA阴性对照 | Sango Biotech | N/A | |
| Western blot | IL-27单克隆抗体 | Proteintech | 66164-1-Ig |
| I型胶原小鼠单克隆抗体 | Proteintech | 67288-1-Ig | |
| NF-κBp65多克隆抗体 | Proteintech | 10745-1-AP | |
| ADPR重组抗体 | Proteintech | 80362-2-RR | |
| 平滑肌肌动蛋白特异性重组抗体 | Proteintech | 80008-1-RR | |
| PPARγ多克隆抗体 | Proteintech | 16643-1-AP | |
| TNF-α多克隆抗体 | Proteintech | 17590-1-AP | |
| IL-1β多克隆抗体 | Proteintech | 16806-1-AP | |
| IL-6多克隆抗体 | Proteintech | 21865-1-AP | |
| Multi-rAb HRP-山羊抗兔重组二抗(H+L) | Proteintech | RGAR001 | |
| Multi-rAb HRP-山羊抗小鼠重组二抗(H+L) | Proteintech | RGAM001 | |
| 免疫荧光 | Multi-rAb™ CoraLite® Plus 488-山羊抗兔重组二抗(H+L) | Proteintech | RGAR002 |
| Western blot | GAPDH单克隆抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig |
| STAT3多克隆抗体 | Proteintech | 10253-2-AP | |
| 免疫组化 | 抗WSX-1抗体 | Abcam | ab281998 |
| Western blot | β-肌动蛋白兔单克隆抗体 | ABclonal | AC026 |
| 磷酸化NF-κB p65兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| Smad2 (D43B4) XP® 兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 5339 | |
| 磷酸化SMAD2 (Ser465/467) (138D4) 兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3108 | |
| SMAD3 (C67H9) 兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9523 | |
| 磷酸化SMAD3 (Ser423/425) (C25A9) 兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9520 | |
| Akt(pan)(C67E7) 兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 磷酸化Akt (Ser473) (D9E) XP® 兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 磷酸化Stat3 (Tyr705) (D3A7) XP® 兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| p38 MAPK抗体 | Affinity Biosciences | AF6456 | |
| 磷酸化p38 MAPK (Thr180/Tyr182) 抗体 | Affinity Biosciences | AF4001 | |
| ERK1/2抗体 | Affinity Biosciences | AF0155 | |
| 磷酸化ERK1/2 (Thr202/Tyr204) 抗体 | Affinity Biosciences | AF1015 | |
| JNK1/2/3抗体 | Affinity Biosciences | AF6319 | |
| 磷酸化JNK1/2/3 (Thr183+Tyr185) 抗体 | Affinity Biosciences | AF3318 | |
| HIF-1α多克隆抗体 | Immunoway | YT2133 | |
| 流式细胞术 | FITC小鼠抗人CD90 | BD Bioscience | 555595 |
| 免疫荧光 | IL27R兔多克隆抗体 | Bioss | bs-2711R |
| Western blot | 磷酸化STAT1 (S727) 重组兔单克隆抗体 | HUABIO | ET1611-20 |
| KD验证的抗STAT1重组兔单克隆抗体 | GenuIN | 61713 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本采集 | 血清样本分组(TAO、NC、UV、OC、GD)及样本量,组织样本来源(TAO、NC),临床活动度评分(CAS) 阅读提示:STAR Methods - Human participants 和 Human tissue donors,Table 1和Table 2 |
| 细胞培养与处理 | 原代眼眶成纤维细胞培养条件(DMEM+10% FBS,37°C, 5% CO2),细胞代数(P3-P8),细胞因子浓度(TGF-β1 10 ng/mL,IGF-1 100 ng/mL,IL-1β 10 ng/mL,IL-27 0-200 ng/mL),处理时间 阅读提示:STAR Methods - Primary cell cultures 和 Cytokine and growth factor treatments |
| 炎症检测 | qPCR引物序列,IL-1β刺激浓度(10 ng/mL),IL-27预处理浓度(100 ng/mL),处理24小时,检测基因(IL-6, IL-8, ICAM-1, HAS1, HAS3) 阅读提示:STAR Methods - RNA isolation and qRT-PCR,Figure 3C-3H |
| 纤维化检测 | TGF-β1浓度(10 ng/mL)和IL-27浓度梯度(0-100 ng/mL),CD90+ OFs分离,p38抑制剂(SB203580 10 μM)和激活剂(anisomycin 20 ng/mL)处理方案 阅读提示:STAR Methods - Small-molecule modulators 和 Wound-healing migration assay,Figure 4 |
| 脂肪生成检测 | 脂肪分化培养基配方(IBMX 0.1 mM, dexamethasone 1 μM, insulin 1 μM 或 IGF-1 10 ng/mL),处理时间(4天或10天),缺氧条件(第四天),IL-27处理浓度,AKT抑制剂(MK2206 1 μM)和激活剂(SC79 10 μM) 阅读提示:STAR Methods - Adipogenic differentiation protocols,Figure 5 |
| 机制验证 | siRNA敲低IL-27Ra序列(5'-UGGAGAAAGAAGAGGAUUU-3'),STAT3抑制剂(Stattic 10 μM),TAK1抑制剂(Takinib 10 μM),急性IL-27刺激时间(5分钟) 阅读提示:STAR Methods - Small-molecule modulators 和 siRNA transfection,Figure S4H |