CAF样细胞的制备与验证
通过OS细胞条件培养基将正常成纤维细胞激活为CAF样细胞,并验证其活化特征。
用HOS/143B条件培养基处理WI-38和HELF细胞48小时,通过qPCR、Western blot检测CAF标志物(α-SMA、FAP、FN1),免疫荧光检测α-SMA表达,并检测IL-6/STAT3和TGF-β/Smad2通路激活。
Cancer-associated Fibroblast-like Cells Promote Osteosarcoma Metastasis by Upregulation of Phosphoserine Aminotransferase 1 and Activation of the mTOR/S6K Pathway.
包含体外细胞实验(迁移、EMT、机制验证)、代谢组学、体内肺转移模型及临床样本分析,多层级验证。
WI-38和HELF人胚肺成纤维细胞经HOS/143B条件培养基激活的CAF样细胞 HOS和143B人骨肉瘤细胞系 BALB/c裸鼠尾静脉注射143B细胞的肺转移模型 骨肉瘤患者原发肿瘤及肺转移组织样本
CAF样细胞激活:WI-38和HELF细胞用HOS/143B条件培养基处理48小时,验证α-SMA、FAP、FN1表达升高 PSAT1敲低:siRNA转染HOS和143B细胞,6小时后更换为含10% FBS的CAF-CM,培养36小时进行迁移和EMT检测 mTOR通路抑制:使用雷帕霉素(RAPA)浓度0.1和1 μM处理,抑制S6K磷酸化 体内实验:BALB/c裸鼠(雌性,6周龄),尾静脉注射2×10^6 143B细胞(与或不与等量CAF样细胞混合),或PSAT1过表达细胞,RAPA剂量2 mg/kg腹腔注射,每周三次,持续四周 PSAT1蛋白稳定性:CHX(100 μg/mL)处理0、4、12、24小时检测mTOR降解
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过OS细胞条件培养基将正常成纤维细胞激活为CAF样细胞,并验证其活化特征。
用HOS/143B条件培养基处理WI-38和HELF细胞48小时,通过qPCR、Western blot检测CAF标志物(α-SMA、FAP、FN1),免疫荧光检测α-SMA表达,并检测IL-6/STAT3和TGF-β/Smad2通路激活。
评估CAF样细胞对骨肉瘤细胞增殖、迁移和EMT的影响。
用CAF-CM处理HOS和143B细胞,进行CCK-8、克隆形成、伤口愈合和Transwell实验,并通过Western blot检测EMT标志物。
分析CAF-CM处理对OS细胞代谢谱的影响,寻找关键代谢通路和酶。
对CAF-CM或WI-38-CM处理的HOS细胞进行非靶向LC-MS代谢组学,通过PCA、PLS-DA、KEGG和MSEA分析差异代谢物和通路,并用qPCR验证丝氨酸和甲硫氨酸代谢关键酶表达。
验证PSAT1在骨肉瘤组织和细胞中的表达水平及其与CAFs和预后的关系。
利用GEO和TCGA数据库分析PSAT1表达与生存;在10对OS原发肿瘤和7对肺转移样本中检测PSAT1表达,并与α-SMA关联。
验证PSAT1在CAF-CM诱导的OS细胞迁移和EMT中的作用。
用siRNA敲低HOS和143B细胞中的PSAT1,转染6小时后更换为CAF-CM,通过伤口愈合和Transwell检测迁移,Western blot检测EMT标志物。
探究PSAT1促进OS迁移是否依赖mTOR/S6K通路及其机制。
GSEA分析PSAT1相关通路;检测PSAT1敲低对mTOR mRNA和蛋白稳定性的影响(CHX chase);Western blot检测PI3K/mTOR/S6K磷酸化;通过PSAT1过表达和雷帕霉素抑制进行功能验证。
验证PSAT1和mTOR抑制对骨肉瘤肺转移的影响。
BALB/c裸鼠尾静脉注射143B细胞(与CAF样细胞混合),或PSAT1过表达细胞;给予PBS或雷帕霉素治疗,检测肺转移结节数和生物发光成像。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 10566016 |
| MEM培养基 | HyClone | SH30024.01 | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | C04001-500 | |
| 青霉素/链霉素 | Biosharp | BL505A | |
| CAF激活 | 0.22 µm过滤器 | Biosharp | BS-PES-22 |
| 原代细胞分离 | IV型胶原酶 | Sigma Aldrich | C5138-100MG |
| M199培养基 | Hyclone | SH30253.01 | |
| qPCR | TRIzol试剂 | Sigma | T9424 |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher | -- | |
| HiScript III逆转录预混液(含gDNA去除) | Vazyme | R323 | |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q311 | |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | GeneAmp 9700 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1045 | |
| ECL发光试剂 | Bio-Rad | 1705061 | |
| 红外成像系统 | UPV ChemiDoc-It 510 | -- | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 纤连蛋白抗体 | Proteintech | 15613-1-AP | |
| Smad2抗体 | Proteintech | 12570-1-AP | |
| E-钙粘蛋白抗体 | Proteintech | 20874-1-AP | |
| N-钙粘蛋白抗体 | Proteintech | 22018-1-AP | |
| 波形蛋白抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| PSAT1抗体 | Proteintech | 67619-1-Ig | |
| mTOR抗体 | Proteintech | 28273-1-AP | |
| 磷酸化mTOR (Ser2448)抗体 | Proteintech | 67778-1-Ig | |
| α-SMA抗体 | Abcam | ab7817 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Abclonal | AC006 | |
| STAT3抗体 | Abclonal | A1192 | |
| 磷酸化PI3K抗体 | Abclonal | AP0854 | |
| FAP抗体 | Affinity | AF0739 | |
| IL-6抗体 | Affinity | DF6087 | |
| 磷酸化STAT3 (Ser727)抗体 | Affinity | AF3294 | |
| 磷酸化S6K (Thr389/Thr412)抗体 | Affinity | AF3228 | |
| TGF-β抗体 | Bioss | bs-0086R | |
| 磷酸化Smad2 (Ser465)抗体 | Bioss | bs-2224R | |
| TGFBR抗体 | CST | 5544 | |
| PI3K抗体 | CST | 4292 | |
| HRP标记二抗 | Servicebio | GB23301/GB23303 | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime | P0096 |
| α-SMA抗体(IF) | Abclonal | A17910 | |
| Cy3标记二抗 | Abclonal | AS007 | |
| Hoechst染料 | Beyotime | C1017 | |
| Cy5标记二抗 | 文中未明确说明 | -- | |
| HRP标记二抗 | Servicebio | GB23303 | |
| FITC-酪胺信号放大染料 | Servicebio | G1222 | |
| Cy3标记二抗(IF) | Servicebio | GB21303 | |
| 荧光显微镜 | Olympus | BX53 | |
| CCK-8 | CCK-8试剂盒 | Biosharp | BS350B |
| 酶标仪 | PerkinElmer | Enspire | |
| 体内实验 | 雷帕霉素 | Selleck | AY-22989 |
| IVIS Lumina K系列III成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 代谢组学 | ACQUITY UPLC HSS T3 C18色谱柱 | Waters | -- |
| 细胞因子检测 | magEasyQPlex人14因子流式检测试剂盒 | Laizee Biotech | PLEM100 |
| TGF-β ELISA试剂盒 | Laizee Biotech | LER822-1 | |
| 药理学抑制 | SB431542 | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CAF激活 | CAF样细胞由WI-38或HELF细胞经HOS/143B条件培养基处理48小时诱导,需确认细胞代数(2-6代)和条件培养基制备细节。 阅读提示:Methods: CAF activation via external stimulation; Figure 1 |
| 细胞迁移实验 | 伤口愈合和Transwell实验的具体条件:细胞数量、处理时间、血清浓度。 阅读提示:Methods: Wound-healing assay, Transwell assay; Figure 2 |
| 代谢组学 | LC-MS非靶向代谢组学的样本制备和处理时间(HOS细胞处理36小时,200 mg/样品)。 阅读提示:Methods: Metabolomics analysis; Figure 3 |
| PSAT1敲低 | siRNA转染条件:转染后6小时更换为CAF-CM,处理36小时。 阅读提示:Methods: siRNA transfection (implied); Figure 5 |
| mTOR通路抑制 | 雷帕霉素浓度(0.1和1 μM)和处理时间;体内剂量(2 mg/kg,每周三次,四周)。 阅读提示:Methods: Results section 'PSAT1 promotion...mTOR/S6K activation'; Figure 6, 7 |
| 体内肺转移模型 | BALB/c裸鼠(雌性,6周龄),尾静脉注射2×10^6 143B细胞(±CAF样细胞),PSAT1过表达细胞,治疗周期四到六周。 阅读提示:Methods: Assays for tumor lung metastasis in vivo; Figure 7 |
| 临床样本分析 | 患者样本数量(10对原发肿瘤,7对肺转移),PSAT1免疫组化和免疫荧光条件。 阅读提示:Methods: Tissue immunohistochemistry and immunofluorescence analysis; Figure 4 |