细胞活力与抑制浓度测定
评估PAE对TGFβ诱导的HSC活力的影响,并确定PAE的IC20、IC40和IC50浓度。
使用CCK-8法检测LX2和HSC-T6细胞活力,设置对照组、TGFβ组和不同浓度PAE组(0.3125-20 mg/mL),处理48小时后测定OD450。
Role of integrin α4 in the inhibition of fibrosis in activated hepatic stellate cells by Periplaneta americana extract.
体外实验包括CCK-8、EdU、Transwell、划痕、Western blot、qPCR和转录组分析,并进行了ITGA4过表达的功能验证和机制研究,但缺乏体内实验验证。
TGFβ诱导的LX2细胞 TGFβ诱导的HSC-T6细胞
PAE浓度梯度(0.3125-20 mg/mL)及IC50浓度(LX2: 6.02±0.34 mg/mL;HSC-T6: 8.89±1.26 mg/mL) TGFβ浓度5 ng/mL ITGA4过表达质粒转染(Genomeditech, 上海)及处理时间(转染24h后,TGFβ+PAE处理48h) RNA-seq数据(BioProject: PRJNA1177452,每组3个样本) 统计方法:单因素方差分析,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PAE对TGFβ诱导的HSC活力的影响,并确定PAE的IC20、IC40和IC50浓度。
使用CCK-8法检测LX2和HSC-T6细胞活力,设置对照组、TGFβ组和不同浓度PAE组(0.3125-20 mg/mL),处理48小时后测定OD450。
评估PAE对TGFβ诱导的HSC增殖和迁移能力的影响。
使用EdU实验检测细胞增殖,Transwell实验和划痕实验检测细胞迁移能力。细胞经PAE和TGFβ处理48小时后进行检测。
鉴定PAE对TGFβ激活的LX2细胞基因表达和信号通路的影响,特别是与纤维化相关的基因和通路。
对TGFβ处理和TGFβ+PAE处理的LX2细胞(每组3个样本)进行RNA测序,分析差异表达基因,并进行Reactome通路富集分析。
验证PAE对TGFβ诱导的HSC中纤维化标志物(α-SMA、COL1)、炎症因子(TNFα、IL-6)和EMT标志物(NCA、Snail、Vim)表达的影响,并检测ITGA4表达。
使用Western blot和qPCR检测LX2和HSC-T6细胞中相关蛋白和mRNA水平。
验证ITGA4过表达是否逆转PAE对TGFβ诱导的HSC增殖、迁移和纤维化相关基因表达的抑制作用。
使用ITGA4过表达质粒转染LX2细胞,然后进行CCK-8、EdU、Transwell和划痕实验,以及Western blot检测纤维化相关蛋白。
验证PAE是否通过ITGA4/FAK/PI3K/AKT通路抑制肝纤维化。
通过Western blot检测FAK、PI3K、AKT及其磷酸化水平,比较PAE处理组和ITGA4过表达组的表达差异。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 甘龙胶囊 | Saino Pharmaceuticals | Z20050113 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | ExCell | FSP500 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 细胞处理 | 转化生长因子-β | MCE | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | TargetMol | -- |
| 细胞增殖检测 | Cell-light™ EdU Apollo567试剂盒 | RiboBio | -- |
| Western blot | ITGA4抗体 | Bioss | bs-0641R |
| α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| COL1抗体 | Proteintech | 14695-1-AP | |
| TNFα抗体 | Affinity | AF7014 | |
| IL-6抗体 | Affinity | DF 6087 | |
| ECA抗体 | Bioss | bs-10009R | |
| NCA抗体 | Bioss | bs-1172R | |
| Snail抗体 | CST | 3879T | |
| Vim抗体 | CST | 5741S | |
| TGF-β1抗体 | Abcam | ab92486 | |
| FAK抗体 | CST | 71433S | |
| PI3K抗体 | Abcam | ab191606 | |
| AKT抗体 | CST | 4691L | |
| P-FAK抗体 | CST | 3284 | |
| P-PI3K抗体 | Abcam | ab278545 | |
| P-AKT抗体 | CST | 4060s | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 60008-1-Ig | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-lg | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher | 15596018 |
| cDNA合成 | FastKing RT试剂盒(含gDNase) | -- | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine™ 3000 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞处理 | PAE浓度(IC20、IC40、IC50)及TGFβ浓度(5 ng/mL),处理时间48小时 阅读提示:2.2 Cell culture, 3.1 Results |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂比例(10:1),孵育时间2小时,检测波长450 nm 阅读提示:2.3 CCK-8 |
| 细胞增殖检测 | EdU试剂盒品牌(RiboBio),处理时间48小时 阅读提示:2.4 EdU incorporation assay |
| 细胞迁移检测 | Transwell迁移实验细胞密度(1×10^5 cells/mL)及染色步骤;划痕实验划痕时间(0、12、24小时) 阅读提示:2.5 Transwell migration assay, 2.6 Wound healing assay |
| 蛋白表达检测 | 抗体目录号,重复次数至少3次 阅读提示:2.7 Western blot (WB) |
| 转录组分析 | 样本处理(TGFβ 5 ng/mL,PAE 6.120 mg/mL),每组3个样本,数据存储位置(PRJNA1177452) 阅读提示:2.8 RNA-sequencing |
| 基因过表达 | ITGA4质粒来源(Genomeditech)及转染试剂(Lipofectamine 3000),转染时间24小时,处理时间48小时 阅读提示:2.10 Overexpressing α4 integrin |