临床样本中LTA4H表达与预后分析
评估LTA4H在人类肝癌组织中的表达水平及其与患者预后的关系。
利用免疫组化、蛋白印迹、实时定量PCR和ELISA检测肝癌及癌旁组织中LTA4H表达,并分析生存数据。
LTA4H improves the tumor microenvironment and prevents HCC progression via targeting the HNRNPA1/LTBP1/TGF-β axis.
包含临床样本分析、小鼠肝癌模型、细胞实验、质谱流式、转录组测序及机制验证等多个独立实验层级。
肝细胞癌患者组织样本 DEN诱导的小鼠肝癌模型 Hepa1-6细胞系 肝细胞特异性LTA4H敲除小鼠
LTA4H表达水平与肝癌预后相关性(TMA队列,n=133) 肝细胞特异性LTA4H敲除对DEN诱导肝癌的影响(肿瘤数量、ALT/AST) LTA4H对JNK信号通路和LTBP1表达的调控 LTA4H对巨噬细胞极化的影响(CD206+巨噬细胞比例) TGF-β阻断联合抗PD-1治疗对肿瘤生长的抑制作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估LTA4H在人类肝癌组织中的表达水平及其与患者预后的关系。
利用免疫组化、蛋白印迹、实时定量PCR和ELISA检测肝癌及癌旁组织中LTA4H表达,并分析生存数据。
研究LTA4H缺失对肝癌发生发展的影响。
构建肝细胞特异性LTA4H敲除小鼠和全敲除小鼠,使用DEN诱导肝癌,分析肿瘤负荷和肝损伤指标。
探讨LTA4H调控肝细胞损伤的分子机制。
分离原代肝细胞,进行RNA测序和信号通路分析,验证JNK、ERK、p38磷酸化水平。
研究LTA4H缺乏对肿瘤免疫微环境的塑造作用。
使用质谱流式分析和多重免疫组化检测肿瘤中免疫细胞亚群,特别是巨噬细胞极化状态。
阐明LTA4H调节LTBP1表达和TGF-β分泌的分子机制。
检测LTA4H对LTBP1表达和TGF-β分泌的影响,并验证HNRNPA1的介导作用。
评估TGF-β阻断能否改善LTA4H缺陷肝癌的免疫治疗反应。
建立原位肝癌模型,给予抗PD-1、抗TGF-β或联合治疗,分析肿瘤生长和免疫细胞浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 基质胶 | Corning | 356237 | |
| Western blot | 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A4737 |
| 免疫组化 | 柠檬酸盐缓冲液 | Sigma-Aldrich | C9999 |
| 蛋白提取 | WB和IP裂解液 | Yeasen | 20118ES60 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Yeasen | 20124ES03 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Yeasen | 20109ES05 | |
| 免疫共沉淀 | Protein A + G 磁珠 | MCE | HY-K0202 |
| 核糖核酸酶A/T1 | Thermo Fisher | EN0551 | |
| 细胞筛选 | G418 | Beyotime | ST081 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher | 15596026 |
| qPCR | SYBR Green | Roche | 04707516001 |
| ELISA | TGFβ ELISA试剂盒 | R&D Systems | DB100C |
| 原代细胞分离 | Liberase消化酶 | Merck | 05401020001 |
| 细胞培养 | L-谷氨酰胺 | Thermo Fisher | A2916801 |
| 药物处理 | 白三烯B4 | Cayman | 20110 |
| JNK抑制剂 | Aladdin | J125321 | |
| BLT2抑制剂 | MCE | HY-15744 | |
| BLT1抑制剂 | Cayman | 70705 | |
| 细胞裂解 | ACK裂解液 | Thermo Fisher | A1049201 |
| 细胞培养 | 巨噬细胞集落刺激因子 | Novoprotein | CB34 |
| 白细胞介素-4 | Novoprotein | CK74 | |
| 脂多糖 | Beyotime | S1732 | |
| 干扰素-γ | Novoprotein | C746 | |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 |
| 免疫荧光 | Hoechst 33342 | Sigma-Aldrich | B2883 |
| 免疫组化 | Opal Polaris 7色手动IHC检测试剂盒 | Akoya | NEL86100KT |
| DAB过氧化物酶底物试剂盒 | Beyotime | P0203 | |
| 凋亡检测 | TUNEL凋亡试剂盒 | Beyotime | C1098 |
| qPCR | 逆转录试剂盒 | Yeasen | 11149ES |
| 血清生化检测 | ALT活性检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | C009-2-1 |
| AST活性检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | C010-2-1 | |
| RNA测序 | VAHTS总RNA测序文库制备试剂盒 | Vazyme | NR603 |
| 核质分离 | 核质提取试剂盒 | Yeasen | 20126ES |
| RNA免疫沉淀 | RIP RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | FITGENE | FI8707 |
| 染色质免疫沉淀 | 染色质提取试剂盒 | Abcam | ab117152 |
| 一步法磁珠ChIP试剂盒 | Abcam | ab156907 | |
| DNA纯化 | PCR纯化试剂盒 | Beyotime | D0033 |
| ChIP测序 | NEBNext Ultra DNA文库制备试剂盒 | NEB | E7645L |
| 细胞转染 | jetPRIME体外DNA和siRNA转染试剂盒 | Polyplus | 101000027 |
| 质谱流式 | 顺铂 | Fluidigm | 201064 |
| Fix I缓冲液 | Fluidigm | 201065 | |
| Barcode Perm缓冲液 | Fluidigm | 201067 | |
| Cell-ID 20-Plex Pd条形码试剂盒 | Fluidigm | 201060 | |
| Cell-ID Intercalator-Ir | Fluidigm | 201192A | |
| EQ四元素校准微球 | Fluidigm | 201078 | |
| 体内治疗 | 抗PD-1抗体 | BioXcell | BE0146 |
| 抗TGF-β抗体 | BioXcell | BE0057 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | TMA队列样本量133例;LTA4H免疫组化评分标准;CHCC-HBV队列样本量159例 阅读提示:STAR Methods, Tissue microarray and patients, Figure 1 |
| 小鼠肝癌模型 | 小鼠品系及基因型;DEN给药剂量和途径;DEN+CCL4方案;肿瘤计数和肝脏重量 阅读提示:STAR Methods, Mice and HCC mouse model, Figure 2 |
| 原代肝细胞实验 | 肝细胞分离方法;LTA4H敲除验证;JNK信号分子检测;LTB4和抑制剂处理浓度 阅读提示:STAR Methods, Isolation and treatment of primary hepatocytes, Figure 3 |
| 巨噬细胞极化实验 | BMDM分离和极化条件;共培养体系;TGF-β激活和中和处理 阅读提示:STAR Methods, Isolation of BMDMs and coculture, Figure 5 |
| 免疫治疗实验 | 原位肿瘤模型构建;抗PD-1和抗TGF-β剂量及给药时间;生物发光成像时间点 阅读提示:STAR Methods, Mice and HCC mouse model, Figure 7 |