检测NPCs中DJ-1的亚细胞分布
确定氧化应激条件下DJ-1在NPCs中的定位变化。
用TBHP(50 μM)处理NPCs不同时间,通过亚细胞分离和Western blot检测细胞质和线粒体组分中DJ-1的水平。
Involvement of DJ-1 in the pathogenesis of intervertebral disc degeneration via hexokinase 2-mediated mitophagy.
包含体外细胞实验(功能获得与缺失、线粒体自噬检测)、机制验证(Akt/HK2/Parkin通路)及大鼠尾椎穿刺IDD模型的体内验证。
原代大鼠髓核细胞(NPCs) 大鼠尾椎穿刺诱导的椎间盘退变(IDD)模型
原代大鼠NPCs的分离与培养(DMEM/F12,10% FBS) 氧化应激处理:TBHP浓度(50 μM)及处理时间 DJ-1过表达(OE-Park7)与敲低(shPark7)的慢病毒转染 Parkin敲低(si-Parkin)的siRNA转染 HK2敲低(shHk2)与过表达(OE-Hk2)的慢病毒转染
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定氧化应激条件下DJ-1在NPCs中的定位变化。
用TBHP(50 μM)处理NPCs不同时间,通过亚细胞分离和Western blot检测细胞质和线粒体组分中DJ-1的水平。
明确DJ-1是否保护NPCs免受氧化应激诱导的凋亡。
在NPCs中过表达或敲低DJ-1(OE-Park7/shPark7),然后用TBHP处理,检测JC-1染色、细胞色素c释放、Caspase-3活化和TUNEL凋亡。
验证DJ-1是否促进Parkin依赖性线粒体自噬。
通过TEM观察自噬体包裹线粒体;Western blot检测线粒体Parkin和泛素化;免疫荧光共定位检测Parkin/LC3与TOM20;使用Mitophagy染料和溶酶体探针检测自噬流。
验证Parkin依赖性线粒体自噬是否介导DJ-1的抗凋亡作用。
在DJ-1过表达的NPCs中使用siRNA敲低Parkin(si-Parkin),然后检测线粒体自噬水平(LC3/TOM20共定位、Mitophagy染料)、线粒体功能(JC-1)、细胞色素c释放、Caspase-3活化和TUNEL凋亡。
确定HK2介导DJ-1对Parkin依赖性线粒体自噬的促进作用。
检测DJ-1过表达或敲低时HK2的线粒体招募;通过shRNA敲低HK2或用anti-HK2细胞穿透肽阻断HK2线粒体招募,检测Parkin招募、线粒体自噬水平;在HK2过表达背景下,观察DJ-1对线粒体自噬的影响。
评估DJ-1在体内的治疗效果,并验证HK2的介导作用。
建立大鼠尾椎穿刺IDD模型,通过AAV注射过表达DJ-1(AAV-Park7)和敲低HK2(AAV-shHk2),4周后通过MRI评估Pfirrmann分级,HE和SO&FG染色评估组织学,TUNEL检测凋亡,免疫荧光检测Aggrecan、MMP13和LC3/TOM20共定位。
验证磷酸化Akt是否作为DJ-1和HK2之间的桥梁。
用triciribine(Akt激活抑制剂)处理DJ-1过表达的NPCs,检测Akt和P-S473-Akt在细胞质和线粒体中的水平,通过共免疫沉淀检测P-S473-Akt与HK2的结合,并评估Parkin招募、线粒体自噬和凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | HyClone | -- | |
| 基因转染 | 慢病毒载体 | Obio Technology | -- |
| 小干扰RNA | RiboBio | -- | |
| siRNA转染 | riboFECT™ CP转染试剂 | RiboBio | -- |
| 凋亡检测 | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche | -- |
| 细胞核染色 | DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚) | -- | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| 线粒体自噬检测 | 线粒体自噬染料 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | New Cell & Molecular Biotech | P002 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| 线粒体分离 | 细胞线粒体分离试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| iBright CL1500成像系统 | Invitrogen | -- | |
| iBright分析软件 | Invitrogen | -- | |
| 抗体 | DJ-1抗体 | Cell Signaling Technology | 5933 |
| DJ-1抗体 | Abcam | ab76008 | |
| COX IV抗体 | Cell Signaling Technology | 4850 | |
| RhoGDI抗体 | Cell Signaling Technology | 2564 | |
| RhoGDI抗体 | Proteintech | 10509-1-Ig | |
| 细胞色素c抗体 | Cell Signaling Technology | 11940 | |
| 细胞色素c抗体 | Bioss | bs-0013R | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| Cleaved Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| Caspase-3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| Parkin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32282 | |
| Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 磷酸化Akt (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 己糖激酶II (HK2)抗体 | Cell Signaling Technology | 2867 | |
| 己糖激酶II (HK2)抗体 | Abcam | ab209847 | |
| 抗泛素抗体 | LifeSensors | VU-0101 | |
| 免疫荧光染色 | 细胞爬片 | SAINING | -- |
| 山羊血清 | -- | -- | |
| 抗体 | TOM20抗体 | Cell Signaling Technology | 42406 |
| LC3抗体 | Cell Signaling Technology | 83506 | |
| 聚集蛋白聚糖抗体 | Proteintech | 13880-1-AP | |
| MMP13抗体 | Proteintech | 18165-1-AP | |
| 动物实验 | AAV-Park7(过表达DJ-1的腺相关病毒) | Obio Technology | -- |
| AAV-shHk2(敲低HK2的腺相关病毒) | Obio Technology | -- | |
| MRI | 3.0 T磁共振成像系统 | Siemens | -- |
| 组织学扫描 | 组织病理扫描仪 | Hamamatsu Photonics K.K. | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 7.00软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与氧化应激诱导 | 大鼠原代NPCs的分离方法;培养条件(DMEM/F12,10% FBS,1%青霉素-链霉素,37°C,5% CO2);TBHP浓度(50 μM)及处理时间。 阅读提示:Materials and methods: Primary NPC isolation and culture; Results: Characterization of DJ-1 distribution (Fig. 1) |
| 基因操作 | 慢病毒载体(OE-Park7, shPark7, OE-Hk2, shHk2)的构建及转染效率;siRNA(si-Parkin, si-Control)的序列及转染条件;riboFECT™ CP转染试剂使用说明书。 阅读提示:Materials and methods: Lentivirus and small interfering RNA (siRNA) transfection |
| 线粒体功能与凋亡检测 | JC-1染色步骤及红绿荧光比计算;TUNEL染色的固定、通透和染色步骤;Western blot检测Cytochrome c、Caspase-3等抗体信息及蛋白上样量。 阅读提示:Materials and methods: TUNEL assay; Mitochondrial membrane potential (MMP) assay; Western blot analysis |
| 线粒体自噬检测 | Mitophagy染料浓度(0.1 μmol/L)和孵育时间(30 min);免疫荧光共定位染色(TOM20、Parkin、LC3)抗体及浓度;TEM样品制备条件。 阅读提示:Materials and methods: Mitophagy analysis; Immunofluorescence staining; Results: Fig. 3 |
| 动物模型 | 大鼠品系(12周龄雄性Sprague-Dawley)、穿刺针规格(23G)和深度(5 mm)、旋转360°并保持1分钟;AAV注射量(2 μL)和注射方式(33G微注射器);MRI时间点(0周和4周)及Pfirrmann分级标准;组织学评分系统。 阅读提示:Materials and methods: Rat IDD model; MRI; Histological analysis; Results: Fig. 6 |