COX17表达与纤维化相关性分析
探究COX17在肾纤维化中的表达变化及其与纤维化程度的关系
对CKD患者肾活检组织进行RNA测序和免疫组化染色,分析COX17表达与纤维化程度的相关性;在UUO小鼠和TGF-β1处理的NRK-52E细胞中检测COX17表达。
COX17 restricts renal fibrosis development by maintaining mitochondrial copper homeostasis and restoring complex IV activity.
包含体内动物模型(UUO小鼠)、体外细胞模型(NRK-52E)、患者样本分析、分子机制验证(COX17敲低/过表达、铜螯合剂、MD模拟),并进行功能验证和机制验证。
UUO小鼠肾纤维化模型 NRK-52E大鼠肾小管上皮细胞 CKD患者肾活检组织
COX17表达水平(Western blot、免疫组化、免疫荧光) 线粒体铜含量(ICP-MS) 呼吸链复合物IV活性 线粒体形态(TEM)和功能(ATP、mtROS) 细胞凋亡(TUNEL、cleaved caspase-3/9)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究COX17在肾纤维化中的表达变化及其与纤维化程度的关系
对CKD患者肾活检组织进行RNA测序和免疫组化染色,分析COX17表达与纤维化程度的相关性;在UUO小鼠和TGF-β1处理的NRK-52E细胞中检测COX17表达。
验证COX17在肾纤维化中的作用
使用AAV9-shCOX17敲低UUO小鼠COX17表达,进行组织学、生化和功能分析。
在细胞水平验证COX17对线粒体功能和凋亡的影响
在NRK-52E细胞中敲低或过表达COX17,并用TGF-β1处理,检测线粒体形态、ATP、mtROS、凋亡和纤维化标志物。
探究COX17对线粒体铜含量和呼吸链复合物IV活性的影响
检测线粒体铜含量(ICP-MS)和呼吸链复合物IV活性,并分析TGF-β1和COX17改变的影响。
验证降低线粒体铜积累是否能减轻线粒体功能障碍和肾纤维化
使用铜螯合剂TM处理UUO小鼠和TGF-β1处理的NRK-52E细胞,评估线粒体形态、功能、凋亡和纤维化标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 转化生长因子-β1 | R&D Systems | -- | |
| 药物处理 | 四硫代钼酸盐 | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blot | GAPDH抗体 | Santa Cruz | sc-137179 |
| COX IV抗体 | Proteintech | 11242-1-AP | |
| I型胶原抗体 | Abcam | ab-21286 | |
| α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Abcam | 124964 | |
| COX17抗体 | Santa Cruz | sc-100521 | |
| 活化的Caspase-3抗体 | Cell Signalling Technology | 9664 | |
| 活化的Caspase-9抗体 | Bioss | bs-20773R | |
| Caspase-3抗体 | Abcam | ab-184787 | |
| Caspase-9抗体 | Abcam | ab-184786 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| SYBR Green PCR预混液 | Roche | -- | |
| 组织学 | DAB显色试剂盒 | Vector | SK4100 |
| 免疫荧光 | TOM20抗体 | Proteintech | 11802-1-AP |
| Alexa Fluor 568二抗 | Invitrogen | A11011 | |
| Alexa Fluor 488二抗 | Invitrogen | A11029 | |
| TUNEL | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜 | JEOL | JEM-1010 |
| RNA-seq | mRNA纯化试剂盒 | Invitrogen | 61006 |
| Collibri链特异性RNA文库制备试剂盒 | Invitrogen | a38994024 | |
| 金属含量测定 | 电感耦合等离子体质谱仪 | PerkinElmer | 300D |
| 线粒体分离 | 组织线粒体分离试剂盒 | Abcam | ab-110168 |
| 培养细胞线粒体分离试剂盒 | Abcam | ab-110170 | |
| mtROS检测 | MitoSOX红色荧光探针 | Invitrogen | M36008 |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 呼吸链复合物活性 | 复合物I活性检测试剂盒 | Solarbio | BC0515 |
| 复合物II活性检测试剂盒 | Solarbio | BC3235 | |
| 复合物III活性检测试剂盒 | Solarbio | BC3240 | |
| 复合物IV活性检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | CYTOCOX1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和处理 | NRK-52E细胞培养条件、TGF-β1浓度、处理时间、TM浓度 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Figure 6 legend |
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、UUO手术方法、分组、样本量、处理时间、AAV注射方式 阅读提示:Materials and methods: Animals, Adeno-associated virus-treated mice; Figure 2 legend |
| 线粒体铜含量检测 | 线粒体分离方法、ICP-MS检测条件 阅读提示:Materials and methods: Isolation of mitochondria, Metal content determination; Figure 5 legend |
| 复合物IV活性检测 | 试剂盒使用、样品处理、检测波长 阅读提示:Materials and methods: Respiratory chain complex enzymatic activity |
| 线粒体功能检测 | ATP检测方法、MitoSOX探针浓度和孵育时间、TEM样品制备 阅读提示:Materials and methods: Detection of ATP, Mitochondrial superoxide ROS detection, Transmission electron microscopy |