FSTL1在纤维化肾脏中的表达分析
确定FSTL1在肾脏纤维化过程中的表达变化和细胞定位。
通过bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq分析UUO小鼠肾脏中Fstl1的表达,并利用qPCR、Western blot和免疫荧光检测FSTL1在肾脏中的表达分布,及在人和小鼠纤维化肾脏中的成纤维细胞共定位。
Follistatin-like 1 (FSTL1) interacts with Wnt ligands and Frizzled receptors to enhance Wnt/β-catenin signaling in obstructed kidneys in vivo.
包含体内小鼠UUO模型、人肾组织样本、体外细胞实验、分子机制验证(免疫共沉淀、下拉实验)等多个独立证据层级,并有功能获得和缺失实验。
小鼠UUO(单侧输尿管梗阻)模型 NRK-49F大鼠肾成纤维细胞 HEK293T人胚肾细胞 IMCD3小鼠内髓集合管细胞
UUO手术时间(1,3,7天)及FSTL1表达的时间变化 FSTL1过表达(尾静脉注射Fstl1-HA质粒20μg)和中和(腹腔注射抗FSTL1抗体5 μg/g体重) 体外实验中Wnt3a蛋白浓度(10-30 ng/ml)及FSTL1蛋白浓度(200-500 ng/ml) 细胞系选择(IMCD3、HEK293T、NRK-49F)及转染方法(Lipofectamine 2000)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定FSTL1在肾脏纤维化过程中的表达变化和细胞定位。
通过bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq分析UUO小鼠肾脏中Fstl1的表达,并利用qPCR、Western blot和免疫荧光检测FSTL1在肾脏中的表达分布,及在人和小鼠纤维化肾脏中的成纤维细胞共定位。
评估FSTL1在体内对肾纤维化和Wnt/β-catenin信号的作用。
通过尾静脉高压注射Fstl1-HA质粒过表达FSTL1,检测纤维化标志物(α-SMA、Fn-1、Col1A1)及Wnt通路蛋白(p-LRP6、p-GSK3β、活性β-catenin)的变化。
验证内源性FSTL1对Wnt/β-catenin信号的必要性。
通过腹腔注射抗FSTL1抗体中和内源性FSTL1,检测Wnt通路蛋白的变化。
在细胞水平证实FSTL1直接增强Wnt/β-catenin信号。
使用TOPflash/8×TOPflash荧光素酶报告基因检测FSTL1对Wnt3a诱导信号的影响,并通过过表达和siRNA敲低验证。
确定FSTL1与Wnt信号通路组分的直接结合及其结构域。
通过共免疫沉淀(co-IP)、下拉实验和细胞表面标记实验,分析FSTL1与多种Wnt配体及FZD4、LRP6的相互作用,并 mapping 相互作用的FSTL1结构域。
确认FSTL1的EC结构域是否能独立增强Wnt信号。
在HEK293T和NRK-49F细胞中表达EC结构域,检测其对Wnt3a诱导报告基因活性的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光 | 抗FSTL1抗体 | R&D Systems | AF1738 |
| 抗PDGFR-β抗体 | Abcam | ab32570 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab5694 | |
| 抗纤连蛋白抗体 | Millipore | AB2033 | |
| Western blot | 抗Wnt1抗体 | Abcam | ab15251 |
| 抗WNT3a抗体 | Cell Signaling Technology | 2721 | |
| 抗V5抗体 | Cell Signaling Technology | 13202 | |
| 抗HA抗体 | Millipore | 05-904 | |
| 抗磷酸化GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9336 | |
| 抗GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9315 | |
| 抗活性β-catenin抗体 | Cell Signaling Technology | 8814 | |
| 抗β-catenin抗体 | Cell Signaling Technology | 8480 | |
| 抗磷酸化LRP6抗体 | Cell Signaling Technology | 2568 | |
| 抗LRP6抗体 | Cell Signaling Technology | 3395 | |
| 抗I型胶原抗体 | Bioss Antibodies | bs-10423R | |
| 抗TGF-β1抗体 | Bioss | bs-0086R | |
| 抗磷酸化Smad3抗体 | Abcam | ab52903 | |
| 抗Smad3抗体 | Cell Signaling Technology | 9523 | |
| 抗磷酸化Smad1/5/8抗体 | Cell Signaling Technology | 9511 | |
| 抗Smad1抗体 | Cell Signaling Technology | 9743 | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9251 | |
| 抗JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| 抗磷酸化CaMKII抗体 | Cell Signaling Technology | 12716 | |
| 抗CaMKII抗体 | Abcam | ab52476 | |
| 抗Myc抗体 | Abcam | ab9106 | |
| 抗SNAP抗体 | Thermo Fisher Scientific | CAB4255 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Pierce Biotechnology | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞表面标记 | BG-PEG12-生物素 | New England Biolabs | -- |
| 链霉亲和素琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Takara | 9767 |
| 逆转录 | PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | RR036A |
| 实时PCR | SYBR Green PCR预混液 | Takara | RR420D |
| 荧光素酶检测 | 双荧光素酶报告检测试剂盒 | Promega | -- |
| 体外重组蛋白 | 重组小鼠WNT3a蛋白 | R&D Systems | 1324-WN |
| 重组小鼠FSTL1蛋白 | R&D Systems | 1738-FN | |
| 重组人FSTL1蛋白 | R&D Systems | 1694-FN | |
| 重组WNT3a蛋白 | PeproTech | 315-20 | |
| 重组FZD4-Fc蛋白 | R&D Systems | 194-FZ |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| UUO模型和FSTL1表达检测 | 小鼠品系、性别、年龄(8周龄雄性);UUO手术时间点(1,3,7天);Fstl1表达检测方法(qPCR、Western blot) 阅读提示:见“Mice”及Figure 1图例 |
| FSTL1过表达实验 | 质粒剂量(20 μg)、注射方式(尾静脉高压注射)、时间(UUO后2天,次日取材) 阅读提示:见“Mice”部分 |
| FSTL1中和实验 | 抗体剂量(5 μg/g体重)、给药方式(腹腔注射)、时间(UUO后7天,6小时后取材) 阅读提示:见“Mice”部分 |
| 体外细胞实验 | 细胞系(HEK293T、NRK-49F、IMCD3);培养基(DMEM、DMEM/F12);血清饥饿条件(0.1% BSA)、Wnt3a蛋白浓度(10-30 ng/ml)、FSTL1蛋白浓度(200-500 ng/ml) 阅读提示:见“Cell culture and transfection”和“Luciferase assay and siRNA targeting” |
| 分子相互作用实验 | 转染质粒组合、免疫沉淀用抗体、重组蛋白浓度(如Wnt3a 1.5 μg、FSTL1 3 μg)、孵育条件 阅读提示:见“IP”和相应图例(Figures 5-7) |