临床相关性分析
评估SRD5A1在MM患者中的表达与预后的关系
利用TCGA和GEO数据集分析SRD5A1表达水平与多种癌症及MM患者生存期的相关性。
Suppression of steroid 5α-reductase type I promotes cellular apoptosis and autophagy via PI3K/Akt/mTOR pathway in multiple myeloma.
包含体外细胞实验、异种移植和5TMM小鼠模型等体内外证据,以及转录组测序、Western blot、流式细胞术等功能验证和机制验证。
人骨髓瘤细胞系ARP1和H929 OCI-MY5异种移植小鼠模型 5TMM3VT小鼠骨髓瘤模型
SRD5A1敲低使用Dox诱导的shRNA,ARp1和H929细胞 SRD5A1过表达细胞系OCI-MY5-SRD5A1-OE Dutasteride给药剂量:25 mg/kg,腹腔注射,每周三次 自噬抑制剂3-MA处理浓度和时间 凋亡检测:Annexin-V/PI染色,Western blot检测cleaved caspase-3和PARP
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SRD5A1在MM患者中的表达与预后的关系
利用TCGA和GEO数据集分析SRD5A1表达水平与多种癌症及MM患者生存期的相关性。
验证敲低SRD5A1对骨髓瘤细胞增殖、周期和凋亡的影响
使用Dox诱导的shRNA敲低SRD5A1,通过MTT、流式细胞术检测细胞增殖、周期和凋亡。
验证SRD5A1过表达对肿瘤生长的影响
将OCI-MY5-SRD5A1-OE和对照细胞皮下注射到NSG小鼠,监测肿瘤生长。
阐明SRD5A1敲低诱导凋亡和自噬的分子机制
通过RNA-seq、Western blot、免疫荧光和透射电镜检测自噬和凋亡相关蛋白及信号通路。
评估自噬抑制剂和SRD5A1抑制剂对骨髓瘤细胞和小鼠模型的作用
使用3-MA抑制自噬,观察对SRD5A1敲低诱导凋亡的影响;使用Dutasteride抑制SRD5A1,评估其抗骨髓瘤效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Biological Industries | -- |
| DMEM培养基 | Biological Industries | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Thermo Fisher | 89900 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Yeasen | 20124ES03 | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| 超敏ECL检测试剂 | Yeasen | 36208ES60 | |
| 流式细胞术 | RNase A | Yeasen | 10405ES03 |
| 碘化丙啶 | Yeasen | 40710ES03 | |
| Annexin-V-APC | BioLegend | 640941 | |
| Flowsight流式细胞仪 | Merck Millipore | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 药物处理 | 多西环素 | -- | -- |
| 度他雄胺 | APExBIO | A1659 | |
| 羟氯喹 | APExBIO | B4874 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | APExBIO | A8353 | |
| 多柔比星 | Sigma-Aldrich | D1515 | |
| Western blot | Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 |
| Cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9542 | |
| Bcl-xl抗体 | Cell Signaling Technology | 2762 | |
| Bcl-2抗体 | Cell Signaling Technology | 2876 | |
| Bad抗体 | Cell Signaling Technology | 9292 | |
| Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 2774 | |
| ATG-5抗体 | Cell Signaling Technology | 12994 | |
| ATG-7抗体 | Cell Signaling Technology | 8558 | |
| LC3A/B抗体 | Cell Signaling Technology | 12741 | |
| Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| p-Akt (Thr308)抗体 | Cell Signaling Technology | 9275 | |
| p-mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2971 | |
| p-p70S6K (Thr389)抗体 | Cell Signaling Technology | 9234 | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| SRD5A1抗体 | Proteintech | 66329-1-Ig | |
| p70S6K抗体 | Proteintech | 14485-1-AP | |
| p-PI3K (Tyr607)抗体 | Affinity | AF3241 | |
| mTOR抗体 | Affinity | AF6308 | |
| SQSTM1/p62抗体 | Sigma-Aldrich | P0067 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG/Alexa Fluor 647抗体 | Bioss | bs-0295G-AF647 |
| DAPI | Solarbio | C0080 | |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | A8020 | |
| Western blot | LY294002 | Cell Signaling Technology | 9901 |
| RNA-seq | Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:ARP1、OCI-MY5、NCI-H929、5TMM3VT;培养基:RPMI-1640、DMEM;血清:10% FBS;青霉素/链霉素:1%;培养条件:37°C,5% CO2 阅读提示:Methods - Cell lines and cell culture |
| 基因敲低 | shRNA序列:TRIPZ载体,Dox诱导;转染效率需通过Western blot验证 阅读提示:Methods - Lentiviral gene transduction |
| 细胞周期与凋亡检测 | 细胞数量:1×10^6(周期),2×10^5(凋亡);PI浓度:40 μg/mL;Annexin-V-APC染色;处理时间:48小时 阅读提示:Methods - Flow cytometry |
| 细胞活力检测 | 细胞密度:3000-4000细胞/孔;MTT孵育4小时;OD570测定 阅读提示:Methods - Cell viability assay |
| 体内异种移植模型 | 细胞数量:1×10^6;小鼠品系:NSG,6-8周龄;n=8;肿瘤直径达15mm时处死;肿瘤体积测量间隔3天 阅读提示:Methods - Myeloma xenograft tumor mouse model |
| 5TMM小鼠模型 | 细胞数量:1×10^6;小鼠品系:C57BL/KaLwrij,6周龄;n=14;Dutasteride剂量:25 mg/kg,腹腔注射,每周三次;记录因瘫痪导致死亡的时间 阅读提示:Methods - 5TMM mouse model |