构建PFN2a过表达细胞系
建立PFN2a过表达的稳定细胞系以研究其功能。
使用CRISPR/Cas9系统将PFN2a表达盒插入ROSA26位点,经嘌呤霉素筛选获得单克隆细胞系,并通过PCR、qPCR和Western blot验证。
PFN2a Suppresses C2C12 Myogenic Development by Inhibiting Proliferation and Promoting Apoptosis via the p53 Pathway.
包含细胞模型构建(CRISPR/Cas9)、增殖/凋亡/分化功能验证、机制验证(si-p53回补)等多层级证据。
C2C12小鼠成肌细胞系(野生型) PFN2a过表达C2C12细胞系 si-p53处理的PFN2a过表达C2C12细胞
PFN2a过表达细胞系的构建使用CRISPR/Cas9系统,通过ROSA26位点敲入PFN2a(图1)。 增殖检测使用EdU标记和流式细胞术分析细胞周期(图2)。 凋亡检测使用Annexin V-APC/7AAD染色和流式细胞术(图4)。 分化检测使用MyHC免疫荧光和Western blot(图3)。 机制验证使用si-p53敲低p53后观察PFN2a效应(图6)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立PFN2a过表达的稳定细胞系以研究其功能。
使用CRISPR/Cas9系统将PFN2a表达盒插入ROSA26位点,经嘌呤霉素筛选获得单克隆细胞系,并通过PCR、qPCR和Western blot验证。
评估PFN2a过表达对C2C12细胞增殖的影响。
通过EdU标记和流式细胞术分析细胞周期,qPCR和Western blot检测细胞周期相关基因和蛋白。
评估PFN2a过表达对分化过程中细胞凋亡的影响。
在分化第3天使用Annexin V-APC/7AAD染色进行流式细胞术检测凋亡,同时检测凋亡相关基因。
评估PFN2a过表达对肌管形成及肌节组装的影响。
分化第7天通过MyHC免疫荧光和α-Actinin共染观察肌管形态和肌节结构,qPCR检测分化标记基因。
验证PFN2a是否通过p53通路发挥作用。
在PFN2a过表达细胞中转染si-p53,检测增殖、凋亡和分化变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Hyclone | SH30243.01 |
| 胎牛血清 | Gibco | FBS10099-141 | |
| 细胞分化 | 马血清 | Hyclone | SH30074.03 |
| 基因编辑 | GeneHero™小鼠ROSA26安全港基因敲入试剂盒 | GeneCopoeia Inc | SH-ROS-K200 |
| RNA提取与qPCR | HiScript® II Q RT SuperMix qPCR逆转录预混液(含去基因组DNA) | Vazyme | R223-01 |
| qPCR | Hieff™ qPCR SYBR® Green预混液(无ROX) | Yeasen | 11201ES08 |
| Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 增殖检测 | Cell-Light EdU Apollo567体外检测试剂盒 | RiboBio | C10310-1 |
| 细胞周期检测 | 细胞周期检测试剂盒 | KeyGEN BioTECH | KGA512 |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/7AAD凋亡检测试剂盒 | Multisciences (Lianke) Biotech | AP105-100-KIT |
| 流式分析 | Guava® easyCyte™流式细胞仪 | Merck KgaA | -- |
| BD AccuriC6流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 蛋白提取 | NE-PER™核浆蛋白提取试剂盒 | Pierce | 78833 |
| 免疫荧光 | Fisherbrand™显微镜盖玻片 | ThermoFisher | 12-542A |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | |
| 牛血清白蛋白 | BOSTER | AR0004 | |
| DAPI | Beyotime | C1005 | |
| 显微镜 | Nikon TE2000-U倒置显微镜 | Nikon Instruments | -- |
| 共聚焦显微镜 | Leica SP8激光共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| Western blot | Image J软件 | -- | -- |
| PFN2a抗体 | Enogene | E93047 | |
| CCNB1抗体 | CST | 4138 | |
| CCND1抗体 | CST | 2922 | |
| MyHC抗体 | BOSTER | BM0096 | |
| Myogenin抗体 | SANTA CRUZ | J2314 | |
| α-Actinin抗体 | GeneTex | GTX103219 | |
| Caspase 3 (H-277)抗体 | SANTA CRUZ | sc-7148 | |
| Cleaved caspase 3 (Asp175)抗体 | CST | 9661 | |
| p53抗体 | GeneTex | GTX70214 | |
| HDAC1抗体 | Bioss | bs-1414R | |
| Tubulin抗体 | Bioworld | AP0064 | |
| Lamin B1抗体 | Bioworld | AP6001 | |
| β-actin抗体 | Bioworld | BS6007M | |
| 山羊抗兔IgG (H+L) HRP二抗 | Bioworld | BS13278 | |
| 山羊抗小鼠IgG (H+L) HRP二抗 | Bioworld | BS12478 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗小鼠IgG (H+L) Cy3二抗 | Bioworld | BS10006 |
| 山羊抗兔IgG Alexa Fluor 647二抗 | Bioss | bs-0295G-AF647 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | C2C12细胞培养密度(增殖2×10^4/cm²,分化8×10^4/cm²),分化培养基含2%马血清,分化时间7天。 阅读提示:Methods 2.1节 |
| 基因编辑与细胞系构建 | CRISPR/Cas9系统使用MCP-ROSA26-CG01载体和PFN2a donor,嘌呤霉素筛选浓度2 μg/mL,筛选时间7天。 阅读提示:Methods 2.2节,图1 |
| 增殖检测 | EdU实验使用Cell-Light EdU Apollo567试剂盒,细胞密度2×10^4/cm²,培养24小时;细胞周期分析使用PI染色,密度同上。 阅读提示:Methods 2.5和2.6节,图2 |
| 凋亡检测 | 分化第3天使用Annexin V-APC/7AAD凋亡检测试剂盒,细胞密度8×10^4/cm²。 阅读提示:Methods 2.7节,图4 |
| Western blot | 抗体稀释浓度:PFN2a 1:1000, CCNB1 1:1000, CCND1 1:1000, MyHC 1:500, myogenin 1:200, α-Actinin 1:1000, caspase 3 1:1000, cleaved caspase 3 1:1000, p53 1:5000, HDAC1 1:1000, tubulin 1:5000, lamin B1 1:5000, β-actin 1:5000;二抗稀释:1:50000(HRP),1:200(荧光)。 阅读提示:Methods 2.8节,表4和表5 |
| 免疫荧光 | 分化第7天进行MyHC和α-Actinin免疫荧光,使用4%多聚甲醛固定,0.5% Triton X-100通透,5% BSA封闭,一抗4°C过夜,二抗室温2小时,DAPI染色30分钟。 阅读提示:Methods 2.10节,图3 |