验证自噬缺陷
确认Atg7敲除导致血管平滑肌细胞自噬功能受损。
通过Western blot检测ATG7、SQSTM1、ATG12-ATG5、MAP1LC3B表达;饥饿处理(EBSS)后检测MAP1LC3B-II和自噬小体形成;透射电镜观察自噬小体。
Defective autophagy in vascular smooth muscle cells accelerates senescence and promotes neointima formation and atherogenesis.
包含体外细胞实验(氧化应激、衰老、迁移、胶原检测)、体内动物模型(颈动脉结扎新生内膜模型、Apoe-/-动脉粥样硬化模型)及功能验证(siRNA、过表达),机制验证(NFE2L2通路、SQSTM1诱导衰老)。
小鼠主动脉血管平滑肌细胞(VSMC) 血管平滑肌细胞特异性Atg7敲除小鼠(atg7−/−) 颈动脉结扎诱导的新生内膜形成小鼠模型 Apoe−/−小鼠动脉粥样硬化模型
血管平滑肌细胞特异性Atg7敲除(Atg7F/FTagln-Cre+) 氧化应激处理:25 µmol/l tBHP或50 µg/ml oxLDL处理24小时 颈动脉结扎诱导损伤模型(5天或5周) 西方饮食喂养10或14周 NFE2L2沉默(siRNA)效率
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认Atg7敲除导致血管平滑肌细胞自噬功能受损。
通过Western blot检测ATG7、SQSTM1、ATG12-ATG5、MAP1LC3B表达;饥饿处理(EBSS)后检测MAP1LC3B-II和自噬小体形成;透射电镜观察自噬小体。
评估自噬缺陷对血管平滑肌细胞氧化应激诱导细胞死亡的影响。
使用tBHP或oxLDL处理VSMCs,检测细胞存活率、ROS产生、抗氧化酶表达及NFE2L2核转位;沉默Nfe2l2后检测细胞抗性。
研究自噬缺陷对VSMC形态、迁移和胶原合成的影响。
观察细胞形态和大小,测量蛋白含量,评估迁移能力(Oris迁移实验),检测TGFB和CXCL12表达,检测胶原总量和类型。
确定自噬缺陷是否诱导VSMC衰老及机制。
BrdU掺入实验检测增殖,细胞周期分析,SA-β-gal染色,Western blot检测CDKN2A、RB磷酸化、TP53乙酰化、CDKN1A,彗星实验检测DNA损伤;过表达SQSTM1验证其作用。
验证自噬缺陷对损伤后新生内膜形成的影响。
对Atg7+/+和atg7−/−小鼠进行左颈总动脉结扎,5天后检测MMP9、TGFB、CXCL12表达,5周后分析新生内膜面积、胶原含量、CDKN2A和SA-β-gal。
验证自噬缺陷对动脉粥样硬化发展的影响。
将Atg7+/+和atg7−/−小鼠与apoe−/−小鼠杂交,喂食西方饮食10或14周,分析斑块面积、坏死、凋亡、巨噬细胞含量、胶原含量及VSMC衰老标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Gibco Life Technologies | 11320-074 |
| 胎牛血清 | Sigma Aldrich | F6178 | |
| 氧化应激处理 | 氧化低密度脂蛋白 | -- | -- |
| 细胞凋亡处理 | 嘌呤霉素 | Sigma Aldrich | P8833 |
| 细胞活性检测 | 中性红 | -- | -- |
| ROS检测 | 羧基-H2DCFDA | Molecular Probes | I36007 |
| 细胞大小测量 | 钙黄绿素AM | Molecular probes | C3099 |
| 蛋白定量 | Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 |
| Western blot | Laemmli样品缓冲液 | Bio-Rad | 161-0737 |
| β-巯基乙醇 | Sigma Aldrich | M3148 | |
| NuPAGE 4-12% Bis-Tris凝胶 | Life Technologies | BG04120 | |
| Immobilon-P膜 | Millipore | IPVH304F0 | |
| 抗GSTA抗体 | Abcam | ab53940 | |
| 抗NFE2L2抗体 | Abcam | ab137550 | |
| 抗CDKN2A/p16抗体 | Abcam | ab54210 | |
| 抗CDKN1A/p21抗体 | Abcam | ab7960 | |
| 抗CXCL12抗体 | Bioss | bs-4938 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 14C10 | |
| 抗TGFB抗体 | Cell Signaling Technology | 3711 | |
| 抗磷酸化RB抗体 | Cell Signaling Technology | 8516 | |
| 抗MAP1LC3B抗体 | Nanotools | 0231-100 | |
| 抗NQO1抗体 | Novus Biologicals | NBP1-40663 | |
| 抗PARP1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7150 | |
| 抗CDKN2A/p16抗体(sc-1207) | Santa Cruz Biotechnology | sc-1207 | |
| 抗总RB抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-50 | |
| 抗ACTB抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| 抗ATG7抗体 | Sigma-Aldrich | A2856 | |
| 抗ATG5抗体 | Sigma-Aldrich | A0856 | |
| 抗SQSTM1/p62抗体 | Sigma-Aldrich | P0067 | |
| 抗乙酰化TP53抗体 | Sigma-Aldrich | SAB4503014 | |
| HRP偶联二抗 | Dako | -- | |
| 核浆分离 | NE-PER核和胞质提取试剂盒 | Thermo Scientific | 78833 |
| 明胶酶谱法 | RIPA裂解液 | Sigma Aldrich | R0278 |
| 酶谱明胶凝胶 | Life Technologies | EC6175 | |
| 考马斯亮蓝 | Merck | 115444 | |
| RNA提取 | Absolutely RNA小提试剂盒 | Agilent | 400800 |
| RNA质量分析 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| RT-qPCR | TaqMan基因表达检测 | Applied Biosystems | -- |
| 通用PCR预混液 | Applied Biosystems | 4324018 | |
| 基因转染 | 人主动脉平滑肌细胞核转染试剂盒 | Amaxa | VPC-1001 |
| ON-TARGETplus SMART Pool siRNA | Dharmacon | L-040766-00-0005 | |
| ON-TARGETplus对照pool | Dharmacon | D-001810-10-05 | |
| 基因过表达 | Platinum Pfx DNA聚合酶 | Invitrogen | 11708-013 |
| pEGFP-N3质粒 | Clontech | 6080-1 | |
| 衰老检测 | 衰老细胞组织化学染色试剂盒 | Sigma-Aldrich | CS0030 |
| 细胞周期分析 | BD FACScan流式细胞仪 | BD | -- |
| 组织学分析 | 抗LAMP2抗体 | BD PharMingen | 553322 |
| 抗剪切CASP3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 抗磷酸化RB抗体 | Cell Signaling Technology | 8516 | |
| 抗CDKN2A/p16抗体(sc-1207) | Santa Cruz Biotechnology | sc-1207 | |
| 抗TAGLN抗体 | Abcam | ab10135 | |
| 抗ACTA2抗体(FITC标记) | Sigma-Aldrich | A2547 | |
| 抗SQSTM1/p62抗体 | Sigma-Aldrich | P0067 | |
| ABC试剂 | Vector Laboratories | pk4001 | |
| 天狼星红 | Sigma Aldrich | 365548 | |
| 抗COL3A1抗体 | Biodesign | T33330G | |
| 核固红 | BDH | 34209 | |
| 抗ACTA2-FITC抗体 | Sigma Aldrich | F3777 | |
| 动物实验 | 西方型饮食 | Harlan Teklad | TD88137 |
| Superose 6色谱柱 | -- | -- | |
| 胆固醇检测试剂盒 | Randox | CH200 | |
| OCT包埋剂 | Thermo Scientific | Neg-50 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 氧化应激实验 | VSMC基因型(Atg7+/+ vs atg7−/−),tBHP浓度(25 µmol/l)或oxLDL浓度(50 µg/ml),处理时间(24 h),细胞代数(4-10代) 阅读提示:Methods: Cell culture 部分 |
| 细胞衰老分析 | BrdU处理时间(2 h),X-gal染色时间(24 h),细胞周期分析流程,CDKN2A和RB磷酸化检测 阅读提示:Methods: Analysis of cellular senescence 部分 |
| 迁移实验 | 细胞接种密度(2.5×10^4细胞/孔),迁移观察时间(24 h),结晶紫染色浓度(0.1%) 阅读提示:Methods: Analysis of proliferation, collagen amount and migration 部分 |
| 颈动脉结扎模型 | 结扎时间(5天或5周),小鼠基因型(Atg7+/+ vs atg7−/−),麻醉剂和镇痛剂使用(氯胺酮、甲苯噻嗪、丁丙诺啡) 阅读提示:Methods: Mouse studies 部分 |
| 动脉粥样硬化模型 | 饮食类型和持续时间(WD 10或14周),小鼠基因型(atg7−/− apoe−/−),分析部位(头臂动脉和主动脉根部) 阅读提示:Methods: Mouse studies 部分 |