构建NiONPs诱导的大鼠肝纤维化模型
确定NiONPs在体内对肝脏的影响,并分析转录组变化。
使用NiONPs处理雄性Wistar大鼠,建立肝纤维化模型,进行转录组测序和GO/KEGG富集分析。
Hsa_circ_0001944 Regulates FXR/TLR4 Pathway and Ferroptosis to Alleviate Nickel Oxide Nanoparticles-Induced Collagen Formation in LX-2 Cells.
包含大鼠模型和LX-2细胞模型,通过药物干预和过表达验证功能,并检测信号通路和铁死亡指标。
大鼠肝纤维化模型 LX-2细胞胶原沉积模型
NiONPs浓度:0, 1.25, 2.5, 5 μg/mL 药物处理:GW4064(5 μM)、TAK-242(10 μM)、Erastin(10 μM) 处理时间:12小时 过表达质粒:hsa_circ_0001944(2.5 μg/well)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定NiONPs在体内对肝脏的影响,并分析转录组变化。
使用NiONPs处理雄性Wistar大鼠,建立肝纤维化模型,进行转录组测序和GO/KEGG富集分析。
在体外模拟NiONPs诱导的肝星状细胞胶原沉积。
用不同浓度NiONPs处理LX-2细胞,检测胶原沉积相关指标。
验证FXR/TLR4通路和铁死亡在胶原沉积中的作用。
分别用FXR激动剂GW4064、TLR4抑制剂TAK-242和铁死亡激动剂Erastin联合NiONPs处理LX-2细胞,检测相关指标。
验证hsa_circ_0001944通过调控FXR/TLR4通路和铁死亡影响胶原沉积。
将hsa_circ_0001944过表达质粒转染LX-2细胞,再予NiONPs处理,检测相关基因和蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Viva Cell Biosciences | -- | |
| 抗生素/抗真菌溶液 | Viva Cell Biosciences | -- | |
| 药物处理 | GW4064 | APExBIO Technology | B1527 |
| TAK-242 | APExBIO Technology | A3850 | |
| Erastin | GLPBIO | GC16630 | |
| 细胞转染 | M5 HiPer Lipo2000转染试剂 | Mei5bio | MF135-01 |
| RT-qPCR | RNAiso Plus试剂 | TaKaRa | -- |
| PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | TaKaRa | -- | |
| STBR Premix Ex Taq II(Tli RNaseH Plus) | TaKaRa | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Boster Bio | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Boster Bio | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | APExBIO | -- | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | #23227 | |
| 5× SDS上样缓冲液 | Boster Bio | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| ChemiDoc XRS成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 超敏电化学发光试剂盒 | UElandy | -- | |
| 流式分析 | 细胞周期检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A352 |
| BD Accuri C6 Plus流式细胞仪 | BD | -- | |
| 荧光探针 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| DCFH-DA荧光探针 | -- | -- | |
| BTFMD荧光探针 | Lanzhou University | -- | |
| 铁离子检测 | 总铁离子比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K880-M |
| 亚铁离子比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M | |
| 动物实验 | 超声波匀浆器 | Cole-Parmer | CP750 |
| NiONPs处理 | 氧化镍纳米颗粒 | ST-nano science and technology Co., Ltd. | -- |
| Western blot | NR1H4(FXR)抗体 | Signalway Antibody | #31507 |
| NR0B2(SHP)抗体 | Signalway Antibody | #32460 | |
| TLR4抗体 | Signalway Antibody | #35463 | |
| MyD88抗体 | Signalway Antibody | #32107 | |
| NCOA4抗体 | Signalway Antibody | #32981 | |
| GPX4抗体 | Signalway Antibody | #32506 | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | #6956 | |
| p-NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | #3033 | |
| IL-1β抗体 | Cell Signaling Technology | #12242 | |
| TNF-α抗体 | Cell Signaling Technology | #3707 | |
| MMP2抗体 | Signalway Antibody | #29090 | |
| COL1A1抗体 | Cell Signaling Technology | #81375 | |
| β-actin抗体 | Signalway Antibody | #21338 | |
| 羊抗兔IgG二抗(HRP标记) | Signalway Antibody | #L3012 | |
| 羊抗鼠IgG二抗(HRP标记) | Signalway Antibody | #L3032 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 大鼠模型 | 大鼠品系(Wistar)、性别(雄性)、体重范围(190-230 g)、NiONPs剂量(0.24 mg/kg)、给药方式 阅读提示:Methods 2.2 |
| 细胞模型 | LX-2细胞来源、培养条件(DMEM+10%FBS+1%抗生素)、NiONPs浓度(0, 1.25, 2.5, 5 μg/mL)、处理时间(12h) 阅读提示:Methods 2.5, 2.6.1 |
| 药物处理 | GW4064浓度(5 μM)、TAK-242浓度(10 μM)、Erastin浓度(10 μM)、处理时间(12h) 阅读提示:Methods 2.6.2 |
| 过表达实验 | 质粒浓度(2.5 μg/well)、转染试剂体积(7.5 μL/well)、转染时间(12h)、恢复时间(24h)、NiONPs浓度(5 μg/mL) 阅读提示:Methods 2.6.3 |
| Western blot | 抗体稀释比例、蛋白上样量、孵育条件 阅读提示:Methods 2.10, Table 2 |