患者样本分析RASSF1A表达与甲基化
验证RASSF1A在银屑病皮损中的表达和甲基化状态
对银屑病患者皮损和正常皮肤进行免疫组化、qRT‐PCR、Western blot和甲基化特异性PCR检测。
RAS-association domain family 1A regulates the abnormal cell proliferation in psoriasis via inhibition of Yes-associated protein.
包括患者样本、M5诱导细胞模型和咪喹莫特小鼠模型的多个证据层级,并包含功能验证(增殖、周期、凋亡)和机制验证(Hippo通路及下游信号)
人表皮角质形成细胞(KC)经M5刺激的银屑病细胞模型 BALB/c小鼠经局部咪喹莫特诱导的银屑病模型 银屑病患者皮肤病变和正常皮肤组织
M5浓度:10 ng/mL刺激48小时 5‐Aza‐CdR浓度:5、10、20 μmol/L 咪喹莫特剂量:62.5 mg/天,连续7天 RASSF1A过表达慢病毒感染MOI=200 银屑病患者样本:22例,正常对照19例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证RASSF1A在银屑病皮损中的表达和甲基化状态
对银屑病患者皮损和正常皮肤进行免疫组化、qRT‐PCR、Western blot和甲基化特异性PCR检测。
评估RASSF1A过表达对YAP表达及磷酸化的影响
用M5刺激人表皮角质形成细胞,并用RASSF1A过表达慢病毒感染,检测RASSF1A、YAP及Hippo通路蛋白表达。
验证去甲基化对RASSF1A和YAP表达的影响
用不同浓度5‐Aza‐CdR处理M5诱导的银屑病细胞,检测RASSF1A甲基化水平、RASSF1A和YAP表达。
验证RASSF1A对银屑病细胞功能的影响
通过MTT检测增殖、流式细胞术检测周期和凋亡,Western blot检测周期和凋亡相关蛋白。
在体内验证5‐Aza‐CdR对银屑病样皮损和RASSF1A/YAP表达的影响
用咪喹莫特诱导BALB/c小鼠银屑病模型,并局部涂抹不同浓度5‐Aza‐CdR,观察皮损变化,检测组织学改变和蛋白表达。
探究RASSF1A对炎症反应和关键信号通路的影响
ELISA检测细胞上清和小鼠血清中IL‐1β、IL‐6、IL‐17、IL‐23浓度,Western blot检测AKT、ERK、STAT3、NF‐κB通路蛋白磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 角质形成细胞培养基 | ScienCell | -- |
| 细胞刺激 | M5混合物 (IL-1α, IL-17, IL-22, TNF-α, oncostatin M) | PeproTech | -- |
| 药物处理 | 5-氮杂胞苷 | MedChemExpress | -- |
| 病毒包装 | RASSF1A过表达慢病毒 | Shenyang Wanleibio Technology | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| DNA甲基化检测 | EZ DNA甲基化试剂盒 | ZYMO Research | -- |
| 细胞增殖检测 | MTT试剂 | 文中未明确说明 | -- |
| 细胞周期检测 | RNA酶A | 文中未明确说明 | -- |
| 细胞周期和凋亡检测 | 碘化丙啶 | 文中未明确说明 | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | 文中未明确说明 | -- |
| Western blotting | RASSF1A抗体 | Abcam | ab23950 |
| YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 14074 | |
| pS127-YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 13008 | |
| Cyclin A抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-596 | |
| Cyclin B1抗体 | Proteintech | 55004-1-AP | |
| Cyclin D1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-246 | |
| Cyclin E抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-25303 | |
| CDK1抗体 | Wanleibio | WL02373 | |
| cleaved-caspase-3抗体 | Wanleibio | WL02348 | |
| Bcl-2抗体 | Wanleibio | WL01556 | |
| BAX抗体 | Proteintech | 50599-2-lg | |
| p73抗体 | Wanleibio | WL01604 | |
| p53抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-126 | |
| p21抗体 | Wanleibio | WL0362 | |
| AKT抗体 | Wanleibio | WL0003b | |
| p-AKT抗体 | Wanleibio | WLP001a | |
| ERK抗体 | Wanleibio | WL01864 | |
| p-ERK抗体 | Wanleibio | WLP1512 | |
| STAT3抗体 | Wanleibio | WL03207 | |
| p-STAT3抗体 | Wanleibio | WLP2412 | |
| NF-κB P65抗体 | Wanleibio | WL01980 | |
| LATS1/2抗体 | ImmunoWay Biotechnology | YT2543 | |
| p-LATS1/2抗体 | ImmunoWay Biotechnology | YP1222 | |
| MST1/2抗体 | Signalway Antibody | 37462 | |
| p-MST1/2抗体 | Bioss | bs-3294R | |
| β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| Histone H3抗体 | Wanleibio | -- | |
| 动物实验 | 咪喹莫特乳膏 | Hubei Keyi Pharmaceutical Co., Ltd. | -- |
| 凡士林 | Nanchang Baiyun Pharmaceutical Co., Ltd. | -- | |
| 流式分析 | FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 图像分析 | Image Pro-Plus 6.0图像分析软件 | Media Cybernetics | -- |
| 统计分析 | SPSS 19.0统计软件 | SPSS, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本 | 银屑病患者22例(12男10女),正常对照19例(10男9女);活检组织来源和病理诊断确认 阅读提示:Materials and Methods 2.1 |
| 细胞模型 | 人表皮角质形成细胞(ScienCell)培养基;M5浓度10 ng/mL,刺激48小时 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| 甲基化抑制处理 | 5‐Aza‐CdR浓度:5、10、20 μmol/L;处理时间:文中未明确说明 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| RASSF1A过表达慢病毒感染 | MOI=200;感染后48小时检测 阅读提示:Materials and Methods 2.4 |
| 小鼠模型 | 6-8周龄雌性BALB/c小鼠,体重18-20g;咪喹莫特62.5 mg/天涂抹背部,连续7天;对照组涂抹等量凡士林;5‐Aza‐CdR浓度5、10、20 μmol/L,与咪喹莫特同时涂抹 阅读提示:Materials and Methods 2.5 |
| 细胞增殖检测(MTT) | 细胞接种密度5×10^3细胞/200μL;检测时间24、48、72小时;MTT孵育4小时;DMSO溶解后570nm测吸光度 阅读提示:Materials and Methods 2.9 |
| 细胞周期和凋亡检测 | 细胞周期:75%乙醇固定,RNaseA 100 μg/mL,PI 50 μg/mL,37℃孵育30分钟;凋亡:Annexin V‐FITC和PI染色 阅读提示:Materials and Methods 2.10, 2.11 |
| ELISA检测细胞因子 | 检测IL‐1β, IL‐6, IL‐17, IL‐23;细胞上清和小鼠血清样本 阅读提示:Materials and Methods 2.12 |