GFAT1连接的TAB1谷氨酰化维持p38 MAPK激活并在葡萄糖饥饿下促进肺癌细胞存活

GFAT1-linked TAB1 glutamylation sustains p38 MAPK activation and promotes lung cancer cell survival under glucose starvation.

作者信息Shupei Wei, Qin Zhao, Ke Zheng, Peiying Liu, Nannan Sha, Yingzi Li, Chunmin Ma, Jingjie Li, Lingang Zhuo, Guanxin Liu, Wenhua Liang, Yuhui Jiang, Tao Chen, Nanshan Zhong
PMID35945223
发布时间2022-08-09
DOI10.1038/s41421-022-00423-0

实验完整度

包含体外细胞实验、体内异种移植瘤模型和临床样本分析,明确功能验证和机制验证。

主要模型

肺腺癌细胞系A549和H1299 裸鼠异种移植瘤模型 人肺腺癌组织样本

重点核对

GFAT1表达在肺腺癌中上调(基于GEPIA数据库) 葡萄糖剥夺而非谷氨酰胺剥夺抑制GFAT1敲除细胞存活 GFAT1缺失抑制p38 MAPK激活,MKK3/6和MKK4活性不受影响 外源谷氨酸而非GlcN恢复rGFAT1-H577A细胞的p38激活和存活 TAB1 S438磷酸化与TAB1谷氨酰化是p38激活和肿瘤生长所必需

摘要

细胞代谢重编程被视为癌症的标志之一。己糖胺生物合成途径(HBP)在细胞中充当“能量传感器”以调节代谢通量。谷氨酰胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶1(GFAT1)是HBP的限速酶,在多种人类癌症中表达升高,但其在肿瘤发生中的确切和具体作用仍不清楚,需要进一步研究。p38丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)是应激信号通路的重要组分,在细胞命运决定中发挥关键作用,但其在营养应激下激活的潜在机制也仍然难以捉摸。在本研究中,我们发现葡萄糖剥夺以TAB1 S438磷酸化依赖性方式诱导GFAT1与转化生长因子β激活激酶1结合蛋白1(TAB1)的相互作用。随后,GFAT1与TAB1的结合促进TTLL5–GFAT1–TAB1复合物的形成,GFAT1产生谷氨酸的代谢活性进一步促进TTLL5介导的TAB1谷氨酰化。因此,TAB1谷氨酰化促进p38α MAPK的招募,从而驱动p38 MAPK激活。生理上,GFAT1-TAB1-p38信号促进自噬发生,从而保护肿瘤细胞在葡萄糖缺乏下的存活。临床分析表明,GFAT1和TAB1 S438磷酸化水平均与肺腺癌患者的不良预后相关。这些发现共同揭示了营养应激下p38 MAPK信号由代谢酶调控的未识别机制,并为靶向GFAT1治疗癌症提供了理论合理性。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
GFAT1在葡萄糖饥饿下如何通过非代谢功能调控p38 MAPK激活并促进肺癌细胞存活?
核心机制
葡萄糖缺乏诱导TAB1 S438磷酸化,促进GFAT1与TAB1结合,形成TTLL5–GFAT1–TAB1复合物,GFAT1产生的谷氨酸促进TTLL5介导的TAB1 E212谷氨酰化,增强TAB1与p38α的相互作用,导致p38 MAPK自磷酸化激活,进而促进自噬和细胞存活。
主要证据
在A549和H1299细胞中通过GFAT1敲除、回补实验、免疫共沉淀、体外激酶和谷氨酰化实验证明机制;裸鼠移植瘤实验验证体内作用;人肺腺癌组织芯片显示GFAT1表达和TAB1 pS438水平与p-p38正相关且与不良预后相关。
研究意义
揭示了代谢酶GFAT1通过谷氨酰化调控p38 MAPK的新机制,为靶向GFAT1治疗肺癌提供了理论基础。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

验证GFAT1对细胞存活和p38激活的作用

确定GFAT1在葡萄糖缺乏下对细胞存活和p38 MAPK激活的影响

使用CRISPR-Cas9敲除GFAT1,在葡萄糖或谷氨酰胺剥夺条件下培养A549和H1299细胞,检测细胞活力和p38磷酸化水平;使用p38抑制剂BIRB796和处理MKK6E过表达回补实验。

2

鉴定GFAT1–TAB1相互作用及其磷酸化依赖

确定GFAT1与TAB1相互作用是否依赖TAB1磷酸化,以及哪些激酶参与

通过Flag-GFAT1免疫沉淀质谱鉴定TAB1,内源Co-IP验证相互作用,CIP处理检测磷酸化依赖性,GST-pull down验证相互作用,使用激酶抑制剂和TAB1突变体分析关键磷酸化位点。

3

验证GFAT1促进TTLL5介导的TAB1谷氨酰化

研究GFAT1是否通过形成TTLL5–GFAT1–TAB1复合物促进TAB1谷氨酰化

检测GFAT1、TAB1和TTLL5之间的相互作用,通过siRNA敲低TTLL5,检测TAB1谷氨酰化水平(GT335抗体),突变TAB1 E212等位点,体外谷氨酰化实验。

4

验证GFAT1代谢活性产生谷氨酸对TAB1谷氨酰化的贡献

确定GFAT1催化产生的谷氨酸是否是TAB1谷氨酰化和p38激活所必需

使用rGFAT1-H577A酶活性缺陷突变体,补充外源谷氨酸或GlcN,检测TAB1谷氨酰化、TAB1-p38相互作用和p38磷酸化,并用CoCl2增强CCP活性作为对照。

5

验证GFAT1-TAB1-p38轴对自噬和细胞存活的影响

确定p38激活是否通过自噬促进细胞存活

使用p38抑制剂BIRB796和自噬抑制剂氯喹,检测自噬标志物LC3-II和p62,评估细胞活力;在rTAB1突变体细胞中补充谷氨酸或过表达MKK6E观察对细胞存活和自噬的影响。

6

体内肿瘤生长验证和临床相关性分析

验证TAB1磷酸化和谷氨酰化对肿瘤生长的影响,并评估临床意义

将A549细胞(表达WT rTAB1或突变体)皮下注射到裸鼠,测量肿瘤体积;免疫组化检测人肺腺癌组织芯片中GFAT1、TAB1 pS438和p-p38水平,并进行生存分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI1640培养基----
胎牛血清----
CCK8试剂盒YEASEN40203ES60
EdU试剂盒Beyotime--
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
GFAT1抗体Abcamab125069
TAB1抗体Abcamab76412
p38α抗体Abcamab59461
TTLL5抗体Abcamab187697
β-actin抗体Abcamab8227
p62抗体Santa Cruzsc-28359
O-GlcNAc抗体Santa Cruzsc-59623
LC3B抗体Santa Cruzsc-271625
p-p38抗体Santa Cruzsc-7973
Flag抗体SigmaF1804
p-MAPKAPK-2抗体Cell Signaling Technology3044
p-JunB抗体Cell Signaling Technology8053
p-Acc抗体Cell Signaling Technology11818
AMPK抗体Cell Signaling Technology2603
JNK抗体Cell Signaling Technology9252
p38α抗体Cell Signaling Technology9218
p-AMPK抗体Cell Signaling Technology50081
p-JNK抗体Cell Signaling Technology4668
p-MKK3/6抗体Cell Signaling Technology9231
LC3B抗体Cell Signaling Technology3868
p-p38抗体Cell Signaling Technology4511
His抗体Cell Signaling Technology9991
GST抗体Cell Signaling Technology5475
O-GlcNAc抗体Cell Signaling Technology9875
TAB1抗体Sangon BiotechD122651
HA抗体Sangon BiotechD191044
GT335抗体Adipogen--
p38α抗体Signalway Antibody48644
β-actin抗体Signalway Antibody49294
TAB1 Ser438磷酸化抗体AffinityAF8324
GFAT1抗体Proteintech14132-1-AP
Caspase 3抗体Proteintech19677-1-AP
谷氨酸ELISA试剂盒SolarbioBC1585
Ni-NTA琼脂糖树脂----
GST-Sefinose树脂----
Ultrafree-15离心过滤器Millipore--
BIRB796----
SB203580----
SP600125----
Compound C----
氯喹----
谷氨酸----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养和基因敲除
细胞系A549和H1299的来源和STR鉴定;GFAT1 sgRNA序列;TAB1 shRNA序列;培养基RPMI1640+10% FBS
阅读提示:Materials and Methods: Cell culture, DNA constructs and mutagenesis
葡萄糖剥夺实验
葡萄糖剥夺时间(例如8h, 12h, 36h);外源谷氨酸或GlcN浓度;抑制剂浓度(BIRB796, SB203580, SP600125, Compound C)
阅读提示:Figure legends 1-4, Materials and Methods: Cell culture
免疫共沉淀和蛋白互作
细胞裂解液配方;抗体和蛋白G beads孵育时间;CIP处理条件;GFAT1和TAB1突变体
阅读提示:Materials and Methods: Immunoprecipitation and immunoblotting
蛋白谷氨酰化检测
GT335抗体使用;TTLL5 siRNA序列;TAB1突变的构建;CoCl2浓度
阅读提示:Materials and Methods: DNA constructs, antibodies, immunoprecipitation; Figure 3
体内肿瘤模型
裸鼠品系和年龄;注射细胞数和体积;肿瘤体积测量公式;每组动物数(n=7)
阅读提示:Materials and Methods: Mice; Figure 6
临床样本分析
组织芯片的病例数(87例);GFAT1和TAB1 pS438抗体的使用浓度;免疫组化评分标准;生存分析和Cox回归方法
阅读提示:Materials and Methods: Immunohistochemistry; Figure 6