分离和鉴定活性化合物
从PCP中筛选并鉴定具有自噬增强作用的活性成分
采用活性指导的分离方法,从PCP不同极性部位中分离出TA、TB、PHG、PGHG,并通过UHPLC-DAD-TOF/MS和NMR鉴定结构。
Targeting microglial autophagic degradation of the NLRP3 inflammasome for identification of thonningianin A in Alzheimer's disease.
包含体外细胞实验(BV-2、原代小胶质细胞、神经元)、线虫模型和APP/PS1小鼠模型,并进行机制验证(AMPK/ULK1和Raf/MEK/ERK通路)及功能验证(认知行为、病理改善)。
BV-2小胶质细胞 小鼠原代小胶质细胞 APP/PS1转基因小鼠 AD线虫模型(CL4176、CL2331、BR5270等)
TA给药剂量(体外2.5-10 μM,小鼠0.25-1.0 mg/kg) NLRP3炎症小体激活和自噬标记物(LC3、p62)检测 信号通路抑制剂(CC、SBI、SCH、LY)的使用 线虫麻痹实验和APP/PS1小鼠认知行为测试
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从PCP中筛选并鉴定具有自噬增强作用的活性成分
采用活性指导的分离方法,从PCP不同极性部位中分离出TA、TB、PHG、PGHG,并通过UHPLC-DAD-TOF/MS和NMR鉴定结构。
验证TA是否诱导小胶质细胞自噬
通过Western blot检测LC3-II转换、GFP-LC3点状结构计数、tfLC3自噬流检测、透射电镜观察自噬体,并使用自噬抑制剂(LY、HCQ)和Atg7敲除MEF细胞验证抑制效果。
研究TA诱导自噬依赖的信号通路
检测AMPK、ULK1、Raf、MEK、ERK的磷酸化水平,并使用AMPK抑制剂(CC)、ULK1抑制剂(SBI)、ERK抑制剂(SCH)验证通路参与。
研究TA是否通过自噬降解NLRP3炎症小体
在Aβ(1–42)诱导的BV-2细胞中,检测NLRP3、ASC、caspase-1、IL-1β等表达,用LC3与ASC共定位、自噬抑制剂和通路抑制剂验证TA的作用依赖于自噬和AMPK/ULK1、Raf/MEK/ERK通路。
验证TA能否减轻由微胶质炎症或Aβ引起的神经元损伤
将TA处理过的BV-2细胞条件培养基转移到PC-12细胞和小鼠原代海马神经元中,用MTT、Hoechst/PI染色和流式细胞术检测细胞活力凋亡;另用Aβ直接处理神经元检测死亡,并检测神经元自噬。
在体内模型中验证TA诱导自噬和神经保护作用
检测线虫p62水平、GFP-LGG-1点状结构、食物感知行为、Aβ沉积和Aβ诱导的麻痹,并用RNAi敲低自噬相关基因(unc-51、bec-1、vps-34)验证机制。
验证TA在哺乳动物模型中的治疗效果
对6月龄APP/PS1小鼠腹腔注射TA(0.25、0.5、1.0 mg/kg)2个月,进行Morris水迷宫测试,检测脑内Aβ、神经元凋亡、NLRP3炎症小体、自噬相关蛋白和信号通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | Gibico | -- | |
| 胎牛血清 | Gibico | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibico | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT | -- | -- |
| 自噬检测 | pEGFP-LC3质粒 | -- | -- |
| mRFP-GFP串联荧光标记LC3(tfLC3)质粒 | -- | -- | |
| 炎症小体检测 | pEGFP-N1-NLRP3质粒 | PPL | PPL00151-2a |
| pEGFP-N1-caspase-1质粒 | PPL | PPL00392-2e | |
| mCherry-C1-ASC质粒 | PPL | PPL01752-2b | |
| 信号通路抑制 | LY294002 | Topscience | T2008 |
| 化合物C | Topscience | T6146 | |
| SCH772984 | Topscience | T606 | |
| SBI-0206925 | Topscience | T2128 | |
| 自噬抑制 | 羟氯喹 | Topscience | T0951 |
| Western blot | LC3B抗体 | MBL | PM036 |
| Caspase-9抗体 | MBL | 0039 | |
| p-AMPK抗体 | CST | 50071 | |
| AMPK抗体 | CST | 5832 | |
| p-mTOR抗体 | CST | 5536 | |
| mTOR抗体 | CST | 2983 | |
| p-Raf抗体 | CST | 2696 | |
| Raf抗体 | CST | 9433 | |
| p-MEK抗体 | CST | 9154 | |
| MEK抗体 | CST | 9122 | |
| p-ERK抗体 | CST | 4370 | |
| ERK抗体 | CST | 4695 | |
| p-ULK1 (Ser555)抗体 | CST | 5869 | |
| p-ULK1 (Ser757)抗体 | CST | 6888 | |
| Bax抗体 | CST | 14796 | |
| Bcl-2抗体 | CST | 3498 | |
| IL-1β抗体 | CST | 12242 | |
| NLRP3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-134306 | |
| caspase-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-56036 | |
| ASC抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-514414 | |
| β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8432 | |
| ULK1抗体 | Abmart | T56902S | |
| 免疫荧光 | CD45抗体 | Abcam | ab-208022 |
| TREM2抗体 | Signalway Antibody | 29208 | |
| GFAP抗体 | Bioss | bs-0199R | |
| 分离分析 | 超高效液相色谱-二极管阵列检测-飞行时间质谱联用 | Agilent | -- |
| 核磁共振 | -- | -- | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| 细胞培养 | Exfect转染试剂 | Vazyme Biotech | -- |
| 固定与封片 | FluorSave封片剂 | Calbiochem | -- |
| 透射电镜 | EMbed 812包埋试剂盒 | Electron Microscopy Sciences | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | CST | -- |
| Bradford试剂 | Bio-Rad | -- | |
| 超敏ECL化学发光检测试剂 | 4A Biotech | -- | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| 荧光显微镜 | Leica DM6B荧光显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 定量PCR | Prime Script RT试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| 细胞培养 | Neurobasal-A培养基 | Procell | -- |
| DM/F12培养基 | Procell | -- | |
| B-27补充剂 | -- | -- | |
| 线虫实验 | M9缓冲液 | -- | -- |
| 免疫组化 | DAB显色试剂盒 | -- | -- |
| Morris水迷宫 | Morris水迷宫系统 | Shanghai XinRuan Information Technology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养及药物处理 | 细胞系(BV-2、PC-12、原代细胞)的来源和培养条件;TA浓度(2.5-10 μM)和处理时间(24 h)。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture; Results: 'TA induces autophagy flux...' |
| 自噬活性检测 | GFP-LC3质粒转染、LC3-II/LC3-I比值检测;自噬流分析(tfLC3、LysoTracker等);是否使用自噬抑制剂(LY、HCQ)。 阅读提示:Materials and methods: Quantification of GFP-LC3 puncta; tfLC3 detection; Results: Fig. 1 |
| 信号通路验证 | 是否检测AMPK、ULK1、ERK等磷酸化水平;是否使用通路抑制剂(CC、SCH、SBI)及其浓度和时间。 阅读提示:Materials and methods: Western blot; Results: Fig. 2 |
| NLRP3炎症小体检测 | Aβ(1-42)浓度和预处理时间;是否检测NLRP3、ASC、caspase-1、IL-1β等蛋白表达及分泌水平。 阅读提示:Materials and methods: Preparation of Aβ; Results: Fig. 3 |
| 线虫实验 | 线虫株(如CL4176、CL2331)和处理方式(TA浓度、温度、时间);瘫痪评价标准。 阅读提示:Materials and methods: C. elegans strains; Paralysis assay; Results: Fig. 6 |
| 小鼠实验 | APP/PS1小鼠年龄、性别、给药剂量(0.25, 0.5, 1.0 mg/kg)和给药途径(腹腔注射)及疗程(2个月)。 阅读提示:Materials and methods: APP/PS1 mice and drug administration; Results: Fig. 7, 8 |