p38α介导的磷酸化与PRMT1介导的精氨酸甲基化在驱动TDP-43蛋白病中的相反作用

Opposing roles of p38α-mediated phosphorylation and PRMT1-mediated arginine methylation in driving TDP-43 proteinopathy.

作者信息Mari Aikio, Hana M Odeh, Heike J Wobst, Bo Lim Lee, Úna Chan, Jocelyn C Mauna, Korrie L Mack, Bradley Class, Thomas A Ollerhead, Alice F Ford, Edward M Barbieri, Ryan R Cupo, Lauren E Drake, Joshua L Smalley, Yuan-Ta Lin, Stephanie Lam, Reuben Thomas, Nicholas Castello, Ashmita Baral, Jenna N Beyer, Mohd A Najar, John Dunlop, Aaron D Gitler, Ashkan Javaherian, Julia A Kaye, George M Burslem, Dean G Brown, Christopher J Donnelly, Steven Finkbeiner, Stephen J Moss, Nicholas J Brandon, James Shorter
PMID39817908
期刊Cell Rep
发布时间2025-01-28
DOI10.1016/j.celrep.2024.115205

实验完整度

包含体外激酶/甲基化实验、细胞水平功能验证、患者来源iMN模型、原代神经元生存分析等多个独立证据层级,并涉及机制验证。

主要模型

SH-SY5Y人神经母细胞瘤细胞 NSC-34小鼠运动神经元样细胞 小鼠原代皮层神经元 患者来源iPSC衍生运动神经元(iMNs)

重点核对

p38α抑制剂VX-745浓度(0.3-9μM)及DMSO对照 MG-132浓度(0.5μM)处理iMNs诱导应激 TDP-43A382T iMNs与基因校正对照 C9ORF72扩增iMNs与对照 化合物1浓度(0.1-10μM)处理SH-SY5Y细胞

摘要

肌萎缩侧索硬化(ALS)是一种毁灭性的神经退行性疾病,通常以过度磷酸化的TDP-43不溶性包涵体为特征。毒性TDP-43积累的机制尚不清楚。p38丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)的持续激活与ALS有关。然而,p38 MAPK如何影响TDP-43蛋白病尚不清楚。在此,我们表明p38α MAPK抑制可减少病理性TDP-43磷酸化、聚集、细胞质错误定位和神经毒性。值得注意的是,p38α MAPK抑制可减轻多种ALS患者来源运动神经元中的异常TDP-43表型。p38α MAPK在病理性S409/S410和S292位点磷酸化TDP-43,这减少了TDP-43液-液相分离(LLPS),但允许病理性TDP-43聚集。此外,我们确定PRMT1在R293位点甲基化TDP-43。重要的是,S292磷酸化减少R293甲基化,而R293甲基化减少S409/S410磷酸化。值得注意的是,R293甲基化允许TDP-43 LLPS并减少病理性TDP-43聚集。因此,减少p38α介导的TDP-43磷酸化并促进PRMT1介导的R293甲基化的策略可能对ALS和相关TDP-43蛋白病具有治疗效用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
p38α MAPK和PRMT1介导的翻译后修饰如何影响TDP-43蛋白病?
核心机制
p38α磷酸化TDP-43于S292和S409/S410,减少LLPS并促进聚集;PRMT1甲基化R293,促进LLPS并抑制聚集;S292磷酸化与R293甲基化相互抑制。
主要证据
SH-SY5Y细胞中基因敲低/过表达、体外激酶和甲基化实验、患者来源iMN模型、原代神经元生存分析等。
研究意义
减少p38α介导的磷酸化并促进PRMT1介导的R293甲基化可能对ALS/FTD及TDP-43蛋白病具有治疗效用。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

p38α抑制对TDP-43聚集的影响

验证p38α是否调控TDP-43聚集和磷酸化。

使用siRNA敲低p38α或p38α抑制剂处理SH-SY5Y细胞,检测TDP-43在RIPA和尿素组分中的水平。

2

p38α抑制对TDP-43毒性的影响

验证p38α抑制能否减轻TDP-43诱导的细胞毒性。

NSC-34细胞表达TDP-43并用化合物1处理,检测LDH释放。

3

p38α抑制对神经元生存的影响

验证p38α抑制能否缓解TDP-43诱导的神经退行性变。

原代皮层神经元表达TDP-43M337V和mApple,用VX-745处理,进行纵向成像和生存分析。

4

p38α抑制在患者来源iMN中的验证

验证p38α抑制能否改善患者来源运动神经元的异常TDP-43表型。

使用TDP-43A382T和C9ORF72扩增iMNs,用VX-745处理,检测细胞死亡率和TDP-43亚细胞分布。

5

p38α对TDP-43的直接磷酸化

验证p38α是否直接磷酸化TDP-43并确定位点。

免疫共沉淀验证相互作用,体外激酶实验和质谱分析确定磷酸化位点。

6

S292磷酸化对TDP-43聚集的影响

验证S292磷酸化是否影响TDP-43聚集和磷酸化。

在SH-SY5Y细胞中表达TDP-43磷酸化模拟突变体S292E等,分析聚集和磷酸化水平。

7

PRMT1介导的R293甲基化的验证

验证TDP-43是否被PRMT1甲基化以及位点。

敲低PRMT1、使用甲基转移酶抑制剂,免疫沉淀检测甲基化水平;体外甲基化实验和质谱分析。

8

磷酸化和甲基化模拟突变对LLPS和聚集的影响

比较磷酸化和甲基化对TDP-43 LLPS和聚集的相反作用。

使用重组TDP-43-MBP蛋白进行体外液滴形成和聚集实验。

9

磷酸化与甲基化之间的crosstalk

验证S292磷酸化与R293甲基化之间的相互影响。

表达TDP-43突变体、敲低p38α或过表达PRMT1,检测甲基化和磷酸化水平。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
最低必需培养基ThermoFisher Scientific11095080
杜氏改良 Eagle 培养基ThermoFisher Scientific10566016
化合物1AstraZeneca--
VX-745Tocris--
MG-132Millipore SigmaM7449
腺苷二醛Millipore SigmaA7154
Fugene HD转染试剂PromegaE2311
Lipofectamine 3000转染试剂ThermoFisher ScientificL3000008
Lipofectamine RNAiMAX转染试剂Invitrogen13778030
RIPA缓冲液Boston BioProductsBP-115
亚细胞蛋白分级分离试剂盒ThermoFisher Scientific78840
抗TDP-43抗体Proteintech10782-2-AP
抗磷酸化TDP-43 (S409/S410)抗体Cosmo BioCAC-TIP-PTD-M01
抗p38 MAPK抗体Cell Signaling Technology9212
抗COX IV抗体Cell Signaling Technology4850
抗Histone H3抗体Cell Signaling Technology3638
抗单甲基精氨酸抗体Cell Signaling Technology8711
抗不对称二甲基精氨酸抗体Cell Signaling Technology13522
抗对称二甲基精氨酸抗体Cell Signaling Technology13222
抗PRMT1抗体Cell Signaling Technology2449
抗GAPDH抗体Proteintech60004-1-Ig
抗FLAG抗体SigmaF1804
抗FLAG M2磁珠Millipore SigmaM8823
Dynabeads蛋白A磁珠ThermoFisher Scientific10001D
Ni-NTA琼脂糖Qiagen30210
淀粉树脂New England BioLabsE8021S
重组人TDP-43ProteintechAg13119
重组活性p38αSignalChemM39-10BG
重组人PRMT1蛋白Abcamab89007
S-腺苷甲硫氨酸SigmaA7007
来自明串珠菌的葡聚糖Millipore Sigma31392
Pierce LDH细胞毒性检测试剂盒ThermoFisher Scientific88953
CyQUANT LDH细胞毒性检测试剂盒ThermoFisher ScientificC20300
mTESR培养基StemCell Technologies05825
Neurobasal培养基Gibco12348017

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
p38α抑制的细胞实验
SH-SY5Y细胞转染TDP-43M337V后,siRNA敲低p38α或化合物1处理浓度(0.1, 1, 10μM)和时间(24, 48小时)
阅读提示:STAR Methods, 'SH-SY5Y transfections and inhibition of p38α MAPK'
患者来源iMN实验
iMN分化天数、MG-132处理浓度(0.5μM)和VX-745处理浓度(1μM)
阅读提示:STAR Methods, 'MG-132 stress model', 'Nuclear-Cytoplasmic distribution'
原代神经元生存分析
VX-745浓度(0.3, 1, 3, 9μM),每日成像天数(7天),神经元数量
阅读提示:STAR Methods, 'Longitudinal imaging and survival analysis'
体外激酶和甲基化实验
反应缓冲液、ATP浓度(200μM)、重组蛋白量、孵育时间和温度
阅读提示:STAR Methods, 'Protein kinase assays', 'Protein methylation assays'