验证肥大细胞受体表达及病毒感染性
确认肥大细胞系上表达的病毒受体,并评估其支持冠状病毒感染的能力。
通过流式细胞术检测LAD2、LUVA和HMC-1细胞上ACE2、APN和DPP4的表达;用HCoV-229E和HCoV-NL63(MOI=1)感染细胞,通过RT-PCR检测核衣壳基因表达。
Spike proteins of coronaviruses activate mast cells for degranulation via stimulating Src/PI3K/AKT/Ca2+ intracellular signaling cascade.
研究包含体外细胞实验(多种肥大细胞系)、病毒和重组蛋白刺激实验、转录组分析、信号通路抑制剂验证、钙离子和微管功能实验等,多层次验证机制,并涵盖功能验证。
人类肥大细胞系LAD2 人类肥大细胞系LUVA 人类肥大细胞系HMC-1
重组冠状病毒刺突蛋白/RBD蛋白,包括HCoV-229E、HCoV-NL63、HCoV-OC43、HCoV-HKU1、MERS-CoV、SARS-CoV和SARS-CoV-2,浓度5 μg/mL 人类冠状病毒HCoV-229E(ATCC VR-740)和HCoV-NL63(ATCC NR-470),MOI=1 PI3K抑制剂LY294002(100 μM)、Ca2+螯合剂BAPTA-AM(20 μM)、微管解聚剂Nocodazole(20 μM) MC脱颗粒检测通过β-己糖胺酶释放量化,阳性对照化合物48/80(C48/80) 蛋白质免疫印迹检测Src/p85-PI3K/AKT磷酸化,抗体如抗磷酸化Src (Tyr416)等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认肥大细胞系上表达的病毒受体,并评估其支持冠状病毒感染的能力。
通过流式细胞术检测LAD2、LUVA和HMC-1细胞上ACE2、APN和DPP4的表达;用HCoV-229E和HCoV-NL63(MOI=1)感染细胞,通过RT-PCR检测核衣壳基因表达。
验证不同冠状病毒的刺突蛋白/RBD与受体结合,并检测其对肥大细胞脱颗粒的诱导作用。
将重组刺突蛋白/RBD(5 μg/mL)与细胞在4°C孵育1小时,通过共聚焦显微镜检测共定位;用刺突蛋白/RBD或病毒处理细胞,通过β-己糖胺酶释放检测脱颗粒。
评估刺突蛋白/RBD和病毒颗粒对肥大细胞转录组的影响,并验证炎症反应相关基因的表达。
LAD2细胞经刺突蛋白/RBD(5 μg/mL)或病毒(MOI=1)处理24小时后,提取RNA进行RNA-seq;通过GO功能富集分析DEGs,并用RT-PCR验证IL-1β、IL-6、TNF-α和IL-8的表达。
阐明刺突蛋白诱导脱颗粒所依赖的胞内信号通路,并通过抑制剂验证其必要性。
用刺突蛋白/RBD处理LUVA细胞,通过免疫印迹检测Src、PI3K、AKT的磷酸化;在存在或不存在LY294002的情况下处理细胞,检测脱颗粒。
确定细胞内Ca2+升高和微管重组是否对刺突蛋白诱导的脱颗粒是必需的。
使用F03探针检测细胞内Ca2+变化;在存在BAPTA-AM或Nocodazole的情况下处理细胞,检测脱颗粒。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| StemPro-34培养基 | Gibco | -- | |
| 干细胞因子 | Novoprotein | -- | |
| 白细胞介素-6 | Novoprotein | -- | |
| 病毒和蛋白刺激 | HCoV-NL63刺突蛋白RBD | Sino Biological | 40600-V08H |
| SARS-CoV-2刺突蛋白RBD | Sino Biological | 40592-V08B | |
| HCoV-229E刺突蛋白RBD | Sino Biological | 40601-V08H | |
| HCoV-HKU1刺突蛋白RBD | Sino Biological | 40021-V08H | |
| HCoV-OC43刺突蛋白RBD | Sino Biological | 40607-V08H1 | |
| SARS-CoV刺突蛋白RBD | Sino Biological | 40150-V08B2 | |
| 人冠状病毒NL63 | ATCC | NR-470 | |
| 人冠状病毒229E | ATCC | VR-740 | |
| 脱颗粒检测 | 化合物48/80 | Sigma | C2313 |
| 抑制剂处理 | 诺考达唑 | MedChemExpress | HY-13520 |
| BAPTA-AM | MedChemExpress | HY-100545 | |
| LY294002 | MedChemExpress | HY-10108 | |
| 免疫荧光 | 抗His抗体 | Abmart | M30111L |
| 抗ACE2抗体 | Proteintech | 21115-1-AP | |
| 抗APN抗体 | Invitrogen | PA5-109314 | |
| 抗DPP4抗体 | R&D | AF1180 | |
| F03细胞内钙离子荧光探针 | Biorab | HR0943 | |
| Western blot | 抗磷酸化PI3K/p85抗体 | Cell Signaling Technology | 4228S |
| 抗PI3K/p85抗体 | Cell Signaling Technology | 4257S | |
| 抗磷酸化AKT (T308)抗体 | Cell Signaling Technology | 13038S | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4619S | |
| 抗Src多克隆抗体 | Proteintech | 11097-1-AP | |
| 抗磷酸化Src家族(Tyr416)抗体 | Cell Signaling Technology | 6943 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abmart | M20006 | |
| RNA-seq | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| QIAseq FastSelect-rRNA HMR试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| NEBNext UltraTM RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- | |
| RT-PCR | ReverTra Ace qPCR RT Master Mix with gDNA Remover试剂盒 | TOYOBO | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:LUVA和HMC-1购自Meisen CTCC;LAD2购自Huzhen Company。LAD2培养需补充干细胞因子和IL-6。 阅读提示:Materials and Methods, Cells, proteins, and viruses |
| 病毒和蛋白刺激 | 重组Spike/RBD蛋白浓度5 μg/mL;病毒MOI=1;处理时间用于脱颗粒检测为2小时,用于转录组为24小时。 阅读提示:Materials and Methods, Mast cell degranulation; Figure legends 1 and 2 |
| 脱颗粒检测 | 细胞数3×10^5;β-己糖胺酶释放检测方法;阳性对照C48/80浓度4 μg/mL。 阅读提示:Materials and Methods, Mast cell degranulation |
| 信号通路抑制 | LY294002浓度100 μM,BAPTA-AM 20 μM,Nocodazole 20 μM,处理时间2小时。 阅读提示:Materials and Methods, Mast cell degranulation; Figure legends 3 and 4 |
| Western blot | 抗体来源和稀释度未明确;细胞裂解和免疫印迹条件需参考方法部分。 阅读提示:Materials and Methods, Western blotting |