NETs在肝转移中的富集验证
验证NETs在乳腺癌肝转移中的富集及其对转移的促进作用
通过IF染色检测人乳腺癌样本和小鼠模型中的NET标志物(MPO、Ci-H3),并使用GSK484或DNase I抑制NETs观察转移变化。
Breast cancer induces CD62L+ Kupffer cells via DMBT1 to promote neutrophil extracellular trap formation and liver metastasis.
包含临床样本分析、细胞系实验、小鼠模型、scRNA-seq及功能验证等至少两个独立证据层级,并有机制验证。
MDA-MB-231及其肝嗜性亚系LvM16 C57BL/6小鼠AT3乳腺癌模型 NOD-SCID小鼠MCF7移植瘤模型 人乳腺癌临床样本(Qilu队列)
肝转移模型构建:采用脾内注射癌细胞建立肝转移模型 KC与中性粒细胞共培养:以Percoll梯度离心分离KCs和中性粒细胞 DMBT1处理:使用重组人DMBT1(11678-H08H)体外处理KCs 抑制剂处理:GSK484(20 mg/kg)、GO203(15 mg/kg)、3H11抗体(100 μg/只)等 细胞比例:KC与AT3细胞按5:1混合注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证NETs在乳腺癌肝转移中的富集及其对转移的促进作用
通过IF染色检测人乳腺癌样本和小鼠模型中的NET标志物(MPO、Ci-H3),并使用GSK484或DNase I抑制NETs观察转移变化。
鉴定肝转移中富集的KC亚群及其是否由肿瘤细胞诱导
通过scRNA-seq分析脾内注射肿瘤细胞后第7天肝脏免疫细胞,发现KC亚群差异;流式和IF验证CD62L+ KCs在肝转移中富集,并用肿瘤条件培养基处理原代KC验证诱导。
验证CD62L+ KCs对NETosis和肝转移的作用
使用氯膦酸脂质体清除KCs,或与CD62L+ KCs共注射癌细胞,观察NETosis和转移情况。
确定CD62L+ KCs分泌的因子及激活中性粒细胞的机制
通过scRNA-seq筛选KC分泌因子,重组蛋白验证CCL8和SAA3诱导NETosis;用ERK抑制剂、CCR1拮抗剂及Ccr1敲低验证通路。
鉴定肿瘤分泌的DMBT1是否诱导CD62L+ KCs并促进转移
通过质谱分析分泌蛋白,DMBT1过表达或敲低细胞系验证其对KC极化和肝转移的影响。
阐明肿瘤DMBT1调节KCs的分子机制
通过Co-IP验证DMBT1与MUC1-C相互作用,检测NF-κB激活及下游靶基因,并使用GO203抑制MUC1。
评估DMBT1中和抗体对肝转移的治疗潜力
筛选并获得DMBT1中和抗体克隆3H11,检测其阻断DMBT1-MUC1相互作用、抑制NETosis和肝转移的效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11965118 |
| 胎牛血清 | Sunrise | SR100180.03 | |
| 青霉素/链霉素/两性霉素B | Gibco | 15240062 | |
| RPMI-1640培养基 | ThermoFisher Scientific | 11875119 | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | 11140050 | |
| 核质分离 | 核蛋白提取试剂盒 | Sangon Biotech | C500009 |
| 抗体生产和纯化 | 姥鲛烷 | Sigma | P9622 |
| 蛋白G树脂 | Sangon Biotech | C600991 | |
| 肝转移模型 | 戊酸雌二醇 | Selleck | S3149 |
| NET抑制 | GSK484 | MCE | HY-100514 |
| 脱氧核糖核酸酶I | ROCHE | 4536282001 | |
| 中性粒细胞耗竭 | 抗小鼠Ly6G抗体 | BioXcell | BE0075-1 |
| 动物成像 | NightOWL II LB983成像系统 | Berthold | -- |
| IVIS Spectrum CT成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 肝脏单细胞悬液制备 | III型胶原酶 | Worthington | LS004182 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma | D-4527 | |
| 分散酶 | Invitrogen | 17105-041 | |
| 肝KCs和骨髓中性粒细胞分离 | Percoll分离液 | GE Healthcare | 17089102 |
| 小鼠中性粒细胞分离 | 无钙镁HBSS缓冲液 | Invitrogen | 14185052 |
| NETosis实验 | 多聚赖氨酸 | Sigma | P4707 |
| 佛波酯 | Sigma | -- | |
| DAPI封片剂 | ABCAM | ab104139 | |
| 抗Ly6G抗体 (551459) | BD Pharmingen | 551459 | |
| 抗瓜氨酸化组蛋白H3抗体 (ab5103) | ABCAM | ab5103 | |
| Western blotting | 抗GAPDH抗体 (G9545) | Sigma | G9545 |
| 抗β-肌动蛋白抗体 (A2228) | Sigma | A2228 | |
| 抗DMBT1抗体 (27069-1-AP) | Proteintech | 27069-1-AP | |
| 抗MUC1-C抗体 (ab109185) | ABCAM | ab109185 | |
| 抗磷酸化Erk1/2抗体 (4370) | CST | 4370 | |
| 抗Erk1/2抗体 (9102) | CST | 9102 | |
| 抗GST标签抗体 (2625) | CST | 2625 | |
| 抗His标签抗体 (12698) | CST | 12698 | |
| 抗p65抗体 (sc-372) | Santa Cruz | sc-372 | |
| 抗磷酸化p65抗体 (3033) | CST | 3033 | |
| HRP标记山羊抗小鼠IgG | Merck/Millipore | 401215 | |
| HRP标记山羊抗兔IgG | Merck/Millipore | 401315 | |
| 流式细胞术 | PE-Ly6G抗体 (49-9668-80) | eBioscience | 49-9668-80 |
| APC-CD11b抗体 (17-0112-81) | eBioscience | 17-0112-81 | |
| PE-F4/80抗体 (12-4801-82) | eBioscience | 12-4801-82 | |
| FITC-CD62L抗体 (104405) | Biolegend | 104405 | |
| 重组蛋白 | 人DMBT1重组蛋白 | SinoBiological | 11678-H08H |
| 鼠CCL8重组蛋白 | R&D | AF790-SP | |
| 血清淀粉样蛋白A1 | CUSABIO | CSB-EP020656M0a0 | |
| 血清淀粉样蛋白A3 | CUSABIO | CSB-YP361411M | |
| 药物处理 | GO203 | MCE | 1222186-26-6 |
| NF-κB抑制 | JSH-23 | MCE | 749886-87-1 |
| ELISA | DMBT1 ELISA试剂盒 | FineTest | EH1756 |
| 组织裂解 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| 细胞分选 | CD45小鼠磁珠 | Miltenyi Biotec | 5211005943 |
| 单细胞测序 | Chromium Next GEM单细胞3'文库试剂盒v3.1 | 10x Genomics | -- |
| ChIP | MinElute纯化试剂盒 | Qiagen | 28004 |
| 免疫沉淀 | Ni-NTA磁珠 | YEASEN | 20502ES10 |
| 抗体生产 | HybGro培养基 | BasalMedia | H630KJ |
| CellTurbo添加剂 | BasalMedia | H460JV | |
| 对照抗体 | IgG (每只100微克) | YEASEN | 36111ES60 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系和培养 | 细胞系种类和培养基:MDA-MB-231、LvM16、Py8119、AT3使用DMEM+10%FBS;MCF7额外添加NEAA和丙酮酸钠;HL60和原代KCs使用RPMI-1640。 阅读提示:Methods - Cell lines |
| 肝转移模型 | 注射方式、细胞数量:脾内注射1.5×10^6人癌细胞或5×10^3鼠癌细胞;原位注射1×10^5细胞于第4乳腺脂肪垫;雌二醇处理MCF7。 阅读提示:Methods - Mouse experiments |
| KC分离和诱导 | KC分离方法:Percoll梯度(50%/25%)离心;原代KC用LvM16条件培养基处理以诱导CD62L。 阅读提示:Methods - KC isolation; Fig. 2g |
| NETosis检测 | 中性粒细胞分离和共培养:骨髓中性粒细胞通过Percoll梯度(72%/65%)分离;2.5×10^5细胞接种在poly-L-lysine包被的盖玻片上,用50% CM或重组蛋白处理12-16小时。 阅读提示:Methods - Neutrophil isolation and analysis; Fig. 4 |
| 药物处理 | 剂量和给药方案:GSK484(20 mg/kg)、DNase I(5 mg/kg)、GO203(15 mg/kg)、3H11抗体(100 μg/只)均每日腹腔注射;Clod(200 μl/只)每3天一次。 阅读提示:Methods - Mouse experiments |