靶点鉴定
确定SU212的分子靶点
使用CETSA结合质谱分析,鉴定SU212处理后热稳定性变化的蛋白质。
Non-orthosteric inhibition of enolase 1 impedes growth of triple-negative breast cancer.
研究涵盖体外细胞实验、多种体内小鼠模型(同系、转基因、PDX、糖尿病)以及机制和安全性验证,包括CETSA、BLI、SPR、蛋白质组学、PET等。
三阴性乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、MDA-MB-468、BT549、EMT6、PY8119等) 同系小鼠肿瘤模型(EMT6/Balb/c、PY8119/C57BL/6) MMTV-PyMT转基因小鼠乳腺癌模型 患者来源异种移植(PDX)模型(MA2821、CA1262、CA1616) 糖尿病小鼠模型(Db/Db)
SU212与ENO1的物理结合通过CETSA、BLI和SPR验证 SU212诱导ENO1降解经由蛋白酶体和自噬途径,使用MG132和3MA抑制 SU212不直接抑制ENO1酶活性(酶活性测定) SU212在多个TNBC模型中抑制肿瘤生长和转移 SU212在糖尿病模型中降低血糖和改善脂肪肝
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定SU212的分子靶点
使用CETSA结合质谱分析,鉴定SU212处理后热稳定性变化的蛋白质。
验证SU212与ENO1的直接物理相互作用
使用BLI和SPR检测SU212与重组ENO1蛋白的结合。
评估SU212对TNBC细胞活力、克隆形成、迁移和糖酵解的影响
进行细胞活力测定(CellTiter-Glo)、克隆形成实验、Matrigel侵袭实验和Seahorse糖酵解速率测定。
评估SU212在不同TNBC小鼠模型中的肿瘤生长抑制效果
使用同系移植模型(EMT6和PY8119)、MMTV-PyMT转基因模型、PDX模型和Db/Db糖尿病模型,腹腔注射SU212或载体,测量肿瘤体积和重量。
评估SU212对TNBC转移的影响
使用EMT6原位模型,治疗结束后收集肺组织进行H&E染色,计数转移灶。
阐明SU212诱导ENO1降解的机制及对细胞信号通路的影响
使用蛋白酶体/自噬抑制剂(MG132、3MA、NH4Cl)处理细胞,检测ENO1表达;通过蛋白质组学和Western blot评估信号通路变化。
评估SU212的毒性、药代动力学和安全性
进行最大耐受剂量(MTD)测定、药代动力学(PK)研究、器官分布分析、代谢物鉴定、激酶谱分析及SafetyScreen44面板测试。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| SU212合成 | SU212 | Malhotra Lab | -- |
| 靶点鉴定 | TMT10plex等压标记试剂盒 | Thermo Scientific | 90110 |
| 结合验证 | ENO1蛋白 | Sino Biological | 11554-H07E-100 |
| ENO3蛋白 | Sino Biological | 14270-H07E | |
| Western blot | ENO1抗体 | Abcam | ab227978 |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4970S | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118S | |
| β-连环蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 8480T | |
| 核纤层蛋白B1抗体 | Cell Signaling Technology | 13435S | |
| COX4抗体 | Cell Signaling Technology | 38563 | |
| ENO3抗体 | Novus Biologicals | NBP1-31764 | |
| 抗小鼠IgG HRP标记抗体 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 抗兔IgG HRP标记抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Corning | 10-040-CV |
| 胎牛血清 | Corning | 35-015-CV | |
| 抗生素-抗真菌溶液 | Corning | 15240062 | |
| 细胞处理 | 依托泊苷 | Sigma-Aldrich | -- |
| MG132 | Selleck Chemicals | S2619 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | Cayman Chemical Company | 13242 | |
| 氯化铵 | Fisher Scientific | AC199975000 | |
| 细胞培养 | 基质胶 | Corning | 356237 |
| Western blot | M-PER裂解液 | Thermo Scientific | 78503 |
| Halt蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Scientific | 78440 | |
| 蛋白检测 | ENO1抑制剂筛选试剂盒 | Abcam | ab283399 |
| 细胞凋亡检测 | RealTime-Glo Annexin V凋亡和坏死检测 | Promega | JA1011 |
| 代谢检测 | Seahorse XF糖酵解速率测定试剂盒 | Agilent Technologies | 103344-100 |
| 细胞组分分离 | NE-PER核胞质提取试剂盒 | Thermo Scientific | 78833 |
| Mem-PER Plus膜蛋白提取试剂盒 | Thermo Scientific | 89842 | |
| 线粒体/胞质分离试剂盒 | MilliporeSigma | MIT1000 | |
| 基因表达分析 | nCounter小鼠代谢通路面板 | NanoString Technologies | 115000374 |
| 细胞活力 | CellTiter-Glo试剂 | Promega | G7572 |
| 动物实验 | True Metrix血糖仪 | TRUE METRIX | B08DXNC949 |
| 免疫组化 | 柑橘透明溶剂 | Thermo Scientific | 8301 |
| 正常马血清 | Vector Laboratories | 30021 | |
| 抗兔二抗 | Vector Laboratories | 30025 | |
| 澄清剂1 | Thermo Scientific | 7401 | |
| Paramount封片剂 | Fisher Chemical | SP15 | |
| Western blot | Immobilon Crescendo Western HRP底物 | Millipore | WBLUR0500 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 靶点鉴定 | CETSA实验:细胞系MDA-MB-231,SU212浓度0.5 μM,处理1.5小时,温度范围37-67°C(具体温度点:37,41,44,47,50,53,56,59,63,67°C),细胞密度1x10^6/100μL。 阅读提示:STAR Methods: CETSA analysis |
| 结合验证 | BLI:His标记ENO1/ENO3蛋白浓度50 μg/mL,SU212浓度10,5,1 μM;SPR:生物素化SU212,ENO1浓度0.125-4 μM,流速30 μL/min,结合时间120s,再生600s。 阅读提示:STAR Methods: BLI analysis; SPR analysis |
| 体外功能验证 | 细胞活力测定:细胞密度2000-4000/孔,SU212处理48小时;克隆形成:细胞密度200-2000/孔,处理6-10天;侵袭实验:细胞数50,000,Matrigel 1:1混合,处理5-7天。 阅读提示:STAR Methods: Cell viability assay; Colony formation assay; Cell invasion assay |
| 体内药效评估 | 同系、转基因和PDX模型:剂量20或30 mg/kg,腹腔注射,每周5天,21-24天;Db/Db模型:剂量10 mg/kg,每周5天,32天。 阅读提示:STAR Methods: In vivo studies; Orthotopic xenograft studies; FVB/N-Tg(MMTV-PyVT)634Mul/J mice model |
| 转移评估 | EMT6原位模型:细胞数1x10^5,NSG小鼠,SU212 30 mg/kg,每周5天,21天,肺部转移灶计数。 阅读提示:STAR Methods: In vivo studies; Orthotopic xenograft studies |
| 机制验证 | SU212 0.5 μM,6小时,MG132、3MA、NH4Cl浓度未具体说明(文中未明确说明)。 阅读提示:STAR Methods: Immunoblotting |
| 安全性和药代动力学评估 | MTD:剂量100,200,400 mg/kg,单次腹腔注射,观察72小时;PK:剂量50 mg/kg,取血时间点未具体列出(见图7);器官分布:时间点2,4,24小时。 阅读提示:STAR Methods: MTD assay; Drug pharmacokinetic and organ distribution study |