巨噬细胞极化与ER应激诱导
建立M1样和M2样巨噬细胞模型,并诱导ER应激,以研究不同极化状态的巨噬细胞对ER应激的感知。
使用GM-CSF和M-CSF分别诱导BMDM分化为M1样(GM-BMDM)和M2样(M-BMDM)巨噬细胞,然后用Tm(1 μg/ml)处理不同时间(0、4、6、8、12 h)诱导ER应激。
Transmissible ER stress between macrophages and tumor cells configures tumor microenvironment.
包含体外细胞模型(GM-BMDM、M-BMDM、LLC)和3D共培养,结合免疫印迹、RT-qPCR、RNA-seq和蛋白质组学多层级验证,并进行功能验证(细胞死亡)和机制验证(MAPK通路、DAMPs)。
GM-CSF培养的骨髓来源巨噬细胞(GM-BMDM,M1样) M-CSF培养的骨髓来源巨噬细胞(M-BMDM,M2样) 小鼠路易斯肺癌细胞系(LLC) 3D共培养体系(肿瘤球)
供体巨噬细胞类型(GM-BMDM与M-BMDM)及其极化状态 ER应激诱导剂及浓度(Tm 1 μg/ml,Tg 300 nM) 条件培养基制备和处理时间 受体肿瘤细胞系(LLC) 细胞死亡检测(PI/Hoechst染色)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立M1样和M2样巨噬细胞模型,并诱导ER应激,以研究不同极化状态的巨噬细胞对ER应激的感知。
使用GM-CSF和M-CSF分别诱导BMDM分化为M1样(GM-BMDM)和M2样(M-BMDM)巨噬细胞,然后用Tm(1 μg/ml)处理不同时间(0、4、6、8、12 h)诱导ER应激。
验证巨噬细胞是否将ER应激传递给肿瘤细胞,并比较不同极化巨噬细胞的传递能力。
收集ER应激巨噬细胞的条件培养基(CM),处理LLC细胞24小时,检测UPR标志物(Grp78、CHOP、sXbp1)的表达。
在更接近体内TME的3D条件下验证ER stress传递及其对肿瘤细胞的影响。
将巨噬细胞培养在transwell小室中,用Tm处理6小时,洗涤后与3D培养的LLC球体共培养40小时,检测UPR标志物和炎性因子。
评估传递的ER应激对肿瘤细胞存活的影响。
用来自应激巨噬细胞的CM处理LLC细胞36小时,通过PI/Hoechst染色检测细胞死亡,并检测凋亡和自噬标志物。
分析肿瘤细胞对不同巨噬细胞CM响应的基因表达差异。
对用不同CM处理的LLC细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因(DEGs)和GO通路富集。
鉴定ER应激巨噬细胞分泌的关键因子,特别是与细胞死亡相关的DAMPs。
对ER应激巨噬细胞的CM进行蛋白质组学分析,鉴定分泌蛋白,并通过ELISA验证S100A8/A9的释放。
验证DAMPs(S100A8/A9)是否与ER应激协同诱导肿瘤细胞死亡。
用重组S100A8/A9单独或与Tm联合处理LLC细胞,检测细胞死亡和MAPK信号通路激活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ER应激诱导 | 衣霉素 | Cell Signaling Technology | 12,819 |
| 毒胡萝卜素 | Cell Signaling Technology | 12,758 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 巨噬细胞分化 | 重组小鼠GM-CSF | R&D | 415-ML |
| 重组小鼠M-CSF | R&D | 416-ML | |
| DAMP处理 | 小鼠重组S100A8 | Sino Biological | 50,228-M08B |
| 小鼠重组S100A9 | Sino Biological | 50,284-M07E | |
| RT-qPCR | PrimeScript™ RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | RR047A |
| FastStart Essential DNA Green Master | Roche | 4,913,914,001 | |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白测定试剂盒 | Solarbio Life Sciences | PC0020 |
| 细胞染色 | Hoechst 33342 | Solarbio Life Sciences | C0030 |
| 碘化丙啶 | Solarbio Life Sciences | C0080 | |
| 细胞培养耗材 | 细胞培养小室(0.4 μm) | Millipore | PICM01250 |
| 细胞活力检测 | 发光细胞活力检测试剂盒 | Promega | G7570 |
| 3D细胞活力检测 | 3D细胞活力检测试剂盒 | Promega | G9681 |
| 凋亡检测 | Caspase-Glo 3/7检测试剂盒 | Promega | G8091 |
| 细胞毒性检测 | 细胞毒性检测试剂盒 | Promega | G8741 |
| 免疫印迹 | Grp78抗体 | BD Biosciences | 610978 |
| CHOP抗体 | CST | 2895 | |
| Xbp1抗体 | Abcam | ab220783 | |
| caspase-1抗体 | Abcam | ab179515 | |
| caspase-9抗体 | CST | 9508 | |
| GAPDH抗体 | CST | 5174 | |
| LC3抗体 | CST | 4108 | |
| Beclin-1抗体 | CST | 3495 | |
| p-ULK1抗体 | CST | 5869 | |
| cleaved-PARP抗体 | CST | 9544 | |
| p-JNK抗体 | CST | 4668 | |
| JNK抗体 | CST | 9252 | |
| p-ERK抗体 | CST | 4370 | |
| ERK抗体 | CST | 4695 | |
| p-p38抗体 | CST | 4511 | |
| p38抗体 | CST | 8690 | |
| S100A9抗体 | CST | 73425 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗小鼠IgG | Absin | abs20001 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗兔IgG | Absin | abs20002 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Takara | 9109 |
| RNA定量 | Nanodrop分光光度计 | Thermo Scientific | ND-ONE |
| RT-qPCR | ABI Stepone Plus系统 | -- | -- |
| ELISA | S100A8 ELISA试剂盒 | Cloud Clone | -- |
| S100A9 ELISA试剂盒 | Cloud Clone | -- | |
| S100A8/A9 ELISA试剂盒 | Cloud Clone | -- | |
| RNA-seq | NovaSeq 6000平台 | Illumina | -- |
| 蛋白质谱 | Agilent 1290 Infinity II 超高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- |
| 6460三重四极杆质谱仪 | Agilent Technologies | -- | |
| 细胞成像 | 高内涵细胞成像仪(Operetta) | PerkinElmer | -- |
| ZEISS Ver.A1显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| Western blot检测 | ECL检测试剂 | Millipore | WBKLS0500 |
| Western blot成像 | Tanon 5200成像系统 | Tanon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 巨噬细胞分化 | BMDM分化条件:GM-CSF浓度20 ng/ml,M-CSF浓度50 ng/ml,培养7天;细胞接种密度 阅读提示:参见Materials and methods: Murine primary BMDM isolation and culture |
| ER应激诱导 | Tm浓度1 μg/ml,Tg浓度300 nM,处理时间0-12小时 阅读提示:参见Materials and methods: Conditioned media preparation; Results: Tumor cells sense transferable ER stress |
| 条件培养基转移 | CM制备:ER应激后洗涤3次,加新鲜培养基,16小时收集;LLC处理时间24小时或36小时 阅读提示:参见Materials and methods: Conditioned media preparation; Results: Tumor cells sense transferable ER stress |
| 3D共培养 | 巨噬细胞在transwell小室中处理6小时,与3D LLC球体共培养40小时;Matrigel基质胶 阅读提示:参见Materials and methods: Co-cultured 3D system; Results: Tumor cells sense transferable ER stress(图S2) |
| 细胞死亡检测 | PI/Hoechst染色时间30分钟;定量方法 阅读提示:参见Materials and methods: The high content imaging analysis system and fluorescence microscope; Results: Transferred ER stress induces LLC tumor cells death |
| 信号通路检测 | Western blot抗体及稀释比;检测p-JNK, p-ERK, p-p38;S100A8/A9处理浓度5 μg/ml 阅读提示:参见Materials and methods: Immunoblotting and antibodies; Results: DAMP signaling acts in synergy with ER stress signaling |