验证分泌型PKG II对细胞功能的影响
确定分泌型PKG II是否影响PDGF-BB诱导的胃癌细胞迁移、侵袭和增殖。
使用重组蛋白GST-PKG II模拟分泌型PKG II,在HGC-27和AGS细胞中,经GST-PKG II和cGMP预处理后,用PDGF-BB处理,通过Transwell实验和CCK8实验检测细胞迁移、侵袭和增殖。
Secretory type II cGMP-dependent protein kinase blocks activation of PDGFRβ via Ser254 in gastric cancer cells.
文献包含体外细胞功能实验(Transwell、CCK8)、蛋白互作验证(Co-IP、GST pull down)、激酶实验及位点突变验证(S254A等),证据层级独立且包含功能与机制验证。
人胃癌细胞系HGC-27 人胃癌细胞系AGS COS-7细胞(转染PDGFRβ质粒) 重组蛋白GST-PKG II与His-PDGFRβ胞外域(体外激酶体系)
细胞系:HGC-27和AGS;处理:GST-PKG II(100 ng/ml)和cGMP(250 μM)预处理1小时,随后PDGF-BB(100 ng/ml)处理(迁移10分钟,侵袭和增殖12或24小时) 质粒:PDGFRβ野生型及突变体(S254A、T335A、S373A)转染COS-7细胞3天 检测方法:Western blot检测p-PDGFRβ、p-Ser/Thr及下游通路蛋白 统计分析:数据以mean ± SD表示,采用双因素方差分析,P < 0.05为有统计学意义
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定分泌型PKG II是否影响PDGF-BB诱导的胃癌细胞迁移、侵袭和增殖。
使用重组蛋白GST-PKG II模拟分泌型PKG II,在HGC-27和AGS细胞中,经GST-PKG II和cGMP预处理后,用PDGF-BB处理,通过Transwell实验和CCK8实验检测细胞迁移、侵袭和增殖。
检测分泌型PKG II是否改变PDGF-BB诱导的相关蛋白表达水平。
在同一处理条件下,使用Western blot检测E-cadherin、N-cadherin、MMP9和PCNA的表达。
确定分泌型PKG II能否阻断PDGF-BB诱导的PDGFRβ激活及其下游PI3K/Akt和MAPK/ERK通路。
在HGC-27和AGS细胞中,经GST-PKG II和cGMP预处理后,PDGF-BB处理10分钟,Western blot检测p-PDGFRβ、PDGFRβ、p-PI3K、PI3K、p-Akt、Akt、p-MEK、MEK、p-ERK、ERK的水平。
确认分泌型PKG II是否与PDGFRβ结合,以及是否作用于其胞外域。
在HGC-27和AGS细胞中,经GST-PKG II和cGMP处理1小时后裂解,用抗GST或PDGFRβ抗体进行免疫共沉淀,随后Western blot检测;体外激酶实验中,将GST-PKG II、cGMP与His-PDGFRβ(Met1-Lys531)在激酶缓冲液中孵育1小时,进行GST pull down,检测His-PDGFRβ。
确定分泌型PKG II是否增加PDGFRβ的丝氨酸/苏氨酸磷酸化。
在胃癌细胞中处理GST-PKG II和cGMP后,用抗PDGFRβ抗体进行免疫沉淀,Western blot检测p-Ser/Thr和PDGFRβ;体外激酶实验后也进行类似检测。
确认Ser254是否为分泌型PKG II对PDGFRβ发挥抑制作用的特异性位点。
利用GPS3.0软件预测位点,构建PDGFRβ突变质粒(S254A、T335A、S373A),转染COS-7细胞3天,然后处理GST-PKG II和cGMP,随后用PDGF-BB刺激,免疫沉淀(抗flag)后检测p-Ser/Thr和p-PDGFRβ水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 8-pCPT-cGMP | BioLog Life Science Institute | C 009 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Wisent | 350-006-CL |
| F-12K培养基 | Wisent | 312-250-CL | |
| DMEM培养基 | Wisent | 319-006-CL | |
| 胎牛血清 | Wisent | 086-150 | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Wisent | 450-115-EL | |
| 迁移和侵袭实验 | Transwell小室 | Corning Life Sciences | 3422 |
| 侵袭实验 | ECM胶 | Sigma-Aldrich | E6909 |
| 增殖实验 | CCK8试剂盒 | Dojindo | CK04 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 免疫沉淀 | 免疫沉淀细胞裂解液 | Beyotime | P0013J |
| 蛋白定量 | 增强型BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| 免疫沉淀 | Protein A+G琼脂糖 | Beyotime | P2055 |
| 蛋白提取 | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Beyotime | P1046 |
| GST pull-down | 谷胱甘肽琼脂糖4B | GE Healthcare | 17-0756-01 |
| Western blot | Immobilon ECL Western HRP底物 | Merck KGaA | WBKLS0500 |
| Immobilon PVDF膜 | Merck KGaA | IPVH00010 | |
| 定点突变 | QuikChange Lightning定点突变试剂盒 | Agilent Technologies | #210519 |
| 体外激酶实验 | 重组人GST标签PKG II蛋白 | Thermo Fisher Scientific | PR7572A |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985070 | |
| 体外激酶实验 | 激酶缓冲液 | Cell Signaling Technology | #9802 |
| ATP | Cell Signaling Technology | 9804 | |
| 重组人PDGFRβ胞外域蛋白(Met1-Lys531)带His标签 | Sino Biological | 10514-H08H | |
| 位点突变实验 | 质粒pCMV3-C-FLAG-PDGFRβ | Sino Biological | HG10514-CF |
| Western blot | 抗PKG II抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-393126 |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | #sc-8432 | |
| 抗磷酸化PDGFRβ抗体 | Cell Signaling Technology | #3166 | |
| 抗PDGFRβ抗体 | Cell Signaling Technology | #3169 | |
| 抗N-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | #13116 | |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | #3195 | |
| 抗磷酸化PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | #17366 | |
| 抗PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | #4257 | |
| 抗磷酸化Akt抗体 | Cell Signaling Technology | #4060 | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | #4691 | |
| 抗磷酸化MEK抗体 | Cell Signaling Technology | #9154 | |
| 抗MEK抗体 | Cell Signaling Technology | #9122 | |
| 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | #4370 | |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | #4695 | |
| 免疫沉淀 | 抗磷酸化丝氨酸/苏氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | #9631 |
| Western blot | 抗His抗体 | Cell Signaling Technology | #12698 |
| 抗GST抗体 | Cell Signaling Technology | #2624 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Jackson ImmunolResearch | 115-035-003 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Jackson ImmunolResearch | 111-035-003 | |
| 免疫沉淀 | 抗flag抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:HGC-27、AGS、COS-7;培养基:RPMI 1640、F-12K、DMEM;添加10% FBS和抗生素-抗真菌剂 阅读提示:查看Materials and Methods 2.2 Cell culture |
| 处理条件 | GST-PKG II浓度(100 ng/ml)、cGMP浓度(250 μM)、预处理时间(1小时)、PDGF-BB浓度(100 ng/ml)及处理时间(迁移12小时,侵袭和增殖24小时,信号通路10分钟) 阅读提示:查看各实验的Figure legends(图1、图3)和Materials and Methods |
| 质粒转染 | 质粒:pCMV3-C-FLAG-PDGFRβ野生型及突变体(S254A、T335A、S373A);转染试剂:Lipofectamine 3000和Opti-MEM;转染时间:3天 阅读提示:查看Materials and Methods 2.8 Plasmid mutation and transfection |
| 蛋白检测 | 抗体列表(anti-p-PDGFRβ、anti-p-Ser/Thr等)、IP和Western blot步骤 阅读提示:查看Materials and Methods 2.5 Western blot analysis和2.6 Immunoprecipitation |
| 统计分析 | 数据表示:mean ± SD;统计方法:双因素方差分析;显著性水平:P < 0.05 阅读提示:查看Materials and Methods 2.9 Statistical analysis |