MDMX 过表达对正常造血的影响
评估 MDMX 过表达对造血干细胞(HSC)数量、增殖和竞争能力的影响。
比较 Mdmx-Tg 与 WT 小鼠的 HSC 表型、细胞周期、集落形成能力和竞争性移植能力。
MDMX acts as a pervasive preleukemic-to-acute myeloid leukemia transition mechanism.
包含多种小鼠模型(如 PU.1 URE−/−、Tet2−/−、Flt3ITD、Nras-G12D)及患者样本分析,并进行了功能验证(移植、集落形成)和机制验证(RNA-seq、蛋白质组学、共免疫沉淀)。
Mdmx转基因小鼠 PU.1 URE−/− 小鼠 Tet2−/− 和 Tet2+/− 小鼠 Flt3WT/ITD 小鼠 Nras-G12D 骨髓移植模型
MDMX 过表达对 HSC 数量和竞争能力的影响(竞争性移植实验) MDMX 与 CK1α 的物理相互作用(免疫沉淀-质谱) MDMX 过表达对 β-Catenin 蛋白水平和核转位的影响(免疫荧光、亚细胞分级) Wnt/β-Catenin 抑制剂和 CK1α 过表达对 pre-LSC 集落形成能力的抑制作用 MDMX 高表达 MDS 患者中 Wnt/β-Catenin 信号的富集及 AML 转化风险(GSE19429 队列)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估 MDMX 过表达对造血干细胞(HSC)数量、增殖和竞争能力的影响。
比较 Mdmx-Tg 与 WT 小鼠的 HSC 表型、细胞周期、集落形成能力和竞争性移植能力。
验证 MDMX 过表达是否促进由 PU.1、TET2、FLT3、NRAS 等不同突变驱动的白血病前期状态向 AML 转变。
将不同的白血病前期模型与 Mdmx-Tg 小鼠杂交或进行骨髓移植,观察疾病进展、生存期和 AML 表型。
探究 MDMX 过表达激活 Wnt/β-Catenin 信号的分子机制。
通过 RNA-seq 分析转录组变化,并通过免疫沉淀-质谱(LC-MS/MS)鉴定 MDMX 相互作用蛋白,验证 MDMX 与 CK1α 的相互作用及其对 β-Catenin 的影响。
验证 Wnt/β-Catenin 信号和 CK1α 水平是否介导 MDMX 过表达诱导的 pre-LSC 功能特性。
使用 Wnt/β-Catenin 抑制剂(WNT974、PNU74654)和 CK1α 过表达进行集落形成实验,观察对 pre-LSC 集落形成能力和 IC50 的影响。
确定 MDMX 对 β-Catenin 的上调作用是否依赖于 p53。
在 p53 缺失背景下(Trp53−/−;Mdmx-Tg 小鼠和 p53 缺失的 HL-60 细胞)检测 β-Catenin 表达、CK1α 相互作用及功能效应。
评估 MDMX-Wnt/β-Catenin 轴在 MDS 患者中的临床相关性。
分析公开的 MDS 患者基因表达和临床数据(GSE19429),比较 MDMX 高表达与低表达患者的 Wnt/β-Catenin 信号富集、突变谱和 AML 转化风险。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | IMDM 培养基 | -- | -- |
| αMEM 培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| WEHI 条件培养基 | -- | -- | |
| 细胞因子刺激 | 小鼠重组 IL-3 | GEMINI | 300-324P |
| 小鼠重组 IL-6 | GEMINI | 300-327P | |
| 小鼠重组 Flt3 配体 | GEMINI | 300-306P | |
| 小鼠重组 SCF | GEMINI | 300-348P | |
| 小鼠重组 TPO | GEMINI | 300-351P | |
| 药物处理 | ALRN-6924 | Aileron Therapeutics | -- |
| BC2059 | Targetmol | T5642 | |
| WNT974 | InvivoChem | V1353 | |
| PNU74654 | Selleckchem | S8429 | |
| 细胞增殖检测 | BrdU | Sigma-Aldrich | 19160 |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Blue 细胞活力检测试剂盒 | Promega | G8081 |
| 免疫沉淀 | Pierce 抗 HA 磁珠 | Thermo Scientific | 88836 |
| Pierce 抗 FLAG 磁珠 | Thermo Scientific | A36797 | |
| 免疫印迹 | 兔抗 β-Catenin (D10A8) 抗体 | Cell Signaling Technology | 8480 |
| 兔抗 CK1α (EPR1961(2)) 抗体 | Abcam | ab108296 | |
| 兔抗 β-Tubulin 抗体 | Cell Signaling Technology | 2146 | |
| 兔抗 LaminB1 抗体 | Abcam | ab16048 | |
| 兔抗 Actin 抗体 | Sigma Aldrich | A2066 | |
| 兔抗 HA 标签 (C29F4) 抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 兔抗 FLAG 标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2368 | |
| 小鼠抗 MDMX (MDMX_82) 抗体 | Abcam | ab49993 | |
| 兔抗磷酸化 β-Catenin (Thr41/Ser45) 抗体 | Cell Signaling Technology | 9565 | |
| 马抗小鼠 IgG HRP 标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 马抗兔 IgG HRP 标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔 IgG Alexa Fluor 488 偶联二抗 | Abcam | ab150077 |
| 免疫沉淀 | Mouse TrueBlot ULTRA:抗小鼠 Ig HRP 二抗 | Rockland | 18-8817-30 |
| 细胞分离 | 小鼠 CD117 (cKit) 磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-091-224 |
| Dynabeads 未接触小鼠 T 细胞阴性分选试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 11413D | |
| RNA 提取 | RNeasy Micro 试剂盒 | QIAGEN | 74004 |
| 逆转录 PCR | iScript cDNA 合成试剂盒 | BIO-RAD | 1708890 |
| qRT-PCR | Power SYBR Green PCR 预混液 | Applied Biosystems | 4367659 |
| 集落形成实验 | 小鼠甲基纤维素完全培养基 | R&D systems | HSC007 |
| 细胞培养 | StemSpan SFEM 培养基 | STEMCELLS | 09600 |
| 病毒转导 | 聚凝胺 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-134220 |
| RetroNectin | Takara Bio | T100 | |
| 质粒构建 | pCMV3.(Human)MDM4-Flag 质粒 | Sino Biological | HG15395-CF |
| MSCV.NRAS-G12D.IRES.GFP 逆转录病毒载体 | -- | -- | |
| MSCV.(Mouse)Csnk1a1.IRES.GFP 逆转录病毒载体 | -- | -- | |
| pGFP-C-shLenti 对照 shRNA | Origene | TR30021 | |
| pGFP-C-shLenti 靶向 Ctnnb1-A shRNA | Origene | TL500280A | |
| pGFP-C-shLenti 靶向 Ctnnb1-B shRNA | Origene | TL500280B | |
| 流式细胞术 | FACS Aria2 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 荧光成像 | Leica SP8 正置共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 免疫印迹成像 | LI-COR Odyssey Fc 成像系统 | LI-COR | -- |
| qRT-PCR | ViiA7 实时荧光定量 PCR 系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞活力检测 | FLUOstar Omega 酶标仪 | BMG Labtech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Mdmx-Tg 小鼠品系、基因型及年龄(如 3 个月) 阅读提示:STAR Methods:Experimental Model and Subject Details, Animal Studies |
| 竞争性移植 | 供体细胞数量(1×10^6)、竞争细胞数量(1×10^6)、受体株系(Ly45.1)、照射剂量(12Gy 分次) 阅读提示:STAR Methods:Competitive Transplantation Assays |
| 集落形成实验 | 细胞数量(如 1000 个 HSC)、培养基(甲基纤维素)、细胞因子、培养时间(7 天)、连续重铺次数 阅读提示:STAR Methods:In Vitro Colony Forming Assays |
| 药物处理 | 药物浓度(WNT974、PNU74654、ALRN-6924)、处理时间(16 或 24 小时)、细胞密度 阅读提示:STAR Methods:Cell Viability Assay (IC50) |
| RNA-seq | 细胞分选(HSC 或 pre-LSC 的数量和表型)、RNA 提取、测序平台、数据分析方法 阅读提示:STAR Methods:RNA sequencing (RNA-seq) |