体外GMC增殖模型建立
确认亚裂解C5b-9是否诱导GMC增殖
使用5% Thy-1 Ab加4% NHS形成亚裂解C5b-9,处理大鼠GMCs,通过CCK-8和EdU实验检测增殖。
Sublytic C5b-9 induces glomerular mesangial cell proliferation via ERK1/2-dependent SOX9 phosphorylation and acetylation by enhancing Cyclin D1 in rat Thy-1 nephritis.
包含体外细胞模型(大鼠GMCs)、体内大鼠Thy-1N模型及患者肾组织样本,并进行了功能验证(过表达/敲低、CCK-8/EdU)和机制验证(ChIP、质谱、co-IP等)。
大鼠Thy-1肾炎模型 大鼠肾小球系膜细胞(GMC) MsPGN患者肾组织标本
亚裂解C5b-9的形成条件(5% Thy-1 Ab + 4% NHS) ERK1/2磷酸化及SOX9磷酸化位点(Ser64/Ser181) SOX9与Cyclin D1启动子结合区域(-582至-238 nt) LV-shRNA肾动脉灌注敲低效率(2×10^7 TU/ml,4天) 统计学方法(ANOVA和t检验,p<0.05)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认亚裂解C5b-9是否诱导GMC增殖
使用5% Thy-1 Ab加4% NHS形成亚裂解C5b-9,处理大鼠GMCs,通过CCK-8和EdU实验检测增殖。
验证亚裂解C5b-9是否激活ERK1/2及相关上游通路
检测钙内流(Fluo-4 AM)、PKC-α、c-Raf、MEK1/2和ERK1/2的磷酸化水平,并利用抑制剂验证因果。
明确这些蛋白是否影响GMC增殖和Cyclin D1表达
通过过表达或敲低ERK1/2、SOX9、Cyclin D1,检测增殖和Cyclin D1表达。
确定SOX9和ERK1/2如何调控Cyclin D1启动子
使用荧光素酶报告基因和ChIP-PCR分析Cyclin D1启动子片段,验证SOX9结合区域。
揭示ERK1/2对SOX9的磷酸化和乙酰化修饰及其功能
通过质谱鉴定SOX9磷酸化位点,构建磷酸化突变体,检测磷酸化和乙酰化水平及其对Cyclin D1和增殖的影响。
在大鼠Thy-1N模型中验证ERK1/2、SOX9和Cyclin D1的作用
通过肾动脉灌注LV-shRNA敲低基因,观察Thy-1N大鼠的病理变化和蛋白表达。
验证MsPGN患者肾组织中相关蛋白的表达
对MsPGN患者肾活检组织进行免疫组化染色,分析p-ERK1/2、p-SOX9、SOX9和Cyclin D1的表达及相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与刺激 | MEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 正常人血清 | -- | -- | |
| 人C6缺陷血清 | Complement Technology | A323 | |
| 重组人C6蛋白 | Sino Biological Inc | 12426-H08H | |
| 兔多克隆抗Thy-1抗体 | -- | -- | |
| 正常兔血清 | Yeasen | 36117ES03 | |
| 氨氯地平 | MedChemExpress | HY-B0317 | |
| Go6983 | MedChemExpress | HY-13689 | |
| AZ628 | MedChemExpress | HY-11004 | |
| U0126 | MedChemExpress | HY-12031 | |
| 曲古抑菌素A | Sigma | V900931 | |
| pMT-ERK1质粒 | Addgene | 12656 | |
| pcDNA-ERK2质粒 | Addgene | 8974 | |
| pcDNA-SOX9质粒 | Addgene | 62972 | |
| Fluo-4 AM | Beyotime | S1060 | |
| 核浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0028 | |
| 抗HA亲和凝胶 | Yeasen | 20586ES03 | |
| CCK-8试剂盒 | Dojindo | CK04 | |
| EdU Apollo567试剂盒 | RiboBio | C10310-1 | |
| 基因表达分析 | HiScript II Q RT SuperMix用于qPCR | Vazyme | R222-01 |
| 2× Taq Master Mix | Vazyme | P212-01 | |
| ClonExpress Ultra一步克隆试剂盒 | Vazyme | C115-01 | |
| SYBR Green Supermix | -- | -- | |
| RNAiso Plus | -- | -- | |
| 蛋白质分析 | 抗β-actin抗体 | Beyotime | AF0003 |
| 抗Lamin B1抗体 | Beyotime | AF1408 | |
| 抗c-Raf总蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 9422 | |
| 抗磷酸化c-Raf抗体 | Cell Signaling Technology | 9427 | |
| 抗MEK1/2总蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 9126 | |
| 抗磷酸化MEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 3958 | |
| 抗ERK1/2总蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 抗乙酰化赖氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 9681 | |
| 抗GCN5L2抗体 | Cell Signaling Technology | 3305 | |
| 抗IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 5127 | |
| 抗SOX9抗体 | Santa Cruz / Abcam | sc-166505 / ab3697 | |
| 抗Cyclin D1抗体 | Abcam | ab16663 | |
| 抗KAT7抗体 | Abcam | ab70183 | |
| 抗PCAF抗体 | Abcam | ab12188 | |
| 抗PKC-α总蛋白抗体 | Abcam | ab32376 | |
| 抗磷酸化PKC-α抗体 | Abcam | ab32502 | |
| 抗磷酸化丝氨酸/苏氨酸抗体 | Abcam | ab17464 | |
| 抗磷酸化SOX9抗体 | Bioworld | BS4875 | |
| 抗HA抗体 | Proteintech | 66006-2-Ig | |
| 染色质免疫沉淀 | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| 蛋白质分析 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 |
| 蛋白A/G-琼脂糖珠 | -- | -- | |
| NE-PER裂解液 | Pierce | -- | |
| 显微镜检查 | 醋酸铀和柠檬酸铅 | -- | -- |
| 尿蛋白检测 | 总蛋白检测试剂盒 | DiaSys Diagnostic Systems | -- |
| 电转染 | Neon™转染系统 | Thermo Fisher | -- |
| qRT-PCR | ABI StepOne Plus系统 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外GMC培养与亚裂解C5b-9刺激 | GMC细胞系来源,MEM培养基和FBS浓度;Thy-1抗体和NHS浓度(5% Thy-1 Ab + 4% NHS);刺激时间点(24h和36h) 阅读提示:Methods: Cell culture, inhibitor pretreatment, and sublytic C5b-9 stimulation |
| ERK1/2上游通路抑制 | 抑制剂浓度(amlodipine, Go6983, AZ628, U0126均为10 μM)和预处理时间(30 min) 阅读提示:Methods: Cell culture, inhibitor pretreatment, and sublytic C5b-9 stimulation |
| 过表达和敲低 | 质粒浓度(3 μg),电转条件(1600V, 20ms, 1次),转染后时间(48h) 阅读提示:Methods: Cellular transfection |
| 报告基因和ChIP | Cyclin D1启动子构建(FL, -985, -582),ChIP引物区域,刺激时间(3h) 阅读提示:Methods: DNA constructs, ChIP-PCR |
| 体内Thy-1N模型 | 大鼠体重(180-200g),Thy-1抗体剂量(0.75ml/100g或1ml/100g),LV-shRNA滴度(2×10^7 TU/ml)和灌注时间(4天),样本采集时间(3h和7天) 阅读提示:Methods: Rat Thy-1N induction and experimental design |