AI模型构建与药物设计
建立同时预测BTK抑制活性和BBB穿透性的模型,筛选最优化合物
利用ChEMBL和B3DB数据集训练KnoMol模型,预测BTK抑制活性和BBB渗透性,结合分子对接设计并合成HZ-A-018。
Design, preclinical evaluation, and multicenter phase 1 clinical study of HZ-A-018 for relapsed or refractory central nervous system lymphoma
包含AI模型预测、分子对接与动力学模拟、体外细胞活性与Western blot、动物模型药效、MDCK-MDR1渗透试验及1期临床试验等多个独立证据层级,并进行功能与机制验证。
Mino细胞系 OCI-LY10细胞系 CB17-SCID小鼠颅内异种移植模型 r/r CNSL患者(1期临床)
HZ-A-018剂量:300 mg、450 mg、600 mg QD 试验患者:r/r CNSL(PCNSL、SCNSL、PVRL),需至少一线治疗失败 主要终点:安全性、耐受性、RP2D 次要终点:ORR、CRR、DOR、PFS、OS PK采样:C3D1给药后多个时间点血浆及2小时脑脊液
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立同时预测BTK抑制活性和BBB穿透性的模型,筛选最优化合物
利用ChEMBL和B3DB数据集训练KnoMol模型,预测BTK抑制活性和BBB渗透性,结合分子对接设计并合成HZ-A-018。
验证HZ-A-018与BTK的结合能力及选择性
通过生物素化探针竞争ELISA检测人PBMC中BTK占位率;进行激酶选择性实验和激酶组分析。
评估HZ-A-018对B细胞淋巴瘤细胞系的增殖抑制及对BTK通路的影响
使用MTS/CCK8检测多种细胞系(OCI-LY10、SU-DHL-6、WSU-DLCL2、TMD8、Mino等)的细胞活力;Western blot检测p-BTK、BTK、p-PLCγ2等蛋白水平。
评估HZ-A-018穿透血脑屏障的潜力
使用MDCK-MDR1细胞模型测定Papp(A-B)值,比较HZ-A-018与ibrutinib、tirabrutinib的渗透性。
评估HZ-A-018在颅内肿瘤模型中的抗肿瘤活性和生存获益
建立Mino细胞颅内注射的CB17-SCID小鼠模型,给药后通过H&E、IHC、mIF评估肿瘤面积和BTK通路变化,并监测生存期。
评估HZ-A-018在r/r CNSL患者中的安全性和耐受性
采用3+3剂量递增设计,患者接受300、450或600 mg QD口服,28天为周期,评估DLT、TRAEs和MTD。
评估HZ-A-018的抗肿瘤活性
使用国际PCNSL协作组标准评估ORR、CRR、DOR、PFS、OS,并进行影像学评估。
评估HZ-A-018的血浆药代动力学和脑脊液穿透性
在C3D1采集血液样本和CSF样本,测定HZ-A-018浓度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分子模拟 | PDB ID 5P9J | -- | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | GIBCO | -- |
| Iscove改良Dulbecco培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 细胞活性检测 | CellTiter 96非放射性细胞增殖检测试剂盒 | Promega | -- |
| CCK-8试剂盒 | -- | -- | |
| SpectraMax 340酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| PVDF膜 | Bio-Rad | -- | |
| p-BTK抗体 | CST | 87141 | |
| BTK抗体 | CST | 8547 | |
| ERK抗体 | CST | 4695 | |
| p-ERK抗体 | CST | 4370 | |
| PLCγ-2抗体 | CST | 3872 | |
| p-PLCγ-2抗体 | CST | 3871 | |
| ECL检测系统 | EMD Millipore | WBKLS0050 | |
| Quantity One软件 | Bio-Rad | -- | |
| 动物实验 | 脑立体定位仪 | David Kopf Instruments | -- |
| Hamilton微量进样器 | -- | -- | |
| CB17-SCID小鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活性检测 | 细胞系:OCI-LY10、SU-DHL-6、WSU-DLCL2、Mino、TMD8等;处理时间及浓度剂量;检测试剂MTS/CCK8的使用量;孵育时间1-4小时;检测波长 阅读提示:Materials and Methods 2.5 Cell viability assay |
| Western blotting | 蛋白上样量40 μg;SDS-PAGE浓度12%;抗体种类及稀释比例;孵育条件;显色系统 阅读提示:Materials and Methods 2.6 Western blot |
| 动物模型 | 小鼠品系:雌性CB17-SCID,4-5周;细胞接种量:105细胞/鼠;注射坐标:前囟前0.4 mm,右侧2 mm,深度3 mm;注射体积2 μL;注射速率667 nL/min,持续3 min;给药剂量:HZ-A-018 60或90 mg/kg,bid;ibrutinib 60 mg/kg,bid 阅读提示:Materials and Methods 2.7 Animal model construction; Figure S15 |
| 1期临床试验安全性评估 | 剂量递增:300 mg、450 mg、600 mg QD;患者纳入标准:r/r CNSL,至少一线治疗失败;DLT定义;评估周期:首28天;CTCAE v5.0 阅读提示:Materials and Methods 2.9 Trial design and treatment; 2.10 Patients; 2.11 Assessments; Results 3.4 Safety |
| 1期临床试验疗效评估 | 疗效评估标准:国际PCNSL协作组标准;基线影像学检查(MRI、CT、PET/CT);随访时间点:C2D1、C3D1、C5D1,之后每8周一次;ORR/CRR计算 阅读提示:Materials and Methods 2.11 Assessments; Results 3.5 Efficacy |
| 药代动力学分析 | 血浆采样时间:给药前,给药后20 min、1、2、3、5 h;CSF采样时间:给药后2 h;检测方法:LC-MS 阅读提示:Materials and Methods 2.11 Assessments; Results 3.6 Pharmacokinetics |