人群队列分析脾脏体积与MASLD相关性
验证MASLD/MASH进展与脾脏增大的关联,提示脾-肝轴的存在。
采用两个独立人群队列(共4537例),通过CT测量脾脏长度、宽度、面积及肝/脾CT值比,分析脾脏大小与MASLD严重程度的相关性。
Metabolically and epigenetically reprogrammed splenic TRNP1hiCD8+ T cells exacerbate liver fibrosis
包含人群队列、scRNA-seq、多种小鼠模型(MCDHFD等)及体内外功能实验(敲除、过继转移、抗体阻断),并涉及多组学(RNA-seq、Hi-C、CUT&TAG)和分子机制验证(FURIN/CTSD、INSR-α)。
小鼠MCDHFD诱导MASLD/MASH模型 小鼠CDAHFD诱导MASLD/MASH模型 小鼠HFD/WD诱导MASLD/MASH模型 患者PBMC来源CD8+ T细胞
小鼠模型诱导饮食:MCDHFD(7周)、CDAHFD(7周)、WD(7周)、HFD(5个月) TRNP1hiCD8+ T细胞过继转移剂量:2×10^5细胞/次,每周一次,尾静脉注射 DT注射剂量:10 ng/g,每周两次,腹腔注射 INSR-α中和抗体/ersodetug剂量:100 μg/次,每周两次,腹腔注射 体外CD8+ T细胞培养:L-甲硫氨酸缺乏培养基或补充L-甲硫氨酸(100 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MASLD/MASH进展与脾脏增大的关联,提示脾-肝轴的存在。
采用两个独立人群队列(共4537例),通过CT测量脾脏长度、宽度、面积及肝/脾CT值比,分析脾脏大小与MASLD严重程度的相关性。
发现MASLD/MASH脾脏中特异性变化的CD8+ T细胞亚群及关键转录因子。
对MCDHFD诱导的MASLD/MASH小鼠脾细胞进行scRNA-seq和单细胞TCR测序,分析T细胞亚群变化,鉴定TRNP1高表达的CD8+ T细胞。
确认TRNP1在MASLD/MASH脾脏CD8+ T细胞中的特异诱导。
通过RNAscope、RT-qPCR和Western blot检测多种饮食模型下脾脏CD8+ T细胞中TRNP1的表达,并排除肝脏CD8+ T细胞及外周血中的显著变化。
建立TRNP1hiCD8+ T细胞与肝纤维化之间的因果关系。
构建CD8+ T特异性Trnp1敲除小鼠,诱导MASLD/MASH模型,检测肝纤维化指标;并过继转移TRNP1hiCD8+ T细胞观察纤维化加剧。
进一步验证TRNP1hiCD8+ T细胞在体内的促纤维化作用。
利用Trnp1dtrCd8cre小鼠注射DT选择性清除TRNP1hiCD8+ T细胞,观察纤维化减轻;并通过脾切除术进一步验证脾脏来源。
探究TRNP1hiCD8+ T细胞激活肝星状细胞的机制。
将脾脏TRNP1hiCD8+ T细胞与原代HSCs共培养,检测HSC激活;通过SomaScan蛋白质组学、孟德尔随机化鉴定分泌蛋白INSR-α,并在体外验证其激活HSCs。
验证靶向INSR-α能否治疗MASLD/MASH相关肝纤维化。
在MCDHFD和CDAHFD模型中给予INSR中和抗体或ersodetug,评估肝纤维化程度。
阐明TRNP1如何促进INSR-α的成熟和脱落。
通过RNA-seq、CUT&TAG-seq、Hi-C等分析,鉴定TRNP1下游靶基因FURIN和CTSD,并通过过表达、免疫共定位、报告基因等实验验证其对INSR-α加工分泌的作用。
验证TRNP1hiCD8+ T细胞及INSR-α在人类MASLD/MASH纤维化中的相关性。
检测MASLD患者外周血CD8+ T细胞中TRNP1、FURIN、CTSD表达和血清INSR-α水平,并分析与脾脏大小及纤维化指标的相关性;在体外用L-甲硫氨酸缺乏培养基处理人类CD8+ T细胞验证表观遗传机制。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | 11875093 |
| RPMI 1640 L-甲硫氨酸缺乏培养基 | Gibco | A1451701 | |
| DMEM培养基 | Gibco | 11965092 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141C | |
| 胰蛋白酶-EDTA (0.05%) | Gibco | 25300054 | |
| HEK293T细胞 | ATCC | CRL-3216 | |
| CD8+ T细胞分选 | CD8+ T细胞磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-117-044 |
| 淋巴细胞分离液 | Serumwerk Bemburg | 1858 | |
| CD8磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-201 | |
| CD8+ T细胞培养 | 抗CD3抗体 | BD Biosciences | 553057 |
| 抗CD28抗体 | BD Biosciences | 553294 | |
| 白细胞介素-2 | Novoprotein | Ck24 | |
| 二甲基亚砜 | MedChemExpress | HY-Y0320 | |
| L-甲硫氨酸 | MedChemExpress | HY-N0326 | |
| 氯化胆碱 | MedChemExpress | HY-B1337 | |
| EPZ6438 | MedChemExpress | HY-13803 | |
| 5-氮杂-2'-脱氧胞苷 | MedChemExpress | HY-A0004 | |
| 动物实验 | 白喉毒素 | Aladdin | D381867 |
| 重组INSR蛋白 | MedChemExpress | HY-P73873 | |
| INSR中和抗体 | BioXcell | BE0338 | |
| ersodetug | MedChemExpress | HY-P990712 | |
| HSC分离 | OptiPrep密度梯度液 | Sigma-Aldrich | D1556 |
| HSC培养 | 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | TR-1003-G |
| 嘌呤霉素 | 文中未明确说明 | -- | |
| 重组INSR-α蛋白 | MedChemExpress | HY-P73873A | |
| ELISA | 乙酰辅酶A ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-0125 |
| INSR-α ELISA试剂盒(小鼠) | YOUBOSEN | YBS-10199 | |
| INSR-α ELISA试剂盒(人) | YOUBOSEN | YBS-20199 | |
| INSR-β ELISA试剂盒 | Fine Test | EM1175 | |
| 胰岛素ELISA试剂盒 | Beyotime | PI602 | |
| 免疫沉淀 | 抗His磁珠 | Sigma-Aldrich | H9914 |
| 抗Flag磁珠 | Sigma-Aldrich | M8823 | |
| CUT&RUN-qPCR | Hyperactive pG-MNase CUT&RUN试剂盒 | Vazyme | HD101 |
| 免疫荧光 | 多聚赖氨酸溶液 | Sangon Biotech | E607014 |
| BD破膜/洗涤缓冲液 | BD Biosciences | 554723 | |
| DAPI荧光染料 | Abcam | ab104139 | |
| RNAscope | 靶向Trnp1 mRNA的RNAscope探针 | Advanced Cell Diagnostics | 851361 |
| RNA-蛋白共检测辅助试剂盒 | Advanced Cell Diagnostics | 323180 | |
| 脂滴染色 | 尼罗红试剂 | MedChemExpress | HY-D0718 |
| BODIPY荧光染料 | MedChemExpress | HY-D1614 | |
| 肝功能和脂质检测 | FDC-7000i全自动生化分析仪 | FUJIFILM | -- |
| 组织胆固醇含量检测试剂盒 | Solarbio | BC1985 | |
| 组织甘油三酯含量检测试剂盒 | Solarbio | BC0625 | |
| 组织学染色 | 抗α-SMA抗体 | Servicebio | GB111364 |
| 抗F4/80抗体 | Servicebio | GB113373 | |
| 抗Ly6G抗体 | Servicebio | GB11229 | |
| 光学显微镜(Pannoramic DESK) | 3D HISTECH | -- | |
| 病毒转导 | Vectofusin-1转染试剂 | Miltenyi Biotec | 130-111-163 |
| 流式细胞术 | Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | -- |
| Fortessa流式细胞仪 | BD Bioscience | -- | |
| RNA提取和qPCR | TRIzol试剂 | 文中未明确说明 | -- |
| HiScript III一步法逆转录预混液 | Vazyme | R333 | |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711 | |
| LightCycler实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 细胞分级分离 | 质膜蛋白分离试剂盒 | Minute | SM-005 |
| 高尔基体蛋白分离试剂盒 | Minute | GO-037 | |
| 内质网蛋白分离试剂盒 | Minute | ER-036 | |
| 核蛋白分离试剂盒 | Beyotime | P0027 | |
| 蛋白质组学 | SomaScan 7k检测 | SomaLogic | -- |
| Western blot | 细胞裂解液 | Cell Signaling Technology | 9803 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23250 | |
| PVDF膜 | GE Healthcare | -- | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 34580 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 小鼠品系(C57BL/6),年龄(6周龄),饮食类型及时间(MCDHFD、CDAHFD、WD 7周;HFD 5个月) 阅读提示:Methods: Mice |
| TRNP1hiCD8+ T细胞过继转移 | 细胞来源(小鼠脾脏),细胞数量(2×10^5个),转移途径(尾静脉注射),频率(每周1次) 阅读提示:Methods: Mice |
| TRNP1hiCD8+ T细胞清除 | DT剂量(10 ng/g),给药频率(每周2次),给药途径(腹腔注射) 阅读提示:Methods: Mice |
| CD8+ T细胞体外培养 | L-甲硫氨酸缺乏培养基处理时间(ATAC-seq和CUT&TAG-seq为6小时,mRNA/蛋白提取为8小时),补充L-甲硫氨酸浓度(100 μM) 阅读提示:Methods: Ex vivo CD8+ T cell culture |
| INSR-α中和抗体/ersodetug处理 | 抗体剂量(100 μg/次),给药频率(每周2次),给药途径(腹腔注射) 阅读提示:Methods: Injection of recombinant INSR or its neutralizing antibodies |