临床样本和动物模型中NLRC3表达分析
评估NLRC3在脓毒症免疫抑制中的表达变化及其与免疫抑制标志物的相关性。
检测35例脓毒症患者和29例非脓毒症供者单核细胞中NLRC3表达,并与HLA-DR、TNF-α产生和SOFA评分进行相关性分析;建立CLP小鼠模型,检测肺泡巨噬细胞和腹腔巨噬细胞中NLRC3表达。
NLRC3 expression in macrophage impairs glycolysis and host immune defense by modulating the NF-κB-NFAT5 complex during septic immunosuppression
包含临床患者样本、小鼠CLP模型、细胞实验、RNA-seq、机制研究及AAV基因治疗等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
脓毒症患者单核细胞 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) RAW 264.7巨噬细胞系 CLP脓毒症小鼠模型
NLRC3表达水平与HLA-DR和TNF-α产生的相关性 NLRC3髓系特异性敲除小鼠(NLRC3ΔMac)的构建和验证 LPS诱导的免疫耐受模型(100 ng/mL LPS预处理24小时) CLP手术及继发性铜绿假单胞菌感染模型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估NLRC3在脓毒症免疫抑制中的表达变化及其与免疫抑制标志物的相关性。
检测35例脓毒症患者和29例非脓毒症供者单核细胞中NLRC3表达,并与HLA-DR、TNF-α产生和SOFA评分进行相关性分析;建立CLP小鼠模型,检测肺泡巨噬细胞和腹腔巨噬细胞中NLRC3表达。
确定髓系NLRC3缺失对脓毒症免疫抑制和继发感染抵抗力的影响。
将NLRC3 floxed小鼠与LysM-Cre小鼠杂交,获得髓系特异性敲除小鼠(NLRC3ΔMac),进行CLP手术和继发铜绿假单胞菌感染,评估生存率、细菌载量、细胞因子水平和肺部病理。
研究NLRC3对巨噬细胞糖酵解的影响。
通过qPCR检测糖酵解基因表达,测量乳酸产生,使用Seahorse分析ECAR,并在NLRC3敲除或过表达细胞中验证。
阐明NLRC3调节糖酵解的分子机制。
通过免疫共沉淀、ChIP、qPCR和报告基因实验,检测NLRC3与mTOR、p300的相互作用,以及NF-κB与NFAT5启动子的结合。
评估AAV介导的巨噬细胞特异性NLRC3敲低对脓毒症小鼠继发感染的防御效果。
构建AAV-SP146-miR30-shNLRC3-eGFP,通过气管内注射感染小鼠,诱导CLP和继发感染,评估生存率、细菌载量和细胞因子水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Invitrogen | 12-167F |
| 胎牛血清 | Millipore | TMS-013-B | |
| 青霉素/链霉素 | HyClone | 15070-063 | |
| 细胞刺激 | 脂多糖 | Sigma | L6529 |
| 细胞培养 | 重组巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 315-02 |
| 病毒转导 | 聚凝胺 | Sigma | H9268 |
| 药物处理 | INK128 | Selleck Chemicals | S281104 |
| BAY 11-7082 | Selleck Chemicals | S2913 | |
| 浅蓝菌素 | Sigma | C2389 | |
| KRN2 | Sigma | 248260-75-5 | |
| 细胞分离 | Ficoll/Paque分离液 | GE Healthcare | 17-1440-03 |
| 流式细胞术 | HLA-DR抗体 | BioLegend | 307619 |
| qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| PrimeScript RT试剂盒(含gDNA去除剂) | TaKaRa | RR047B | |
| SYBR Premix Ex Taq II检测试剂盒 | TaKaRa | RR820A | |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | Cayman Chemical | 500850 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Cayman Chemical | 583371 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC001b | |
| 代谢测定 | 乳酸检测试剂盒 | Cayman Chemicals | 700510 |
| Seahorse XFe24细胞外流量分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| XF糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103020-100 | |
| 免疫沉淀 | 抗TRAF6抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8409 |
| 抗K63泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 5621 | |
| 蛋白G琼脂糖珠 | Cell Signaling Technology | 9863 | |
| 免疫印迹 | 抗NLRC3抗体 | Abcam | ab77817 |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| ChIP | Pierce琼脂糖ChIP试剂盒 | Pierce | 26156 |
| 基因治疗 | AAV-SP-shNLRC3 | Hanbio Biotechnology | -- |
| 动物实验 | 亚胺培南-西司他丁 | Merck | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 脓毒症患者纳入标准:SOFA评分变化≥2;样本采集时间:入院第1-2天;单核细胞分离方法:密度梯度离心和塑料贴壁法 阅读提示:Materials and methods - Patients and samples |
| 小鼠模型 | 小鼠品系:C57BL/6;年龄:8-9周;CLP手术:50%盲肠结扎,20号针穿刺两次;抗生素:亚胺培南-西司他丁25 mg/kg,CLP后6小时开始,每12小时一次,持续4天;继发感染:CLP后48小时气管内注射3×10^9 CFU/mL铜绿假单胞菌20 μL 阅读提示:Materials and methods - Polymicrobial sepsis model and secondary infection |
| 细胞培养和LPS耐受模型 | 细胞类型:BMDM、RAW 264.7;LPS浓度:100 ng/mL(预处理和再刺激);耐受诱导:LPS预处理24小时,洗涤,恢复2小时,再刺激;巨噬细胞集落刺激因子浓度:30 ng/mL(BMDM分化) 阅读提示:Materials and methods - Cell preparation |
| 代谢测定 | ECAR检测:Seahorse XFe24分析仪,细胞数2×10^5/孔;乳酸检测:使用乳酸检测试剂盒,样品去蛋白处理 阅读提示:Materials and methods - Metabolism assays |
| 机制实验 | 抑制剂浓度:INK128 300 nM,BAY11-7082 300 μM,KRN2 0.8 μM,cerulenin 10 μM;预处理时间:1小时;ChIP实验:抗p65抗体,甲醛交联5分钟 阅读提示:Materials and methods - Cell preparation and Chromatin immunoprecipitation |