建立体内外模型
建立痛风性关节炎的细胞和小鼠模型,以研究 USP16 和 Drp1 的作用。
C57BL/6 小鼠关节内注射 MSU 建立痛风性关节炎模型;RAW264.7 和 J774A.1 细胞经 LPS 预刺激后用 MSU 处理。
Deubiquitinase USP16 induces gouty arthritis via Drp1-dependent mitochondrial fission and NLRP3 inflammasome activation
包含细胞实验(巨噬细胞 RAW264.7、J774A.1)和小鼠模型,通过过表达/敲低、Co-IP、GST pull-down、TEM、MitoSOX 等验证机制。
MSU 诱导的痛风性关节炎小鼠模型 RAW264.7 细胞 J774A.1 细胞 HEK293T 细胞
MSU 处理细胞浓度 200 μg/mL,刺激时间 6 h LPS 预处理 100 ng/mL 1 h Drp1 敲低 shRNA 序列及体内注射剂量 USP16 敲低 shRNA 序列 BAY 11-7082 浓度 4 μM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立痛风性关节炎的细胞和小鼠模型,以研究 USP16 和 Drp1 的作用。
C57BL/6 小鼠关节内注射 MSU 建立痛风性关节炎模型;RAW264.7 和 J774A.1 细胞经 LPS 预刺激后用 MSU 处理。
检测 Drp1 在体外和体内的表达及其对炎症反应的影响。
通过 RT-qPCR、Western blot、ELISA 和病理染色检测 Drp1 表达及炎症指标。
确定 Drp1 是否通过 NF-κB/NLRP3 通路发挥作用。
使用 Western blot 检测 NF-κB 和 NLRP3 通路蛋白,并使用 NF-κB 抑制剂 BAY 11-7082 处理细胞。
探究 Drp1 是否通过调控线粒体分裂影响 NF-κB/NLRP3 信号。
使用 TEM 观察线粒体结构,MitoSOX 检测线粒体 ROS,并用 MitoTEMPOL 处理。
检测 USP16 是否与 Drp1 直接结合并影响其泛素化。
通过 Co-IP 和 GST pull-down 验证相互作用,用 CHX 和 MG132 处理分析蛋白稳定性,检测 Drp1 泛素化水平。
确定 USP16 是否通过 Drp1 依赖性机制诱导痛风性关节炎。
敲低 USP16 后检测炎症指标,并过表达 Drp1 进行回补实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640 培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000 转染试剂 | Invitrogen | -- |
| pcDNA3.1 载体 | Invitrogen | -- | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 单钠尿酸盐 | Sigma-Aldrich | -- | |
| BAY 11-7082 | Sigma-Aldrich | -- | |
| MG132 | Sigma-Aldrich | -- | |
| MitoTEMPOL | Abcam | -- | |
| RNA提取 | TRIzol 试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT 试剂 | TaKaRa | -- |
| SYBR Green 预混液 | Invitrogen | -- | |
| Western blot | IP 裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Pierce | -- | |
| ECL 检测试剂 | Pierce | -- | |
| ELISA | 小鼠 IL-1β ELISA 试剂盒 | Invitogen | BMS6002 |
| 小鼠 TNF-α ELISA 试剂盒 | Invitogen | BMS607-3 | |
| 小鼠 IL-6 ELISA 试剂盒 | Invitogen | BMS603-2 | |
| 酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗氧化酶活性检测 | 过氧化氢酶活性检测试剂盒 | Abcam | ab83464 |
| 谷胱甘肽过氧化物酶检测试剂盒 | Abcam | ab102530 | |
| 超氧化物歧化酶活性检测试剂盒 | Abcam | ab65354 | |
| LDH释放检测 | CyQUANT LDH 细胞毒性检测试剂盒 | Invitrogen | C20300 |
| 线粒体超氧化物检测 | MitoSOX Red 染料 | Invitrogen | M36008 |
| 透射电子显微镜 | 透射电子显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 共聚焦显微镜 | 共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| 免疫共沉淀 | Pierce 交联磁性免疫共沉淀试剂盒 | Pierce | -- |
| GST pull-down | Pierce GST pull-down 试剂盒 | Pierce | -- |
| Western blot | Drp1 抗体 | Abcam | ab184247 |
| p65 抗体 | CST | #8242 | |
| p-p65 抗体 | CST | #3033 | |
| IκBα 抗体 | CST | #4814 | |
| p-IκBα 抗体 | CST | #2859 | |
| NLRP3 抗体 | Abcam | ab263899 | |
| Caspase-1 抗体 | Abcam | ab1384832 | |
| USP16 抗体 | Proteintech | 14055-1-AP | |
| GAPDH 抗体 | Abcam | ab8245 | |
| 动物实验 | 单钠尿酸盐 | Sigma-Aldrich | -- |
| sh-Drp1 | GenePharma | -- | |
| sh-USP16 | GenePharma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、周龄、性别、体重;MSU 剂量、给药体积、注射方式 阅读提示:Materials and methods, Animal study |
| 细胞培养和刺激 | 细胞系、培养基、FBS 浓度、培养条件;LPS 和 MSU 浓度、处理时间 阅读提示:Materials and methods, Cell culture, transfection and treatment |
| 基因敲低和过表达 | shRNA 序列、转染试剂、DNA 用量、转染时间验证敲低效率 阅读提示:Materials and methods, Cell culture; Figure S1 |
| Western blot 检测 | 蛋白提取裂解液、抗体货号及稀释比、内参 阅读提示:Materials and methods, Western blot; Table 2 |
| 线粒体功能检测 | MitoSOX 染色浓度和时间;TEM 样品处理 阅读提示:Materials and methods, Mitochondrial superoxide measurement, Transmission electron microscopy |