检测Nt3 mRNA和proNT3蛋白表达
明确神经创伤后DRG和脊髓中Nt3 mRNA和proNT3蛋白的表达变化及细胞定位。
利用RT-PCR和Western blot检测CCI/SNL小鼠DRG和脊髓中Nt3 mRNA和proNT3蛋白水平;利用ISHH检测Nt3 mRNA在DRG中的分布。
Contribution of proneurotrophin-3 to nerve trauma-induced neuropathic pain through promoting TrkC-mediated increase of CCL2 in primary sensory neurons
包含行为学检测(机械、热、冷痛觉及CPP)、分子表达检测(RT-PCR、Western blot)、单细胞RT-PCR、原位杂交、基因敲降(siRNA、cKD)及过表达(AAV5)等功能验证和机制验证。
小鼠CCI模型 小鼠SNL模型 DRG神经元 Nt3条件敲降小鼠
Nt3 siRNA DRG微注射(1 μl/DRG;80 μM;sc-42126) Nt3 cKD小鼠(他莫昔芬注射,1 mg/只/天,连续7天) AAV5-proNT3 DRG微注射(1 μl/DRG;4-9 × 10^12基因组拷贝/ml) NT3鞘内注射(2 μg/5 μl;Sino Biological, 10286-HNAE) TrkC siRNA(Thermo Fisher Scientific, 143655)和Ccl2 siRNA DRG微注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确神经创伤后DRG和脊髓中Nt3 mRNA和proNT3蛋白的表达变化及细胞定位。
利用RT-PCR和Western blot检测CCI/SNL小鼠DRG和脊髓中Nt3 mRNA和proNT3蛋白水平;利用ISHH检测Nt3 mRNA在DRG中的分布。
验证DRG proNT3上调是否参与神经创伤诱导的疼痛的发展。
通过DRG微注射Nt3 siRNA或Nt3 cKD小鼠阻断proNT3上调,观察CCI诱导的机械、热、冷痛觉过敏和自发痛(CPP)的变化。
验证DRG proNT3上调是否足以引起神经病理性疼痛样症状。
通过DRG微注射AAV5-proNT3过表达proNT3,观察疼痛行为变化及TrkA/TrkB/TrkC siRNA的影响。
评估外源性NT3对CCI或proNT3过表达引起的疼痛的影响。
在CCI术后7天或AAV5-proNT3微注射后28天,鞘内注射NT3蛋白,观察机械和热痛觉过敏的变化。
验证proNT3上调是否通过TrkC介导CCL2表达增加。
检测Nt3 siRNA、Nt3 cKD、AAV5-proNT3、TrkC siRNA或Ccl2 siRNA处理对DRG中Ccl2 mRNA和CCL2蛋白水平的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | CD1小鼠 | Charles River Laboratories | Wilmington, MA, USA |
| AdvillinCreERT2/+小鼠 | Jackson Laboratory | Bar Harbor, ME, USA | |
| NT3f/f小鼠 | Jackson Laboratory | Bar Harbor, ME, USA | |
| 基因敲降 | Nt3 siRNA | Santa Cruz Biotechnology | sc-42126 |
| TrkA siRNA | Santa Cruz Biotechnology | sc-36727 | |
| TrkB siRNA | Thermo Fisher Scientific | 155697 | |
| TrkC siRNA | Thermo Fisher Scientific | 143655 | |
| 药物处理 | NT3蛋白 | Sino Biological | 10286-HNAE |
| 转染试剂 | TurboFect™体内转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | R0531 |
| RNA提取 | miRNeasy试剂盒 | Qiagen | Valencia, CA, USA |
| 逆转录 | Thermo Script逆转录酶 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | Waltham, MA, USA |
| RT-qPCR | Advanced Universal SYBR Green Supermix | Bio-Rad Laboratories | -- |
| Bio-Rad CFX96实时PCR系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| Western blot | 兔抗NT3抗体 | Alomone Labs | ANT-003 |
| 兔抗MCP-1抗体 | Abcam | ab315478 | |
| 兔抗TrkA抗体 | Cell Signaling Technology | 2505 | |
| 兔抗TrkB抗体 | GeneTex | GTX133722 | |
| 兔抗TrkC抗体 | Alomone Labs | ANT-020 | |
| 兔抗ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 兔抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 小鼠抗GFAP抗体 | Cell Signaling Technology | 3670 | |
| 兔抗IBA1抗体 | Cell Signaling Technology | 17198 | |
| 兔抗GAPDH抗体 | Sigma-Aldrich | G9545 | |
| 兔抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2144 | |
| Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | -- | |
| ChemiDoc XRS成像系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| Image Lab软件 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 原位杂交 | IsHyb原位杂交试剂盒 | -- | K2191050 |
| 蛋白酶K | Roche | 3115828001 | |
| 鸡抗β-微管蛋白III抗体 | MilliporeSigma | AB9354 | |
| 小鼠抗谷氨酰胺合成酶抗体 | MilliporeSigma | MAB302 | |
| 荧光显微镜 | Leica DMI4000荧光显微镜 | Leica | -- |
| DFC365 FX相机 | Leica | -- | |
| 单细胞RT-PCR | 细胞裂解缓冲液 | Signosis | Sunnyvale, CA |
| 单细胞RT-PCR检测试剂盒 | Signosis | -- | |
| 病毒生产 | SuperScript IV一步法RT-qPCR系统 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | -- |
| Platinum Taq高保真试剂盒 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | -- | |
| AAVpro纯化试剂盒 | Takara | Mountain View, CA | |
| AAV实时PCR滴定试剂盒 | Takara | -- | |
| 行为测试 | von Frey纤维丝 | Stoelting Co. | Wood Dale, IL, USA |
| Model 336痛觉计 | IITC Inc. Life Science Instruments | Woodland Hills, CA, USA | |
| CPP装置 | Med Associates Inc. | Fairfax, VT, USA | |
| 蛋白质浓度测定 | Bio-Rad蛋白测定 | Bio-Rad Laboratories | Hercules, CA, USA |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、周龄、性别、来源;CCI手术结扎松紧度;SNL手术位置 阅读提示:Methods 2.1 Animal preparations, 2.2 Neuropathic pain models |
| DRG微注射 | 病毒或siRNA剂量、注射体积、注射时间点、注射位置 阅读提示:Methods 2.3 DRG microinjection |
| 鞘内注射 | NT3蛋白剂量、体积、注射时间点 阅读提示:Methods 2.4 Intrathecal injection |
| 行为测试 | 测试时间点、适应时间、刺激参数、设备型号 阅读提示:Methods 2.5 Behavioral tests |
| 分子检测 | RNA提取方法、引物序列、内参基因、蛋白上样量、抗体浓度 阅读提示:Methods 2.6 RT-PCR, 2.7 Western blotting |