检测FGFR1在动脉粥样硬化中的表达
明确FGFR1在AS病变中的表达水平和细胞定位。
对HFD喂养的Apoe−/−小鼠主动脉及人冠状动脉样本进行免疫组化和免疫荧光染色,分析FGFR1和p-FGFR1表达,并通过scRNA-seq分析细胞类型分布。
Macrophage-derived FGFR1 drives atherosclerosis through PLCγ-mediated activation of NF-κB inflammatory signalling pathway
包含细胞实验、髓系特异性基因敲除小鼠模型、药物抑制、RNA-seq及人样本验证等多层级证据,并进行功能验证和机制验证。
Apoe−/−小鼠高脂饮食诱导动脉粥样硬化模型 髓系特异性Fgfr1敲除Apoe−/−小鼠(DKO) 小鼠原代腹腔巨噬细胞(MPMs) RAW264.7巨噬细胞系
确认骨髓来源巨噬细胞中Fgfr1敲除效率 AZD4547给药方案(10 mg/kg,隔日一次,灌胃) 高脂饮食喂养周期和成分(21.2%脂肪,0.2%胆固醇,12周) ox-LDL处理浓度和时间(50 μg/mL或100 μg/mL,不同时间点)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确FGFR1在AS病变中的表达水平和细胞定位。
对HFD喂养的Apoe−/−小鼠主动脉及人冠状动脉样本进行免疫组化和免疫荧光染色,分析FGFR1和p-FGFR1表达,并通过scRNA-seq分析细胞类型分布。
验证髓系FGFR1缺失或药物抑制对AS发展的影响。
构建髓系特异性Fgfr1敲除Apoe−/−小鼠(DKO),与对照组比较HFD诱导的动脉粥样硬化病变;同时用FGFR1抑制剂AZD4547处理Apoe−/−小鼠。
评估FGFR1缺失或抑制对炎症因子和脂质积累的影响。
通过ELISA、qPCR和Western blot检测血清和组织中IL-6、TNF-α等炎症因子,通过Oil Red O染色和免疫组化评估斑块和脂质积累。
在细胞水平验证FGFR1对巨噬细胞炎症反应和ox-LDL摄取的影响,并探究其下游机制。
从Fgfr1f/f和Fgfr1CKO小鼠分离MPMs,用ox-LDL刺激,检测炎症因子表达和脂质摄取;用siRNA敲低PLCγ或FRS2,观察NF-κB激活和炎症因子表达。
阐明FGFR1下游信号通路和机制。
对ox-LDL刺激的Fgfr1f/f和Fgfr1CKO MPMs进行RNA-seq,分析差异表达基因,进行KEGG和GSEA富集分析,并验证PLCγ和NF-κB磷酸化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | AZD4547 | Shanghai Kaiyu Pharmatech Technology Co. Ltd | -- |
| 细胞处理 | 氧化低密度脂蛋白 | Yiyuan Biomedical Technologies | YB-002 |
| Dil标记的氧化低密度脂蛋白 | Yiyuan Biomedical Technologies | YB-0010 | |
| 蛋白质印迹 | GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 |
| FGFR1抗体 | Cell Signaling Technology | 9740 | |
| PLCγ抗体 | Cell Signaling Technology | 2822 | |
| 磷酸化PLCγ (Y783)抗体 | Cell Signaling Technology | 2821 | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 磷酸化NF-κB p65 (S536)抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| VCAM-1抗体 | Cell Signaling Technology | 39036 | |
| 磷酸化FGFR1 (Y654)抗体 | Abcam | ab59194 | |
| FRS2抗体 | Abcam | ab137458 | |
| 磷酸化FRS2 (Y436)抗体 | Abcam | ab193363 | |
| 免疫荧光 | α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Abcam | ab124964 |
| CD68抗体 | Abcam | ab303565 | |
| Ki67抗体 | Abcam | 15580 | |
| 网格蛋白重链抗体 | Santa Cruz Technology | sc-271178 | |
| 蛋白质印迹 | α-微管蛋白抗体 | Proteintech Group | 11224-1-AP |
| ApoB抗体 | Proteintech Group | 20578-1-AP | |
| 免疫荧光 | MOMA2抗体 | Bio-Rad Laboratories | MCA519G |
| 流式细胞术 | APC标记的抗CD45R/B220抗体 | BioLegend | 103211 |
| PE标记的抗CD11b抗体 | BioLegend | 101207 | |
| Brilliant Violet 421标记的抗Ly6C抗体 | BioLegend | 128031 | |
| PE/Cyanine7标记的抗Ly6G/Ly6C (Gr1)抗体 | Elabscience Biotechnology Co. Ltd | E-AB-F1120H | |
| 免疫沉淀对照 | 兔IgG | ABclonal Technology Co. Ltd | AC042 |
| 小鼠IgG同型对照 | ABclonal Technology Co. Ltd | AC011 | |
| 染色 | 油红O染色试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 生化分析 | 总胆固醇测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-1 |
| 甘油三酯测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 | |
| LDL胆固醇测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A113-1-1 | |
| HDL胆固醇测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A112-1-1 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | 文中未明确说明 | -- |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher | -- | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher | -- | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Thermo Fisher | -- | |
| 动物实验 | 高脂饮食 | TROPHIC Animal Feed High-tech Co. Ltd | TP26300 |
| 正常饮食 | TROPHIC Animal Feed High-tech Co. Ltd | TP26322 | |
| Apoe−/−小鼠 | The Jackson Laboratory | 002052 | |
| Fgfr1f/f小鼠 | GemPharmatech Co. Ltd | T052281 | |
| LysM-Cre小鼠 | GemPharmatech Co. Ltd | T055107 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Thermo Fisher | P36935 |
| 流式细胞术 | BD FACSAria™ III流式细胞仪 | BD Bioscience | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| M-MLV Platinum SYBR Green qPCR SuperMix-UDG试剂盒 | Thermo Fisher | -- | |
| Eppendorf Mastercycler Realplex检测系统 | Eppendorf | -- | |
| RNA-seq | RNA测序服务 | Majorbio Technology Inc. | -- |
| 单细胞RNA-seq分析 | GSE214414数据集 | -- | -- |
| 蛋白质印迹 | Bradford蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 增强化学发光试剂 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 基因沉默 | 靶向Plcg1的siRNA | GenePharma Co. Ltd | -- |
| 靶向Frs2的siRNA | GenePharma Co. Ltd | -- | |
| 对照siRNA(乱序) | GenePharma Co. Ltd | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher | -- | |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | eBioscience | -- |
| IL-6 ELISA试剂盒 | eBioscience | -- | |
| 流式细胞术 | 可固定活力染料 | eBioscience | 65-0865-14 |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞处理 | ox-LDL浓度(50 μg/mL或100 μg/mL)、处理时间(5 min、15 min、12 h、24 h)、AZD4547预处理浓度(10 μM)和预处理时间(1 h) 阅读提示:Methods 2.12 |
| 动物实验 | 小鼠品系(Apoe−/−, Fgfr1f/f, LysM-Cre)、年龄(8周龄)、性别(雄性和雌性)、饮食(HFD含21.2%脂肪和0.2%胆固醇,ND含5%脂肪)、喂养周期(12周或52周)、AZD4547剂量(10 mg/kg)和给药方式(灌胃,隔日一次) 阅读提示:Methods 2.3 |
| 组织学分析 | 主动脉根部切片厚度(8 μm)、Oil Red O染色步骤和试剂、免疫组化抗体浓度(FGFR1, p-FGFR1, 1:200)、免疫荧光抗体浓度(CD68, FGFR1, p-NF-κB p65, MOMA2, Ki67, 1:200) 阅读提示:Methods 2.4 and 2.5 |
| 分子检测 | Western blot一抗浓度(1:1000或1:2000,具体未明确)、二抗浓度(1:500)、RNA提取试剂(TRIzol)、qPCR引物序列(见补充表S3)、内参基因(Actb) 阅读提示:Methods 2.7 and 2.9 |
| RNA-seq分析 | ox-LDL刺激浓度(50 μg/mL)和时间(12 h)、DEG阈值(4倍变化,P-adjust < 0.05)、单细胞RNA-seq数据集(GSE214414) 阅读提示:Methods 2.8 |