单细胞测序鉴定介导淋巴结转移的细胞亚群
识别T1期NSCLC中介导N2淋巴结转移的关键细胞亚群
对T1N0M0和T1N2M0 NSCLC组织及转移淋巴结样本进行10x Genomics scRNA-seq,鉴定出CCNE1(+)细胞亚群,并分析其恶性程度和功能。
FGL1-mediated lymph node metastasis in stage T1 non-small cell lung cancer: therapeutic targeting
包含单细胞测序、转录组、代谢组、质谱、体外细胞实验、体内动物模型及AAV靶向治疗验证,证据层级丰富。
A549、H226、H1299、H1703细胞系 LLC细胞系 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 NCG小鼠原位肺癌模型及足垫淋巴结转移模型
FGL1在CCNE1(+)细胞中高表达,该细胞亚群在T1N2M0样本中比例更高 FGL1敲低抑制糖酵解和EMT,影响肿瘤增殖和迁移 FGL1敲低抑制淋巴管形成和淋巴结转移 shFGL1_AAV9和shFGL1_AAV6在体内有效敲低FGL1并抑制肿瘤进展
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别T1期NSCLC中介导N2淋巴结转移的关键细胞亚群
对T1N0M0和T1N2M0 NSCLC组织及转移淋巴结样本进行10x Genomics scRNA-seq,鉴定出CCNE1(+)细胞亚群,并分析其恶性程度和功能。
验证FGL1在CCNE1(+)细胞中高表达,并鉴定其转录因子
通过免疫组化、免疫荧光、ChIP-qPCR和双荧光素酶报告基因实验,验证FGL1在NSCLC中高表达,并确认ETS1为转录因子。
阐明FGL1促进肿瘤转移的分子机制
通过转录组测序、代谢组学、质谱和Western blot,分析FGL1敲低后糖酵解和EMT相关分子变化。
验证FGL1对肿瘤增殖、迁移、侵袭和淋巴管形成的影响
通过CCK-8、克隆形成、划痕实验、Transwell和淋巴管形成实验,比较对照组和FGL1敲低组细胞的恶性表型。
验证FGL1对肿瘤生长、转移和淋巴结转移的促进作用
通过皮下移植瘤、原位肺癌模型和足垫淋巴结转移模型,观察FGL1敲低对肿瘤进展的影响。
评估shFGL1-AAV6和shFGL1-AAV9的体内治疗效果
通过气管内或瘤内注射shFGL1-AAV,观察对肿瘤生长和转移的抑制作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875119 |
| Ham's F-12K培养基 | Pricella | PM150910B | |
| DMEM高糖培养基 | Pricella | PM150210 | |
| 胎牛血清 | OPCEL | BS-1101 | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 免疫组化/免疫荧光 | 抗FGL1多克隆抗体 | Proteintech | 16000-1-AP |
| 抗Cyclin E1多克隆抗体 | Signalway Antibody | 40804 | |
| 抗GLUT1多克隆抗体 | Signalway Antibody | 40967 | |
| 抗GLUT3多克隆抗体 | Signalway Antibody | 55439 | |
| 抗PGAM1单克隆抗体 | Signalway Antibody | 49976 | |
| 抗LDHA抗体 | Signalway Antibody | 48492 | |
| 抗LDHB抗体 | Signalway antibody | 48009 | |
| 抗PDK1单克隆抗体 | Signalway antibody | 49573 | |
| 抗HK2抗体 | Signalway Antibody | 32115 | |
| 抗TGF-β抗体 | Proteintech | 21898-1-AP | |
| 抗Twist抗体 | Proteintech | 25465-1-AP | |
| 抗Slug抗体 | Signalway Antibody | 53574 | |
| 抗Snail抗体 | Signalway Antibody | 54899 | |
| 抗Vimentin抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| 抗E-cadherin抗体 | Proteintech | 60335-1-Ig | |
| 染色质免疫沉淀 | ChIP试剂盒 | BersinBio | Bes5001 |
| 抗FGL1抗体 | Proteintech | 16000-1-AP | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 脂质体2000 | Thermo Fisher Scientific | 11668019 |
| 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | E1910 | |
| 免疫沉淀 | 总蛋白提取试剂盒 | Invent Biotechnologies | SD-001/SN-002 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Mei5bio | MF035-01 |
| 代谢物检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 淋巴管形成实验 | 多聚赖氨酸溶液 | Pricella | PB180522 |
| 基质胶 | Corning | 354234 | |
| 淋巴内皮细胞 | Pricella | CP-H026 | |
| 细胞增殖实验 | 2-脱氧-D-葡萄糖 | TargetMol | T6742 |
| 细胞计数试剂盒-8 | New Cell & Molecular Biotech Co. Ltd | C6005 | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | GemPharmatech | -- |
| NCG小鼠 | GemPharmatech | -- | |
| shFGL1_AAV6 | HanBio Therapeutics | -- | |
| shFGL1_AAV9 | HanBio Therapeutics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 单细胞测序 | 样本类型、数量、平台和分析流程 阅读提示:Materials and methods, Single-cell sequencing and analysis |
| FGL1表达检测 | 抗体品牌和货号 阅读提示:Materials and methods, Immunohistochemistry and immunofluorescence |
| FGL1敲低 | shRNA序列、转染方法、筛选药物浓度 阅读提示:Materials and methods, FGL1 knockdown |
| 转录组测序 | 细胞系、数据处理流程 阅读提示:Materials and methods, RNA-sequencing and differential expression analysis |
| 代谢组学 | 细胞数量、处理方法 阅读提示:Materials and methods, Metabonomic analysis |
| 蛋白表达检测 | 抗体列表、稀释比例 阅读提示:Materials and methods, Western blotting |
| 糖酵解功能检测 | 试剂盒品牌、检测方法 阅读提示:Materials and methods, Glucose consumption, lactate production, and pyruvate production assays |
| 淋巴管形成实验 | 基质胶用量、共培养条件 阅读提示:Materials and methods, Lymph tube formation assay |
| 肿瘤增殖和迁移实验 | 2-DG浓度、细胞接种数量 阅读提示:Materials and methods, Tumor proliferation assays, Tumor migration assays |
| 动物实验 | 小鼠品系、细胞注射数量、AAV注射途径和剂量 阅读提示:Materials and methods, Xenograft tumor experiments, LLC cell in situ lung injection and shFGL1-AAV6 non-invasive tracheal injection, shFGL1_AAV9 intratumor injection targeted therapy |