组蛋白去乙酰化酶3依赖性通路限定外周髓鞘生长与功能再生

A histone deacetylase 3-dependent pathway delimits peripheral myelin growth and functional regeneration

作者信息Xuelian He, Liguo Zhang, Luis F Queme, Xuezhao Liu, Andrew Lu, Ronald R Waclaw, Xinran Dong, Wenhao Zhou, Grahame Kidd, Sung-Ok Yoon, Andres Buonanno, Joshua B Rubin, Mei Xin, Klaus-Armin Nave, Bruce D Trapp, Michael P Jankowski, Q Richard Lu
PMID29431744
期刊Nat Med
发布时间2018-03
DOI10.1038/nm.4483

实验完整度

包含体外细胞筛选、施万细胞-背根神经节共培养、小鼠遗传模型(条件性敲除和诱导性敲除)、坐骨神经损伤模型、药理学抑制、转录组和ChIP-seq等多层级验证,并包含功能恢复评估。

主要模型

大鼠原代施万细胞培养 施万细胞-背根神经节共培养 小鼠坐骨神经横断损伤模型 Hdac3条件性敲除小鼠(Cnp-Cre和Dhh-Cre)

重点核对

HDAC3抑制剂(RGFP966和PDA106)的给药剂量和时间方案 施万细胞特异性Hdac3敲除小鼠的构建和验证 坐骨神经损伤模型中髓鞘再生的定量分析(g比值和髓鞘化轴突数量) 体外实验中使用siRNA敲低Hdac3或Tead4的效率验证 神经功能恢复的电生理和感觉运动功能评估方法

摘要

施万细胞介导的髓鞘再生的缺陷会损害神经损伤后的功能恢复,从而导致周围神经病变。介导髓鞘再生阻滞的机制仍不清楚。在此,通过聚焦于表观遗传调节因子的小分子筛选,我们鉴定出组蛋白去乙酰化酶3(HDAC3;一种组蛋白修饰酶)是周围髓鞘形成的强效抑制剂。抑制HDAC3可增强髓鞘生长和再生,并改善小鼠周围神经损伤后的功能恢复。HDAC3拮抗生髓神经调节蛋白–PI3K–AKT信号轴。此外,全基因组分析显示,HDAC3通过表观遗传沉默抑制促髓鞘形成程序,同时与p300组蛋白乙酰转移酶协同激活包括HIPPO信号效应因子TEAD4在内的髓鞘形成抑制程序,从而抑制髓鞘生长。在小鼠中,施万细胞特异性缺失Hdac3或Tead4均导致坐骨神经髓鞘厚度增加。因此,我们的发现将HDAC3–TEAD4网络确定为细胞内在抑制机制的双功能开关,该机制对抗生髓信号并维持周围髓鞘稳态,凸显了短暂抑制HDAC3在改善周围髓鞘修复方面的治疗潜力。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
施万细胞介导的周围神经损伤后髓鞘再生受阻的机制是什么?
核心机制
HDAC3通过表观遗传沉默抑制促髓鞘形成基因,并与p300协同激活包括TEAD4在内的髓鞘形成抑制程序,同时拮抗NRG1–PI3K–AKT信号轴,从而限制髓鞘生长和再生。
主要证据
小分子筛选发现HDAC3抑制剂促进Egr2表达;Hdac3缺失导致髓鞘增厚和过度髓鞘化;HDAC3抑制增强损伤后髓鞘再生和功能恢复;ChIP-seq和RNA-seq显示HDAC3和p300共靶向调控髓鞘形成抑制基因。
研究意义
该研究揭示了HDAC3–TEAD4网络作为周围髓鞘稳态的双功能开关,为通过短暂抑制HDAC3改善周围神经损伤和脱髓鞘疾病中的髓鞘修复提供了潜在治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

表观遗传化合物文库筛选

鉴定能够调节施万细胞髓鞘形成潜能的表观遗传酶抑制剂。

使用靶向表观遗传酶的化合物库处理培养的大鼠施万细胞,通过实时qPCR检测Egr2表达,筛选出增强Egr2表达的化合物,其中HDAC3抑制剂(PDA106、RGFP966和apicidin)效果显著。

2

体外施万细胞成熟实验

验证HDAC3抑制对施万细胞成熟和髓鞘形成相关基因表达的影响。

用HDAC3抑制剂处理原代大鼠施万细胞,通过免疫细胞化学和qRT-PCR检测MPZ、PMP22等成熟标志物及肌动蛋白细胞骨架的变化。

3

体内药理学验证

评估HDAC3抑制剂在体内对周围神经髓鞘形成的影响。

新生小鼠从P1开始每日注射HDAC3抑制剂(RGFP966或PDA106),在P7和P15分析坐骨神经的髓鞘形成相关基因表达、EGR2+细胞比例以及髓鞘厚度。

4

坐骨神经损伤模型中的促再生实验

评估HDAC3抑制剂治疗对损伤后髓鞘再生和功能恢复的影响。

成年小鼠进行坐骨神经横断损伤(SNI)模型,术后第一天开始给予HDAC3抑制剂,在损伤后不同时间点(6、7、14、18、24、35、94、120天)分析髓鞘再生、电生理功能、感觉和运动功能恢复。

5

施万细胞特异性Hdac3敲除小鼠模型

确定HDAC3在施万细胞中的细胞内在功能。

通过Cnp-Cre或Dhh-Cre介导的Hdac3条件性敲除(Hdac3-cKO),或通过Plp1-CreERT和他莫昔芬诱导的敲除(Hdac3-iKO),分析敲除小鼠坐骨神经的髓鞘形成表型。

6

体外共培养和基因操作

验证HDAC3和TEAD4在施万细胞髓鞘形成中的功能。

在大鼠施万细胞中使用siRNA敲低Hdac3或Tead4,或过表达HDAC3、p300或TEAD4,通过施万细胞-背根神经节(DRG)共培养分析髓鞘形成能力,并检测相关基因表达。

7

转录组和表观基因组分析

揭示HDAC3调控的基因网络和表观遗传机制。

对Hdac3-cKO和对照小鼠坐骨神经进行RNA-seq,对培养的施万细胞进行ChIP-seq分析HDAC3、p300和组蛋白修饰的基因组分布。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Life Technologies--
胎牛血清Life Technologies--
神经调节蛋白1(NRG1 III型)R&D Systems396-HB-050
佛司可林SigmaF6886
二丁酰环磷腺苷SigmaD0627
多聚-D-赖氨酸SigmaP7890
表观遗传化合物文库Cayman11076
SingleShot细胞裂解试剂盒Bio-Rad172-5080
iTaq通用SYBR Green一步法试剂盒Bio-Rad172-5150
RGFP966MedKoo510205
PDA106MedKoo406720
抗坏血酸SigmaA0278
他莫昔芬SigmaT5648
抗HDAC3抗体Santa Cruz Biotechnologysc-11417
抗MPZ抗体Abcamab31851
抗MBP抗体Santa Cruz Biotechnologysc-13914
抗NF-M抗体MilliporeAB1987
抗SOX10抗体Santa Cruz Biotechnologysc-17342
抗EGR2抗体Santa Cruz Biotechnologysc-20690
抗Ki67抗体Thermo ScientificRM-9106
抗SOX2抗体Santa Cruz Biotechnologysc-17320
Lipofectamine 3000转染试剂Life Technologies--
Lipofectamine RNAiMAX转染试剂Life Technologies--
抗GAPDH抗体MilliporeMAB374
抗AKT抗体Cell Signaling Technology9272
抗磷酸化AKT抗体Cell Signaling Technology9271
抗ERK抗体Cell Signaling Technology4695
抗磷酸化ERK抗体Cell Signaling Technology4730
抗磷酸化PI3K抗体Cell Signaling Technology4228
抗PI3K抗体MilliporeABS233
抗TEAD4抗体Santa Cruz Biotechnologysc-101184
抗Flag抗体Cell Signaling Technology2368
抗PTEN抗体Cell Signaling Technology9559
抗乙酰化PTEN抗体Signalway AntibodyHW139
TRIzol试剂Life Technologies--
RNeasy Mini试剂盒Qiagen--
iScript反转录超混合液Bio-Rad--
StepOnePlus实时荧光定量PCR系统Applied Biosystems--
SYBR Green PCR混合液Bio-Rad170-8880
NEBNext ChIP-seq文库制备预混液套装(Illumina)NEBE6240L
抗p300抗体Santa Cruz Biotechnologysc-585
抗H3K27ac抗体Abcamab4729
抗H3K4me1抗体Abcamab8895

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
施万细胞分离与培养
施万细胞来源(新生大鼠1-2天),培养条件(DMEM+10% FBS,10 ng/ml NRG1,5 μM forskolin),细胞传代次数(P2-P5),分化条件(0.5% FBS+1 mM db-cAMP,3天)
阅读提示:Methods:Rat primary Schwann cell culture
小分子筛选
化合物浓度(5 μM),处理时间(8小时),Egr2表达检测方法(qRT-PCR),筛选标准(表达增强≥5倍)
阅读提示:Methods:Small-molecule compound screening
HDAC3抑制剂处理
RGFP966剂量(10 mg/kg),PDA106剂量(100 mg/kg),给药方式(皮下/腹腔注射),给药方案(新生小鼠每日;成年小鼠第一周每日,之后每2天一次)
阅读提示:Methods:In vivo administration of HDAC3 inhibitors
SC-DRG共培养
DRG来源(E16.5大鼠),SC接种密度(100,000个),髓鞘化诱导(50 μg/ml抗坏血酸),培养时间(10天),MBP+节段计数方法
阅读提示:Methods:SC-DRG co-culture
Hdac3/Tead4基因敲除小鼠
工具鼠品系(Cnp-Cre、Dhh-Cre、Plp1-CreERT),他莫昔芬给药方案(剂量、时间点),敲除效率验证方法(Western blot、qRT-PCR)
阅读提示:Methods:Mice, Tamoxifen induction of floxed allele deletion
坐骨神经损伤模型
小鼠周龄(8周或10-12月龄),麻醉方案(氯胺酮/甲苯噻嗪),损伤方式(横断),HDAC3抑制剂给药时间(损伤后第一周每日,第二周每2天)
阅读提示:Methods:Sciatic nerve transection injury
功能恢复评估
pinprick测试(分区和评分标准),toe-spreading评分标准,rotarod设置(转速和加速度),实验者盲法操作
阅读提示:Methods:Assessment of sensory and motor recovery
电生理记录
麻醉方案(戊巴比妥钠50 mg/kg),刺激参数(2 mA,0.1 ms,0.25-0.5 Hz),记录部位(腓肠肌外侧),分析软件(Spike2)
阅读提示:Methods:Compound muscle action potential recording
RT-qPCR
RNA提取方法(TRIzol),cDNA合成(iScript),PCR体系(SYBR green),内参基因
阅读提示:Methods:RNA isolation and real-time qPCR
ChIP-seq
细胞数量(约2000万),交联条件(1%甲醛,10分钟),染色质剪切条件,抗体(HDAC3, p300, H3K27ac, H3K4me1),文库构建(NEBNext试剂盒),测序平台(HiSeq 2000),峰值鉴定参数(MACS,P≤1e-9,富集≥6倍)
阅读提示:Methods:ChIP-seq assays, ChIP-seq peak-calling and data analysis