建立直接共培养体系并分离细胞
模拟肿瘤微环境中癌细胞与CAF前体细胞的直接接触,并分离出高纯度的癌细胞和CAF样细胞。
将ESCC细胞系(TE-9、TE-10、TE-15)与骨髓来源MSC直接共培养4天,通过EpCAM磁珠分离获得TE-co和CAF样细胞。
Bone Marrow Stromal Cell Antigen 2 Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression by Mediating the Cell-Cell Interaction between Cancer Cells and Cancer-Associated Fibroblasts
包含体外共培养模型、细胞功能验证(增殖、迁移、粘附)、信号通路(ERK)机制验证以及临床样本免疫组化预后分析等多个独立证据层级。
ESCC细胞系(TE-9、TE-10、TE-15)与骨髓间充质干细胞直接共培养体系 人骨髓来源间充质干细胞(MSC) ESCC患者肿瘤组织样本(66例) ESCC单细胞RNA测序公共数据集(GSE160269)
直接共培养时间:4天 BST2敲低:siRNA(10 nmol/L,48小时转染) BST2过表达:pRP[Exp]-EGFP/Neo-CMV>hBST2载体 细胞活力检测:MTS法(CellTiter 96 Aqueous One Solution) 迁移实验:Transwell小室(8.0 μm孔径),48小时 粘附实验:纤连蛋白包被培养板,3小时 临床样本:66例ESCC组织,免疫组化评分(0-3分)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟肿瘤微环境中癌细胞与CAF前体细胞的直接接触,并分离出高纯度的癌细胞和CAF样细胞。
将ESCC细胞系(TE-9、TE-10、TE-15)与骨髓来源MSC直接共培养4天,通过EpCAM磁珠分离获得TE-co和CAF样细胞。
识别在ESCC细胞和CAF中均上调的基因,重点关注介导细胞间相互作用的分子。
重新分析cDNA微阵列数据,通过Venn图筛选在TE-9 co和CAF9中均高表达的基因,确定BST2为研究对象。
确认BST2在共培养的ESCC细胞和CAF样细胞中mRNA和蛋白水平均显著上调。
通过qRT-PCR和Western blot检测不同细胞系中BST2的表达,并使用非还原条件检测二聚体形式。
评估敲低或过表达BST2对ESCC细胞存活、生长、迁移和粘附的影响,并初步探索信号通路。
在ESCC细胞中转染siBST2或oeBST2,进行MTS、Transwell迁移和粘附实验,并通过Western blot检测pERK水平。
在生理相关的直接共培养条件下,验证BST2对癌细胞和CAF样细胞恶性表型的促进作用。
在共培养期间转染siBST2,分离细胞后检测存活、生长、迁移和粘附能力,并分析pERK变化。
评估BST2是否促进MSC获得CAF样恶性表型。
在MSC中敲低或过表达BST2,检测其存活、生长、迁移和粘附能力,并检测pERK水平。
验证BST2是否直接参与癌细胞与基质细胞之间的细胞间粘附。
敲低或过表达BST2后,将ESCC细胞与MSC或CAF直接共培养,通过免疫荧光检测粘附的癌细胞数量。
评估BST2在ESCC组织中的表达水平与临床病理因素及患者预后的关系。
对66例ESCC组织进行免疫组化染色,评分并分组,进行Kaplan-Meier生存分析和临床病理相关分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corp. | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 青霉素-链霉素-两性霉素B悬液 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corp. | -- | |
| 低糖DMEM培养基 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corp. | -- | |
| 高糖DMEM培养基 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corp. | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX | Invitrogen | -- |
| TransIT-LT1转染试剂 | Mirus Bio LLC | -- | |
| Lipofectamine Stem转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞分离 | 抗CD326(EpCAM)微珠 | Miltenyi Biotec | 130-061-101 |
| autoMACS Pro分离器 | Miltenyi Biotec | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| RNA定量 | NanoDrop Lite分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 定量PCR | StepOne实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 蛋白质提取 | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blot | SDS上样缓冲液 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corp. | -- |
| 5%-20%梯度凝胶 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corp. | -- | |
| iBlot2系统 | Invitrogen | -- | |
| ImmunoStar试剂 | Fujifilm Wako Pure Chemical Corp. | -- | |
| ImageQuant LAS4000 mini成像仪 | Fujifilm | -- | |
| 兔抗BST2抗体 | Proteintech | 13560-1-AP | |
| 兔抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 兔抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 兔抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 12640 | |
| 兔抗磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9131 | |
| 兔抗NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 兔抗磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 兔抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9262 | |
| 兔抗磷酸化AKT(Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 兔抗磷酸化AKT(Thr308)抗体 | Cell Signaling Technology | 2965 | |
| 兔抗p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 9212 | |
| 兔抗磷酸化p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 9211 | |
| 兔抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| 辣根过氧化物酶偶联的驴抗兔IgG | Cytiva | NA934V | |
| 辣根过氧化物酶偶联的抗小鼠IgG | Cytiva | NA931V | |
| 细胞功能实验 | CellTiter 96 Aqueous One Solution试剂 | Promega | -- |
| Infinite 200 PRO酶标仪 | Tecan | -- | |
| 迁移实验 | 细胞培养小室(孔径8.0 μm) | BD Falcon | -- |
| Diff-Quik染色液 | Sysmex | -- | |
| 粘附实验 | 人纤连蛋白 | Sigma-Aldrich | -- |
| 免疫荧光 | 兔抗BST2抗体 | Proteintech | 13560-1-AP |
| 兔抗EpCAM抗体 | Cell Signaling Technology | 2929 | |
| 羊抗FAP抗体 | R&D Systems | AF3715 | |
| DAPI | Fujifilm Wako Pure Chemical Corp. | 340-07971 | |
| Alexa Fluor-647偶联的抗兔IgG | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 711-605-152 | |
| Cy3偶联的抗小鼠IgG | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 715-165-150 | |
| Alexa Fluor-488偶联的抗羊IgG | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 713-545-003 | |
| 共聚焦激光扫描显微镜LSM700 | Carl Zeiss | -- | |
| 免疫组化 | Leica BOND-MAX自动染色系统 | Leica Biosystems | -- |
| BOND Polymer Refine检测试剂盒 | Leica Biosystems | -- | |
| 兔抗BST2抗体 | Proteintech | 13560-1-AP | |
| 数据分析 | IBM SPSS Statistics软件版本22 | IBM Corp. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 直接共培养 | MSC接种密度,ESCC细胞接种密度,共培养时间,培养基成分(高糖DMEM+10%FBS+1%抗生素) 阅读提示:Materials and Methods: Direct Co-Culture System |
| BST2敲低 | siRNA浓度(10 nmol/L),转染时间(48小时),转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX) 阅读提示:Materials and Methods: Knockdown and Overexpression of BST2 |
| BST2过表达 | 质粒构建(pRP[Exp]-EGFP/Neo-CMV>hBST2),转染试剂(TransIT-LT1或Lipofectamine Stem) 阅读提示:Materials and Methods: Knockdown and Overexpression of BST2 |
| 细胞功能实验 | 细胞接种密度(存活、生长、迁移、粘附实验),处理时间(48小时等),检测试剂(MTS) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Survival and Growth Assay, Transwell Migration Assay, Cell Adhesion Assay |
| 临床样本分析 | 样本量(66例),染色评分标准(0-3分),生存分析类型(OS, CSS, DFS) 阅读提示:Materials and Methods: Tissue Samples, Immunohistochemistry; Results: 图10 |