检测AD中APP乳酸化水平
确定APP乳酸化在AD病理状态下是否发生改变
通过免疫沉淀(IP)和免疫印迹检测AD患者及APP23/PS45小鼠海马和皮层组织中APP-Kla水平,并在APPKO细胞中表达APPWT和APPswe695比较乳酸化水平。
APP lysine 612 lactylation ameliorates amyloid pathology and memory decline in Alzheimer's disease
包含患者样本和AD模型小鼠的病理分析、体外细胞功能实验、AAV介导的体内干预、行为学、电生理、RNA-seq及机制验证等多种独立证据层级。
AD患者海马和额叶皮层组织 APP23/PS45双转基因AD小鼠 HEK293细胞及APP敲除(APPKO)细胞
APP-K612la位点突变(APPK612T/APPK612Q)对Aβ生成和认知的影响 L-乳酸(1 g/kg/day)及O-4CIN(草酸钠1 g/kg/day+4CIN 150 mg/kg/day)处理AD模型小鼠的效应 AAV(AAV2/8)双侧海马CA1区注射的病毒滴度(3×10^12 TU/ml)和注射体积(1 μL) APP与BACE1、CD2AP的相互作用(Co-IP) APP在质膜、内体、溶酶体的分布及内吞、降解动力学
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定APP乳酸化在AD病理状态下是否发生改变
通过免疫沉淀(IP)和免疫印迹检测AD患者及APP23/PS45小鼠海马和皮层组织中APP-Kla水平,并在APPKO细胞中表达APPWT和APPswe695比较乳酸化水平。
确定APP乳酸化的具体赖氨酸位点并评估其对APP加工的影响
使用LC-MS/MS鉴定APP乳酸化位点,构建K354、K363、K612位点的乳酸化模拟(T)和去乳酸化模拟(Q)突变体,在APPKO细胞中检测APP、CTF-β、sAPP-β等蛋白水平。
评估APPK612T在体内对Aβ沉积和认知功能的影响
通过AAV载体将APPswe695、APPK612Q或APPK612T注射至3月龄PS45小鼠双侧海马CA1区,2个月后进行Aβ斑块染色、Aβ40/42 ELISA及行为学测试(Barnes maze、Morris water maze)。
研究APP-K612la对海马转录组的影响
对AAV-APPswe695和AAV-APPK612T处理的小鼠海马组织进行RNA-seq分析,鉴定差异表达基因并进行GO富集分析。
阐明APP-K612la对APP从质膜到内体/溶酶体运输的影响
通过细胞表面生物素化实验检测APP内吞速率,分离质膜、内体和溶酶体组分检测APP分布,并使用免疫荧光共定位(EEA1、RAB7、LAMP1)验证。
揭示APP-K612la影响APP加工和降解的机制
检测溶酶体抑制剂作用下APP水平,通过Co-IP考察APP与BACE1、CD2AP的相互作用,并检测内体中CD2AP水平及APP与CD2AP共定位。
评估L-乳酸对APP乳酸化及AD病理和认知的影响
对2月龄APP23/PS45小鼠腹腔注射L-乳酸或草酸钠+4CIN(O-4CIN)90天,随后检测APP-Kla水平、Aβ斑块、Aβ40/42、LTP和认知行为。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L300008 |
| 药物处理 | L-乳酸钠 | Sigma-Aldrich | L7022 |
| 草氨酸钠 | Yuan Ye | S30701 | |
| 4-氰基肉桂酸 | Sigma-Aldrich | C2020 | |
| 氯喹 | -- | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | 23227 | |
| ELISA | Aβ40 ELISA试剂盒 | R&D | DAB140B |
| Aβ42 ELISA试剂盒 | R&D | DAB142 | |
| 免疫荧光 | DAPI染液 | -- | -- |
| 抗荧光淬灭剂 | Solarbio | S2100 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | P2545 |
| 细胞表面生物素化 | 磺基-NHS-LC-生物素 | Pierce | PG82075 |
| 中和亲和素琼脂糖 | Pierce | 29200 | |
| 细胞组分分离 | Minute质膜蛋白分离和细胞分级试剂盒 | Invent | SM-005 |
| Minute内体蛋白分离试剂盒 | Invent | ED-028 | |
| Minute溶酶体分离试剂盒 | Invent | LY-034 | |
| 蛋白溶解 | Minute变性蛋白溶解试剂 | Invent | WA-009 |
| Minute非变性蛋白溶解试剂 | Invent | WA-010 | |
| 免疫组织化学 | 4G8抗体 | -- | -- |
| 电生理 | 振动切片机(VT1200S) | Leica Microsystems | -- |
| PatchMaster v2.73软件 | HEKA Electronic | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本 | AD患者和对照组的海马和额叶皮层组织样本,每组6例,性别比例、年龄匹配。 阅读提示:Methods - Human samples |
| 动物模型 | APP23/PS45双转基因AD小鼠,6月龄,性别半对半,WT同笼对照。 阅读提示:Methods - Animals |
| 药物处理 | L-乳酸钠(1 g/kg/day)或O-4CIN(草酸钠1 g/kg/day + 4CIN 150 mg/kg/day)腹腔注射90天。 阅读提示:Methods - Animals |
| AAV注射 | AAV2/8血清型,双侧海马CA1区注射,坐标:前囟后2.5 mm,旁开2.0 mm,深2.5 mm;注射体积1 μL,滴度3×10^12 TU/ml。 阅读提示:Methods - Animals |
| 细胞实验 | HEK293细胞,APPKO株,转染APPswe695或突变质粒,使用Lipofectamine 3000。 阅读提示:Methods - Cell culture and transfection |
| 生化检测 | 检测APP、CTF-β、sAPP-β、Aβ40、Aβ42等蛋白水平,使用指定的抗体和ELISA试剂盒,每组重复数(n=3-6) 阅读提示:Methods - Western blotting, Aβ ELISA |
| 行为学 | Barnes maze和Morris water maze测试的范式、训练天数、潜伏期记录。 阅读提示:Methods - Barnes maze test, Morris water maze test |
| 电生理 | 海马CA1 LTP记录,刺激强度为最大反应的50%,基线稳定30 min后给予TBS。 阅读提示:Methods - Electrophysiology in vitro |
| 统计 | ANOVA或双侧Student t检验,P<0.05为显著。 阅读提示:Methods - Statistics |