PLCβ4表达分析
检测PLCβ4在T细胞亚群及胸腺细胞中的表达,以评估其潜在功能。
从脾脏和胸腺分离T细胞亚群,通过qRT-PCR和Western blot检测PLCβ4 mRNA和蛋白水平。
Uncovering a novel role of PLCβ4 in selectively mediating TCR signaling in CD8+ but not CD4+ T cells
研究包含体外细胞实验(PLCβ4缺陷T细胞、过表达、突变体)、体内动物模型(T. gondii感染、黑色素瘤转移)及机制验证(免疫共沉淀、磷酸化位点突变),层级丰富且功能验证齐全。
小鼠脾脏CD8+ T细胞 小鼠脾脏CD4+ T细胞 PLCβ4基因敲除小鼠 B16F10黑色素瘤肺转移模型 弓形虫感染模型
PLCβ4缺陷小鼠的基因敲除验证(基因陷阱策略) PLCβ4催化活性(H328A/H377A突变体)对CD8+ T细胞活化的必要性 PLCβ4与CD8α胞质尾(aa 227-237)相互作用的验证 GNAQ通过PLCβ4 T886/S890磷酸化调控CD8+ T细胞活化的机制 体内模型:T. gondii感染和B16F10黑色素瘤转移模型中CD8+ T细胞依赖性保护
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测PLCβ4在T细胞亚群及胸腺细胞中的表达,以评估其潜在功能。
从脾脏和胸腺分离T细胞亚群,通过qRT-PCR和Western blot检测PLCβ4 mRNA和蛋白水平。
确定PLCβ4是否选择性地影响CD8+而非CD4+T细胞的活化。
纯化CD4+和CD8+T细胞,用不同浓度的抗CD3和抗CD28刺激,检测细胞因子产生、增殖和激活标志物。
确定PLCβ4缺失对TCR信号下游IP3、钙流和MAPK/NF-κB通路的影响。
刺激PLCβ4缺陷CD8+T细胞后,通过Western blot检测信号蛋白磷酸化,通过ELISA检测IP1和PIP2,通过流式检测钙流。
确认PLCβ4与CD8α的特异性结合,并鉴定关键区域,以解释其CD8特异性。
在293T细胞中共表达标记的PLCβ4和CD8α突变体,进行免疫共沉淀和Western blot;并在PLCβ4缺陷CD8+T细胞中回补表达突变体。
确定GNAQ是否作为PLCβ4的上游激活因子,并证明其重要性。
过表达GNAQ、GNA11、Q209L突变体,检测IFN-γ产生和相互作用;生成GNAQ缺陷小鼠并检测CD8+T细胞功能。
识别GNAQ介导的PLCβ4磷酸化位点,并验证其对CD8+T细胞活化的必要性。
在293T细胞中过表达GNAQ Q209L和PLCβ4突变体,通过质谱和靶向MRM检测磷酸化,然后在PLCβ4缺陷CD8+T细胞中回补突变体。
验证PLCβ4在抗原肽刺激的CD8+T细胞活化和适应性免疫中的作用。
使用OT-I TCR转基因小鼠,体外共培养肽脉冲的树突状细胞,体内过继转移和OVA肽免疫。
评估PLCβ4在抗寄生虫和抗肿瘤适应性免疫中的生理意义。
用弓形虫感染WT和PLCβ4缺陷小鼠,监测存活和寄生虫负荷;用B16F10黑色素瘤细胞静脉注射,监测存活和肺转移。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Nacalai Tesque | -- |
| DMEM培养基 | Nacalai Tesque | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| Western blot | 抗PLCβ4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-166131 |
| 抗HA抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7392 | |
| 抗GNAQ抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-136181 | |
| 抗ZAP70抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32760 | |
| 抗PLCγ1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7290 | |
| 抗磷酸化ZAP70抗体 | Cell Signaling Technology | #2717 | |
| 抗磷酸化SLP76抗体 | Cell Signaling Technology | #14745 | |
| 抗PKCθ抗体 | Cell Signaling Technology | #9377 | |
| 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | #4370 | |
| 抗磷酸化p38抗体 | Cell Signaling Technology | #4511 | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | #4668 | |
| 抗磷酸化IκB-α抗体 | Cell Signaling Technology | #9246 | |
| 抗NFAT1抗体 | Cell Signaling Technology | #5861 | |
| 抗磷酸化PLCγ1抗体 | Cell Signaling Technology | #14008 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 抗β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | A1978 | |
| 免疫沉淀 | 抗HA琼脂糖 | Sigma-Aldrich | A2095 |
| T细胞刺激 | 抗CD3ε抗体(145-2C11) | BioLegend | 100302 |
| 抗CD28抗体(37.51) | BioLegend | 102112 | |
| 流式细胞术 | 抗CD4抗体 | eBioscience | 12-0041-81 |
| 抗CD8α抗体 | eBioscience | 25-0081-81 | |
| 抗CD69抗体 | eBioscience | 17-0691-80 | |
| 抗TNF-α抗体 | eBioscience | 12-7321-81 | |
| 抗CD45抗体 | BioLegend | 103126 | |
| 抗CD25抗体 | BioLegend | 102022 | |
| 抗IFN-γ抗体 | BioLegend | 505816 | |
| 抗CD44抗体 | BD PharMingen | 561862 | |
| 抗IFN-γ抗体 | BD PharMingen | 557735 | |
| 抗CD62L抗体 | BD PharMingen | 560513 | |
| 细胞因子处理 | 重组小鼠IFN-γ | Peprotech | -- |
| 重组小鼠IL-2 | Peprotech | -- | |
| 重组小鼠IL-12 | Peprotech | -- | |
| 细胞处理 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 钙离子载体(A23187) | Sigma-Aldrich | -- | |
| Western blot | 抗磷酸化Lck (Tyr394)抗体 | BioLegend | 933102 |
| 抗总Lck抗体 | Abcam | ab3885 | |
| 免疫沉淀 | 抗CD8α大鼠抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-18913 |
| Western blot | 抗CD8α兔抗体 | Abcam | ab217344 |
| 抗GNAQ/11抗体 | Proteintech | 13927-1-AP | |
| 细胞增殖检测 | 羧基荧光素琥珀酰亚胺酯 | Invitrogen | -- |
| 细胞培养 | OVA肽(TS5001-P) | MBL | TS5001-P |
| 动物实验 | 环状鸟苷酸-腺苷酸 | InvivoGen | -- |
| 流式细胞术 | OVA四聚体-SIINFEKL | MBL | TS-5001-1C |
| OVA四聚体-ISQAVHAAHAEINEAGR | MBL | TS-M710-1 | |
| 裂解缓冲液 | 1倍被动裂解缓冲液 | Promega | -- |
| 报告基因检测 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| 发光检测 | GLOMAX20/20发光检测仪 | Promega | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞内细胞因子染色 | Cytofix/Cytoperm试剂盒Plus(含Golgistop) | BD Biosciences | -- |
| Western blot | 蛋白G-琼脂糖 | GE Healthcare | -- |
| 重组蛋白生产 | 镍-琼脂糖6快速流动 | GE Healthcare | -- |
| 质谱分析 | 胰蛋白酶/Lys-C混合物 | Promega | -- |
| GL-Tip SDB | GL Sciences | -- | |
| EASY-nLC 1200超高效液相色谱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Orbitrap Fusion质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| C18反相色谱柱 | Nikkyo Technos | -- | |
| 数据分析 | Proteome Discoverer 2.4版本 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Skyline软件 | MacCoss Lab | -- | |
| ELISA | 小鼠PIP2 ELISA试剂盒 | MyBiosource | -- |
| IP1检测 | IP1 ELISA试剂盒 | Cisbio-US | -- |
| RT-qPCR | Verso逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| CFX connect实时PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| Go-Taq实时PCR系统 | Promega | -- | |
| 体内成像 | D-荧光素 | Promega | -- |
| IVIS-Spectrum成像系统 | Xenogen | -- | |
| 钙流分析 | Fluo-8钙离子荧光探针 | Abcam | -- |
| 流式分选 | FACSAria III流式细胞分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 流式分析 | FACSVerse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 统计分析 | Prism 7统计软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| T细胞刺激实验 | α-CD3浓度(0-10 µg/ml),α-CD28浓度(2 µg/ml),刺激时间(72小时、24小时、6小时) 阅读提示:材料与方法“T cell proliferation assays”及图2图注 |
| 信号通路分析 | α-CD3(5 µg/ml)和α-CD28(2 µg/ml)刺激时间(0-30分钟) 阅读提示:材料与方法“Western blot analysis and immunoprecipitation”及图3图注 |
| PLCβ4-CD8α相互作用 | CD8α缺失突变体(Δ15, Δ20, Δ25)、PLCβ4缺失突变体(Δ900-960)和定点突变体(H328A/H377A) 阅读提示:材料与方法“Mammalian expression plasmids”及图4图注 |
| GNAQ功能实验 | GNAQ和GNA11过表达,Q209L突变体,GNAQ缺陷小鼠 阅读提示:材料与方法“Mammalian expression plasmids”和“Generation of GNAQ-deficient mice”及图5图注 |
| 体内感染与肿瘤模型 | 弓形虫株(Pru,1×10^5)、B16F10细胞数(2×10^5)、感染/注射途径、监测时间点 阅读提示:材料与方法“In vivo imaging analysis”和“Melanoma mouse models”及图8、图9图注 |