JMMSCs分离与培养
获取用于实验的JMMSCs并维持其干性。
从2周龄雄性C57BL/6J小鼠下颌骨分离骨髓,通过酶消化和贴壁培养获得JMMSCs。
4632427E13Rik Facilitates Jaw Marrow-Derived Mesenchymal Stem Cells Osteogenesis and Angiogenesis Under Hypoxia Through miR-34a-5p/Aldoa/Hif-1α Pathway
包含体外细胞实验(低氧模型、成骨/血管生成检测)、体内小鼠颅骨缺损模型(Micro-CT、组织学)、组学分析(lncRNA微阵列)及机制验证(双荧光素酶、siRNA敲低),功能与机制验证完整。
JMMSCs(小鼠颌骨髓间充质干细胞) bEnd.3细胞(小鼠脑微血管内皮细胞) 小鼠颅骨缺损模型(C57BL/6J小鼠) 293T细胞(用于双荧光素酶报告实验)
CoCl₂浓度:50 μM用于低氧模拟 低氧预处理时间:3天(成骨和血管生成效果最佳) siRNA敲低效率:si-lnc-4632427E13Rik和si-Aldoa的转染效率需验证 体内实验样本量:每组12只小鼠,颅骨缺损直径3 mm 统计分析:1-way ANOVA与Tukey检验,P < .05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取用于实验的JMMSCs并维持其干性。
从2周龄雄性C57BL/6J小鼠下颌骨分离骨髓,通过酶消化和贴壁培养获得JMMSCs。
模拟低氧环境并确定最佳处理条件。
使用CoCl₂(一种化学性低氧模拟剂)处理JMMSCs,通过细胞活力、迁移、Hif-1α表达等评估低氧效果,并筛选最佳浓度。
评估低氧预处理对JMMSCs成骨分化的作用。
将JMMSCs在低氧条件下预处理不同时间(0、1、3、5、7天),然后进行成骨诱导,检测成骨标志物表达和矿化。
评估低氧预处理的JMMSCs分泌因子对内皮细胞血管生成的影响。
收集低氧预处理后的JMMSCs条件培养基(CM),用于培养bEnd.3细胞,评估管形成能力和血管生成相关基因表达。
验证低氧预处理的JMMSCs在体内促进骨再生的能力。
建立小鼠颅骨缺损模型,植入低氧预处理或常氧预处理的JMMSCs(Matrigel支架),通过micro-CT和组织学评估骨再生。
鉴定低氧条件下差异表达的lncRNA并验证其功能。
通过微阵列分析比较常氧和低氧JMMSCs的lncRNA表达谱,筛选出lnc-4632427E13Rik。通过siRNA敲低实验验证其对JMMSCs成骨和血管生成的影响。
证实lnc-4632427E13Rik作为ceRNA海绵吸附miR-34a-5p。
利用双荧光素酶报告实验验证lnc-4632427E13Rik与miR-34a-5p的结合,并检测miR-34a-5p对Aldoa 3'UTR的作用。
明确Aldoa是否通过ERK/Hif-1α通路介导低氧的效应。
敲低Aldoa后,检测成骨和血管生成指标,以及MAPK通路相关蛋白表达。通过KEGG富集分析预测通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 胶原酶II | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 成骨诱导 | 抗坏血酸 | Sigma | -- |
| 地塞米松 | Sigma | -- | |
| β-甘油磷酸 | Sigma | -- | |
| 细胞活力测定 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | -- |
| 微阵列分析 | Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green预混液 | Toyobo | -- |
| 逆转录试剂盒 | Toyobo | -- | |
| RT-qPCR (miRNA) | miRNA cDNA合成试剂盒 | Sangon Biotech | B532451 |
| miRNA qPCR试剂盒 | Sangon Biotech | B532461 | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Solarbio | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | -- |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | -- | -- | |
| 抗Aldoa抗体 | Proteintech | 11217-1-AP | |
| 抗Hif-1α抗体 | Abcam | ab179483 | |
| 抗Runx2抗体 | Cell Signaling Technology | 8486S | |
| 抗CD31抗体 | Cell Signaling Technology | 77699S | |
| 抗Ocn抗体 | Bioss | bs-4917R | |
| 抗Alp抗体 | Bioss | bs-1535R | |
| 抗Vegf抗体 | Bioss | bs-1313R | |
| 抗ERK抗体 | Bioss | bsm-33337M | |
| 抗p-ERK抗体 | Bioss | bs-1646R | |
| 抗p38抗体 | Bioss | bs-0637R | |
| 抗p-p38抗体 | Bioss | bs-0636R | |
| 抗JNK抗体 | Bioss | bs-2592R | |
| 抗p-JNK抗体 | Bioss | bs-1640R | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | AF7018 | |
| 血管生成实验 | Matrigel基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 组织学 | EDTA | -- | -- |
| 苏木素 | Abcam | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| 荧光二抗 | -- | -- | |
| 显微成像 | 酶标仪 | Thermo Multiskan FC | -- |
| 定量PCR | NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Scientific | -- |
| 免疫荧光 | 激光扫描共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 动物实验 | Micro-CT成像系统 | PerkinElmer | -- |
| Western blot成像 | Tanon成像系统 | Tanon | -- |
| siRNA转染 | 小干扰RNA | Hanbio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | JMMSCs和BMMSCs分离的具体操作(骨髓冲洗、酶消化时间、培养条件) 阅读提示:Methods: Isolation and culture of JMMSCs and BMMSCs |
| 低氧处理 | CoCl₂浓度(50 μM)和低氧预处理时间(3天为最佳) 阅读提示:Results: Hypoxia pretreatment enhanced the osteogenic abilities of JMMSCs in vitro, Figure 2 |
| 成骨诱导 | 成骨诱导培养基成分(抗坏血酸50 μg/mL、地塞米松1 mM、β-甘油磷酸10 mM)和诱导时间(7天或14天) 阅读提示:Methods: Osteogenic commitment of chemically induced JMMSCs |
| 血管生成实验 | bEnd.3细胞接种密度(1×10^5/孔)、Matrigel包被条件、CM处理时间(6小时) 阅读提示:Methods: Tube formation assay |
| 体内动物实验 | 小鼠品系(C57BL/6J)、年龄(8周)、样本量(n=12/组)、颅骨缺损大小(3 mm)、植入细胞数(4×10^5)、Matrigel体积(20 μL)、观察时间(4和8周) 阅读提示:Methods: Animal surgical procedure |