外泌体的分离与表征
分离并表征沙漠奶和非沙漠奶外泌体,比较其形态、大小、标志物表达、蛋白浓度和稳定性。
通过差速离心和超速离心从牛奶中提取外泌体,使用TEM观察形态,NTA分析粒径,WB检测标志蛋白(Syntenin-1、CD63、HSP70、Calnexin),BCA法测定蛋白浓度,FC计数颗粒。
Neuroprotective Effects of Desert Milk Exosomes in LPS-Induced Cognitive Decline: Role of Microglial M2 Polarization and AMPK Signaling
综合体外细胞实验、蛋白质组学分析、动物模型及行为学测试等多层级证据,并进行功能验证和机制探索。
BV2小胶质细胞系 LPS诱导的Balb/c小鼠神经炎症模型 沙漠奶外泌体(D-Exo) 非沙漠奶外泌体(ND-Exo)
D-Exo和ND-Exo的分离与表征(TEM、NTA、WB标志物、BCA蛋白浓度) BV2细胞LPS刺激浓度(100 ng/mL用于M1极化诱导,1 μg/mL用于细胞损伤实验) D-Exo和ND-Exo的预处理浓度(200、400 ng/mL) 小鼠模型分组与给药(Control、LPS、D-Exo 7 mg/kg/天口服灌胃28天,LPS 1 mg/kg注射) 行为学测试参数(MWM隐藏平台直径、游泳时间等)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分离并表征沙漠奶和非沙漠奶外泌体,比较其形态、大小、标志物表达、蛋白浓度和稳定性。
通过差速离心和超速离心从牛奶中提取外泌体,使用TEM观察形态,NTA分析粒径,WB检测标志蛋白(Syntenin-1、CD63、HSP70、Calnexin),BCA法测定蛋白浓度,FC计数颗粒。
评估外泌体在模拟胃液中的稳定性。
将外泌体在PBS或模拟胃液中37°C孵育4小时,测定粒径和蛋白浓度,并通过TEM观察形态。
比较D-Exo和ND-Exo的蛋白质表达谱,鉴定差异表达蛋白质和富集通路。
采用LC-MS/MS进行蛋白质组学分析,使用MaxQuant进行数据库搜索,Perseus进行统计分析,通过PCA、层次聚类、KEGG通路和PPI网络分析差异蛋白质。
评估D-Exo对LPS诱导的BV2小胶质细胞损伤的保护作用及其对细胞极化的影响。
将BV2细胞分为对照组、LPS组、D-Exo(200、400 ng/mL)+LPS组和ND-Exo(200、400 ng/mL)+LPS组。CCK-8检测细胞活力,DCFH-DA检测ROS,ELISA检测细胞上清液中TNF-α、IL-33、IL-1β和IL-10,qRT-PCR检测M1/M2标志物(CD86、CD206)和炎症因子基因表达。
评估D-Exo预防性给药对LPS诱导的海马神经炎症和认知衰退的影响。
24只雄性Balb/c小鼠随机分为对照组、LPS组和D-Exo组(7 mg/kg/天),D-Exo组口服灌胃D-Exo 28天,对照组和LPS组给予0.9% NaCl。第29天,D-Exo和LPS组腹腔注射LPS(1 mg/kg)6小时。随后进行行为学测试(MWM、NOR)、组织病理学检查(HE、IHC、IF)、ELISA和WB分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 外泌体分离与表征 | 透射电子显微镜(JEM-1200EX) | JEOL Ltd. | -- |
| 纳米颗粒追踪分析(Nano ZS ZEN3600) | Malvern Panalytical | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 | |
| Syntenin-1抗体 | Proteintech | 22399-1-AP | |
| CD63抗体 | Proteintech | 28283-1-AP | |
| HSP70抗体 | Proteintech | 10995-1-AP | |
| 钙联蛋白抗体 | Proteintech | 10427-2-AP | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-IG | |
| 模拟胃液稳定性 | 模拟胃液 | Feijing | PH1840-500mL |
| 蛋白质组学分析 | Q Exactive HF质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| Empore SPE C18萃取柱 | Sigma | -- | |
| NanoDrop 2000分光光度计 | ThermoFisher | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11965092 |
| 胎牛血清 | SORFA | SX1101 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Beyotime Biotechnology | C0201 | |
| 细胞处理 | 脂多糖(L2880) | Sigma | L2880-100MG |
| 白细胞介素-4 | Invitrogen | PHC0044 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测试剂盒 | Meilunbio | MA0218 |
| 氧化应激检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime Biotechnology | S0033S |
| 蛋白免疫印迹 | 纤连蛋白1抗体 | Proteintech | 15613-1-AP |
| SIL1抗体 | Proteintech | 24110-1-AP | |
| AMPK抗体 | Proteintech | 10929-2-AP | |
| 磷酸化AMPK抗体 | Proteintech | 80209-6-RR | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 免疫组织化学 | Aβ1-42抗体 | Sigma-Aldrich | A9810 |
| Tau抗体 | Proteintech | 10274-1-AP | |
| MAP2抗体 | Proteintech | 17490-1-AP | |
| BDNF抗体 | Proteintech | 25699-1-AP | |
| HRP标记二抗 | abcam | ab205718 | |
| DAB显色剂 | Dako | k3468 | |
| 免疫荧光 | 离子钙结合适配器分子1抗体 | abcam | ab178846 |
| GFAP抗体 | PTG | 16825-1-AP | |
| Alexa Fluor 555标记二抗 | abcam | ab150078 | |
| DAPI染色液 | POWERFUL BIOLOGY | B0025 | |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | RUIXIN | EK282 |
| IL-33 ELISA试剂盒 | RUIXIN | RX203053M | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | RUIXIN | RX203063M | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | RUIXIN | RX203048M | |
| RNA提取与qRT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | DRR037A | |
| TB Green Premix Ex Taq | TaKaRa | RR420A |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 外泌体分离与表征 | 牛奶样品来源(沙漠奶:内蒙古巴彦淖尔市磴口县圣牧北斗牧场;非沙漠奶:宁夏银川牧场)、外泌体分离方法(超速离心)、表征参数(TEM、NTA、WB标志物、BCA蛋白浓度) 阅读提示:2.1节、图1 |
| 模拟胃液稳定性 | 外泌体在模拟胃液中的孵育时间、粒径和蛋白浓度变化 阅读提示:2.2节、图2 |
| 蛋白质组学分析 | LC-MS/MS参数、MaxQuant和Perseus参数、差异蛋白筛选阈值(|fold change| > 1, p < 0.05) 阅读提示:2.3节、图3、图4 |
| 细胞实验 | BV2细胞系来源、LPS浓度(100 ng/mL用于M1极化诱导,1 μg/mL用于细胞损伤实验)、外泌体浓度(200、400 ng/mL)、处理时间(LPS刺激6 h或24 h)、CCK-8和ROS检测方法 阅读提示:2.4节、2.5节、图5 |
| 动物实验 | 小鼠品系(Balb/c,雄性,6周龄,20-22g)、动物来源(北京华阜康生物)、分组方案(Control、LPS、D-Exo 7 mg/kg/天)、灌胃时间(28天)、LPS剂量(1 mg/kg,腹腔注射6 h) 阅读提示:2.6节、图7 |
| 行为学测试 | MWM参数(圆形水池直径120 cm、平台直径10 cm、游泳时间60 s)、NOR参数(熟悉阶段5分钟、间隔24小时、测试阶段5分钟) 阅读提示:2.8节、2.9节、图7 |
| 组织病理学与免疫组化 | 脑组织固定、脱水、包埋、切片厚度(3 μm)、HE染色、IHC抗体(Aβ1-42、Tau、MAP2、BDNF)及AOD量化方法 阅读提示:2.10节、图9、图10 |
| 免疫荧光 | IF抗体(Iba-1、GFAP)、二抗(Alexa Fluor 555)、DAPI染色、荧光显微镜 阅读提示:2.10节、图11 |
| ELISA | 血清采集方法(EDTA管、3000×g离心15 min 4°C)、ELISA试剂盒(TNF-α、IL-33、IL-1β、IL-10) 阅读提示:2.11节、图8 |
| qRT-PCR | RNA提取方法(Trizol)、cDNA合成(PrimeScript RT试剂盒)、PCR试剂(TB Green Premix Ex Taq)、内参(GAPDH)、基因特异性引物序列 阅读提示:2.12节、附录A表A1 |