ADEVs的分离与表征
验证成功分离和鉴定ADEVs,为后续实验提供材料。
从原代大鼠皮层星形胶质细胞培养上清中通过超速离心分离ADEVs,并用NTA、TEM和Western blot表征其大小、形态和标志物。
Astrocyte-Derived Extracellular Vesicles Alleviate Optic Nerve Injury Through Remodeling of Retinal Microenvironmental Homeostasis
包含体外细胞实验和体内动物模型(ONC大鼠)两个独立证据层级,并同时有功能验证(OCT、组织学、神经电生理)和机制验证(miRNA/mRNA测序、qPCR)。
原代大鼠星形胶质细胞 视神经挤压(ONC)大鼠模型 人皮肤成纤维细胞(对照)
ADEVs浓度(1×10^9颗粒/4μL)和注射方式(玻璃体内注射) ONC术后时间点(7、14天) 原发性星形胶质细胞分离自新生大鼠 RGC计数区域(中央、中央周围、周围) 统计方法(单因素方差分析和Tukey事后检验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证成功分离和鉴定ADEVs,为后续实验提供材料。
从原代大鼠皮层星形胶质细胞培养上清中通过超速离心分离ADEVs,并用NTA、TEM和Western blot表征其大小、形态和标志物。
建立视神经损伤模型,并评估ADEVs玻璃体内注射是否具有保护作用。
对8周龄雄性SD大鼠行视神经挤压手术,并在术后立即进行玻璃体内注射PBS或ADEVs。
检测ADEVs是否能减轻RGC死亡和视觉功能损伤。
通过OCT测量GCC厚度,H&E染色评估视网膜结构,免疫荧光染色计数RBPMS阳性RGC,f-VEP评估视觉功能。
研究ADEVs是否影响星形胶质细胞和小胶质细胞的活化状态。
通过免疫荧光染色检测GFAP和Iba1的表达,定量分析GFAP阳性面积和Iba1阳性细胞数量。
探索ADEVs神经保护作用的潜在分子机制。
对ADEVs进行miRNA测序,对ADEVs处理组和PBS组视网膜进行mRNA测序,并进行生物信息学分析及qPCR验证关键基因。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA (0.25%) | -- | -- | |
| 多聚赖氨酸 | -- | -- | |
| 动物星形胶质细胞培养基 | Sciencell | -- | |
| EV分离 | 去外泌体胎牛血清 | System Biosciences | -- |
| EV表征 | ZetaView纳米颗粒分析仪 | -- | -- |
| 透射电子显微镜(H-7650) | HITACHI | -- | |
| Western blot | TSG101抗体 | PTM BIO | PTM-5108 |
| Alix抗体 | PTM BIO | PTM-6407 | |
| CD81抗体 | PTM BIO | PTM-6220 | |
| Calnexin抗体 | Proteintech | 10427-2-AP | |
| 免疫荧光 | GFAP抗体 | Bioss | bs-0199R |
| Vimentin抗体 | Santa Cruz | sc-6260 | |
| RBPMS抗体 | Proteintech | 15187-1-AP | |
| Iba-1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 山羊抗小鼠Alexa Fluor 594 | Bioss | bs-0296G | |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 488 | Bioss | bs-0295G | |
| Western blot | HRP偶联的山羊抗小鼠IgG(H+L) | Beyotime | 10216 |
| 抗兔HRP偶联抗体 | Cell Signal Technology | 7074S | |
| 动物实验 | 异氟烷 | RWD Life Science | -- |
| 镊子(WA3010) | Jinzhong | WA3010 | |
| Hamilton注射器针头(33G) | Hamilton | -- | |
| OCT | 阿佛丁 | Sigma-Aldrich | T48402 |
| Phenix Micron IV显微镜 | Phenix | -- | |
| 海德堡SPECTRALIS OCT | Heidelberg | -- | |
| 免疫荧光 | 组织包埋剂 | Sakura | 4583 |
| 含DAPI的抗荧光淬灭封片剂 | Beyotime | -- | |
| 共聚焦显微镜(Zeiss Cell Observer SD) | Zeiss | -- | |
| f-VEP | 电生理诊断设备(GT-2008V-III) | GOTEC | -- |
| EV追踪 | PKH67细胞连接试剂盒 | Sigma | -- |
| miRNA测序 | QIAseq miRNA文库构建试剂盒 | QIAGEN | -- |
| mRNA测序 | miRNeasy Micro试剂盒 | QIAGEN | -- |
| NEBNext Poly(A) mRNA磁力分离模块 | NEB | E7490 | |
| NEBNext Ultra RNA文库构建试剂盒(Illumina) | NEB | E7530 | |
| NEBNext多重寡核苷酸(Illumina) | NEB | E750 | |
| qPCR | RNAiso Plus | Takara | 9108Q |
| SYBR Green实时PCR预混液 | Vazyme | Q712-032500 | |
| 引物 | Tsingke | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 大鼠品系、年龄、性别、体重;ONC手术具体方法(挤压部位、时间) 阅读提示:Methods - Animals |
| ADEVs制备 | 星形胶质细胞来源、分离方法、培养条件;ADEVs分离方法及表征参数 阅读提示:Methods - Isolation and Cultivation of Primary Rat Astrocytes, EV Isolation, Nanoparticle Tracking Analysis, Transmission Electron Microscopy, Western Blot Analysis |
| ADEVs治疗 | 玻璃体内注射剂量(1×10^9颗粒/4μL)、注射时间点、注射方法 阅读提示:Methods - Optic Nerve Crush and Intravitreal Injection of EVs |
| 视网膜结构评估 | OCT测量时间点、GCC厚度测量方法;H&E染色固定、切片、染色步骤 阅读提示:Methods - Optical Coherence Tomography and Measurement of Ganglion Cell Complex Thickness, Hematoxylin and Eosin Staining |
| RGC存活评估 | 免疫荧光染色的抗体信息、RGC计数区域和数量 阅读提示:Methods - Immunofluorescence Staining, Survival Count of RGCs |
| 视觉功能评估 | f-VEP记录参数(刺激频率、次数、振幅测量) 阅读提示:Methods - Flash Visual Evoked Potential Recording |
| 机制分析 | mRNA测序和miRNA测序的建库方法、测序平台、数据分析方法(阈值) 阅读提示:Methods - miRNA Sequencing, mRNA Sequencing, miRNA-mRNA Gene Prediction Network Analysis, Quantitative PCR Analysis |