不管黑猫白猫,抓到老鼠就是好猫,对纯化来讲亦如此,能拿到纯度好的蛋白,符合纯化要求就是硬道理。不同蛋白纯化工艺不同,即使相同的原料也有不同的纯化方案。蛋白质纯化方法的选择主要是利用不同蛋白质之间的相似性与差异,依据蛋白之间的相似性可以去除非蛋白物质,在根据蛋白的差异性将目的蛋白分离出来,所以要取得好的纯化结果所可以采用的策略及原则却是共通的。
1. 针对不同的产物表达形式采用不同的策略:
a) 融合型表达重组蛋白,一般胞内可溶性的,拟首选用亲和层析进行纯化;
b) 分泌型表达的重组蛋白,通常体积大、浓度低,因此应在纯化之前采用沉淀或超滤等方法先进行浓缩处理;
c) 包涵体型表达的重组蛋白,应先离心回收包涵体;
d) 表达在细胞膜和细胞壁之间的间隙中的蛋白质,应用低浓度的溶菌酶,然后再用渗透压休克法释放重组蛋白。
2. 针对不同性质的重组蛋白选择不同的层析类型:
a) 离子交换法(IEX):等电点处于极端区域(PI≤5 或 PI≥8)的重组蛋白应首选 IEX 进行分离,这样很容易除去几乎所有的杂蛋白。
b) 亲和层析(AC):重组蛋白特异性的配体、底物、抗体、糖链等都是首选亲和层析纯化的重要条件,原则是它们与目的蛋白之间的解离常熟应在合适的范围内(10-8—10-4mol/L)
c) 疏水(HIC)和反相层析:根据蛋白质的疏水性差异进行分离的。
d) 凝胶过滤层析(GF): 根据蛋白的分子量进行分离。
3. 每一种方法都有分辨率、处理量、速度和回收率之间的平衡:
a) 分辨率:由选择的方法和层析介质生成窄峰的能力来完成。当杂质和目的蛋白性质相似是,在纯化的最后阶段分辨率是选择层析方法的重要考量标准。
b) 处理量:指在纯化过程中目标蛋白的上样体积和浓度等。
c) 速度:在初纯化中是重要因素,此时杂质如蛋白酶必须尽快去除。
d) 回收率:随着纯化的进行渐趋重要,因为纯化产物的价值在增加。
4. 多种分离纯化技术联合运用:
a) 首选能除去含量最多杂质的方法;
b) 尽量选择高效的分离方法;
c) 将最费时、成本最高的分离纯化方法安排在最后阶段。
d) 通过组合各种方法使纯化步骤之间的样品处理减至最少,以避免需要调节样品。第一个步骤的产物的洗脱条件应适宜下一个步骤的起始条件。
e) 如果对目的蛋白的性质了解甚少的情况下,可采用 IEX-HIC-GF 的联合运用作为标准方案。
常用层析方法的分离特点:
层析方法 | 亲和层析 (AC) | 凝胶过滤层析 (GF) | 离子交换层析 (IEX) | 疏水层析 (HIC) |
分离机制 | 特异性亲和 | 大小 | 电荷 | 疏水性 |
选择性 | 非常高 | 中等 | 高 | 高→中等 |
载量 | 高 | 低 | 高 | 高 |
纯化速度 | 中等 | 中等→低 | 高 | 高 |
生物相容性 | 好 | 非常好 | 好 | 中等→好 |
目标蛋白的得率 | 高 | 高 | 高 | 中等→高 |
5. 重组蛋白分离纯化的共同参考阶段:
a) 捕获阶段:目的蛋白的澄清、浓缩和稳定。选择对目的蛋白具有最高选择性或/和处理量的方法。
b) 中度纯化阶段:目标是除去大多数大量杂质,如其它蛋白、核酸、内毒素和病毒等。
c) 精纯阶段:除去残余的痕量杂质和必须去除的杂质。
三阶段纯化策略中每一种方法的适用性:
层析方法 | 主要特点 | 捕获 | 中度纯化 | 精纯 | 样品起始状态 | 样品最终状态 |
IEX | 高分辨率 高容量 高速度 | ★★★ | ★★★ | ★★★ | 低离子强度 样品体积不限 | 高离子强度或pH改变。 样品浓缩 |
HIC | 分辨率好 容量好 高速度 | ★★ | ★★★ | ★ | 高离子强度 样品体积不限 | 低离子强度 样品浓缩 |
AC | 高分辨率 高容量 高速度 | ★★★ | ★★★ | ★★ | 结合条件特殊 样品体积不限 | 洗脱条件特殊 样品浓缩 |
GF | 高分辨率 (使用Supedex) | ★ | ★★★ | 样品体积(<总柱体积的5%)和流速范围有限制 | 缓冲液更换 样品稀释 | |
RPC | 高分辨率 | ★ | ★★★ | 需要有机溶剂 | 在有机溶剂中,有损失生物活性的风险 |
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