关于免疫共沉淀实验不得不说的那些事

   2017-08-28
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免疫共沉淀(Co-IP),其原理是当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来, 如果用蛋白质 X 的抗体 anti-X(通常称为 IP 抗体)将 X 特异地抓住并沉淀下来,那么与 X 在体内结合的蛋白质 Y 或者 Z 等也能共同被沉淀下来。目前多用 protein A 或 G 预先固化在琼脂糖或者磁珠 beads 上,蛋白 A 或蛋白 G 对抗体的 Fc 段有较高的亲和力,得到珠子—蛋白 A/G—抗体—目的蛋白复合物,最后通过洗脱或离心得到目的蛋白复合物。

免疫共沉淀实验的注意事项

1.  细胞裂解采用温和的裂解条件,不能破坏细胞内存在的所有蛋白质-蛋白质相互作用或抗原的结构,多采用非离子变性剂 (NP40 或 Triton X-100)。每种细胞的裂解条件是不一样的,通过经验确定。不能用高浓度的变性剂 (0.2%SDS),细胞裂解液中要加各种酶抑制剂,如商品化的 cooktail。

2.  使用对照抗体:
单克隆抗体: 正常小鼠的 IgG 或另一类单抗
兔多克隆抗体: 正常兔 IgG

3.  要确保抗体的特异性,即在不表达抗原的细胞溶解物中添加抗体后不会引起共沉淀。

4. 确定蛋白间的相互作用是发生在细胞中,而不是由于细胞的溶解才发生的,这需要进行蛋白质的定位来确定。

早期的产品 beads 是采用琼脂糖做成的微球,通过离心沉淀到管底,因颗粒小容易被搅动起来,因此在洗涤的步骤移液动作要非常小心,不能吸走了 beads 也不能残留太多的液体,否则靶蛋白有损失或者残留液体可能导致假阳性信号。逐渐新的材质磁性 beads 就诞生了,磁珠采用磁力架沉淀,沉淀清洗方便又快速,所以越来越多的实验室采用 Co-IP 磁珠。

4ABio Beads Protein A,一种具有超强吸附力、高效而有简便的 IgG 提纯方法。

优点:

(1)简化了小规模纯化的样品处理,无需离心。

(2)高纯度和高产量,相比离心法,磁体吸附法更能避免残留裂解液导致的假阳性,最大产量为 6 mg 人 IgG/ml 磁珠悬液。

(3)轻松地平行筛选抗体,具有高度重现性。

(4)应用于多种规模抗体纯化(低至微升,高至毫升规模)。

(5)操作快捷。

题图来源:shutterstock 正版图库

编辑: weicf    来源:丁香园

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