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讲师介绍
张岩
哈工大生命科学与技术学院教授，计算生物学研究中心主任。中国细胞生物学会功能基因组与系统生物学分会理事，中国抗癌协会肿瘤标志专委会肿瘤测序与大数据分析专家委员会主任委员，中国计算机学会生物信息学专委会委员。中国生物医学工程学会数字医疗与医疗信息化分会委员。硕士及博士就读于日本新泻大学，2006年留学回国一直从事生物信息学领域的教学及科研工作。研究方向涉及到临床医学数据、肿瘤生物学、发育生物学等领域的数据分析及技术平台开发。系列研究成果发表在Nucleic Acids Research、Molecular Oncology、Development、Epigenomics、Briefings in Bioinformatics、Database 等杂志上。
视频介绍
课程摘要：
超级增强子作为细胞识别基因的重要调控子，其调控机制的深入解析将有助于揭示干细胞多能性、定向分化和癌症重要的调控子。对于具体癌症类型中的超级增强子的识别和深入分析将为个体医疗提供重要的靶标。课题组开发了SEA v.3.0提供跨多个物种的所有可用SE信息的全面数据库，并将促进超级增强子的研究，特别是与发育和疾病相关的研究。数据库集超级增强子查询、下载、可视化、分析于一体的综合平台，提供标准查询、基因组浏览器、个性化分析工具和SEs数据下载；提供超级增强子区域的染色质相互作用、SNPs、转录因子结合位点和SpCas9靶位点的信息。嵌入基于香农熵的工具用于评估SEs细胞类型的特异性。利用该数据库的超级增强
通过本课程学习，我们将学到：
1、SEA3.0 中超级增强子的识别；
2、SEA3.0数据库的查询使用方法；
3、目前关于超级增强子的相关数据库；
4、案例介绍超级增强子在揭示癌症机制中的应用
