项目文章 | 西北农林科技大学李明军/马百全研究团队发现苹果酸度调控机制
2024-06-28 09:15点击次数:413
关键词:西北农林科技大学;酵母文库;苹果酸度调控
果实的酸度是影响果实风味和品质的关键因素之一。在苹果中,主要的有机酸是苹果酸,其含量对果实的口感和加工品质有显著影响。
近日,西北农林科技大学苹果抗逆与品质改良创新团队李明军教授/马百全副教授课题组在Plant Physiology上发表的题为“Transcriptional factor MdESE3 controls fruit acidity by activating genes regulating malic acid content in apple ”研究论文,验证了MdMa11在控制果实酸度方面的作用,并通过酵母单杂交筛选,找到了调控其表达的转录因子MdESE3,结合一系列分子及遗传转化实验,解析了MdESE3的关键结合motif及其提高苹果中有机酸积累和酸度的分子机制。
本项目中苹果酵母cDNA文库由欧易生物构建。

酵母文库:苹果酵母cDNA文库
诱饵启动子:MdMa11的启动子(分为3段)
筛选方法:酵母单杂交(Y1HGold-pAbAi系统)
验证方法:Y1H assay/LUC/GUS
技术路线

研究结果
1. MdMa11在转基因苹果愈伤、果实及植株中的功能分析
研究者前期已经利用烟草叶片的遗传转化系统,发现了MdMa11(编码质子泵蛋白,介导H+的跨膜转运,维持液泡酸度)可以显著调控植物pH。本研究进一步在苹果的不同材料中进行MdMa11的功能验证。结果发现过表达MdMa11的苹果果实、苹果愈伤、苹果植株中苹果酸含量均显著上升,而对应的沉默材料中苹果酸含量均显著下降(图1)。说明MdMa11参与了苹果中苹果酸的积累通路。

图1 MdMa11在转基因苹果愈伤组织、果实和植株中的功能分析
2. 与MdMa11启动子结合的关键TF的鉴定
研究者克隆了MdMa11的5417bp启动子,并将其分成了3段分别进行酵母单杂交筛选,结果共筛选到85个阳性克隆,其中使用含有ERE motif的启动子片段为诱饵筛选到的阳性克隆中有1个含有AP2结构域的蛋白。基于拟南芥基因组注释分析,将其鉴定为转录因子蛋白MdESE3。此外,通过Y1H点对点验证进一步确认了MdESE3可以与含有MdMa11启动子ERE的片段结合。
3. MdESE3的系统进化树、表达谱及亚细胞定位分析
MdESE3的CDS全长540bp,其上含有1个高度保守的AP2 DNA结合结构域(图3)。遗传进化分析发现它与梨的PbERF003同源性很高。对其表达谱鉴定发现它在各组织中均有表达,其中表达量最高的3个组织分别是茎、根和果实组织。通过构建MdESE3-GFP载体进行亚细胞定位检测发现其只定位在细胞核,是一个核蛋白。

图2 MdESE3的鉴定、定位、表达和系统发育分析
4. MdESE3在转基因番茄、苹果愈伤、果实及植株中的功能分析
接下来,研究者通过过表达及沉默实验,在番茄以及苹果愈伤、果实及植株中对MdESE3进行了功能验证。结果发现过表达或者沉默表达MdESE3的番茄及苹果果实、苹果愈伤、苹果植株,在形态大小上与对照组无显著差异,但是过表达MdESE3番茄中,苹果酸、柠檬酸含量均显著上升,pH显著下降。在过表达MdESE3的苹果材料中,苹果酸含量显著上升,而对应的沉默材料中苹果酸含量均显著下降(图1)。说明MdESE3参与了苹果中苹果酸的积累通路。

图3 MdESE3在AC番茄、转基因苹果愈伤组织、果实和植株中的功能分析
5. MdESE3结合MdMa11的启动子并激活其转录
在构建的转基因MdESE3材料中,研究者发现MdMa11的表达量显著升高,而MdESE3沉默的苹果材料中MdMa11的表达量显著降低。而且在对MdMa11的启动子区域分析发现,只存在1个ERE motif。研究者推测,MdESE3可以直接结合ERE motif并激活MdMa11转录,并通过GUS和LUC实验,对此推测进行了验证,并最终锁定在MdESE3可以直接结合ERE(5ʹ-TTTAAAAT-3ʹ) motif而激活MdMa11的转录。
6. MdESE3可以结合MdMDH2和MdtDT的启动子并激活其转录
在构建的转基因MdESE3材料中,研究者也检测了其他7个与苹果酸合成转运相关基因的表达量变化,结果发现在过表达的苹果果实和植株中,MdtDT,MdDTC2以及MdMDH12的表达量显著上升,在对应的沉默材料中,其表达量均显著下降,进一步分析了这3个基因的启动子区域。结果发现,只有MdMDH12和MdtDT两个的启动子中含有ERE(5ʹ-TTTAAAAT-3ʹ) motif。通过酵母单杂交(Y1H)、LUC及GUS实验对MdESE3与这两个基因的启动子结合互作进行了验证(图4)。结果证实了MdESE3能够与MdMDH12和MdtDT启动子结合并激活其转录。

图4 MdESE3与MdMDH12和MdtDT启动子结合并激活转录
研究结论

MdESE3对苹果果实中苹果酸调控的工作模型
该研究对MdESE3及MdMa11在调控苹果酸度方面进行了功能验证,并揭示了MdESE3通过结合MdMa11、MdtDT和MdMDH12基因启动子,激活其转录从而调控苹果酸积累的分子机制,为改善苹果果实品质提供了潜在的基因资源。
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做酵母单杂交筛选的时候,不确定具体用启动子的哪段序列时,可以将启动子进行分段,分别作为诱饵进行筛选。根据筛选到的阳性克隆以及启动子上的motif,推导转录因子的关键结合位点并验证。本研究通过这种方法,将调控苹果酸合成的基因启动子分为3段,分别作为诱饵筛选苹果文库库,最终找到了其上游调控转录因子 MdESE3 及其启动子上的关键结合motif ERE(5ʹ-TTTAAAAT-3ʹ)。
西北农林科技大学园艺学院在读博士研究生郑丽桐,已毕业硕士马文芳为共同第一作者,西北农林科技大学作物抗逆与高效生产全国重点实验室/园艺学院李明军教授与马百全副教授为论文通讯作者。马锋旺教授、博士后祝令成、魏晓钰参与了相关研究工作。园艺科学研究中心张静、袁阳阳和曹文静等老师对本研究提供了技术支持。该研究得到了国家自然科学基金,国家重点研发计划、中国博士后科学基金等项目支持。
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