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        不同GPL的GEO测序数据集可以合并吗?

        相关实验:生物信息学数据库和软件的搜索实验

        user-title

        Nikitaal

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        4 个回答

        user-title

        kingh39

        有帮助

        可以合并,但是要消除批次效应,也可以在差异分析后取差异基因的交集。

        user-title

        juyue2010

        有帮助

        不能直接合并,需要做归一化处理后才能比较

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        一般来说我不建议合并,误差太大。

        user-title

        Dr_劉医生

        有帮助

        就算去batch,原则上不同的GPL平台的数据是不能合并的,即使都是GEO数据库

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